[发明专利]一种用于检测的组合物及检测方法在审

专利信息
申请号: 201811237061.4 申请日: 2018-10-23
公开(公告)号: CN109402232A 公开(公告)日: 2019-03-01
发明(设计)人: 许文涛;罗云波;牛晨启;黄昆仑;徐瑗聪;杜再慧;贺晓云 申请(专利权)人: 中国农业大学
主分类号: C12Q1/6858 分类号: C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 100083 北京市海淀*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 检测 探针连接产物 荧光探针序列 多重PCR反应 可视化检测 特异性检测 转基因大豆 转基因玉米 定量检测 内参基因 探针序列 特异基因 荧光探针 准确定量 灵敏度 假阳性 转基因 研发 填充 成功
【权利要求书】:

1.一种组合物,其特征在于,所述组合物至少包括下述1)和2)所述的核酸序列:

1)从5′→3′的连接方向,依次包括:5′端通用引物序列、与荧光探针的核苷酸序列一致的核苷酸序列、与部分和/或全部靶核苷酸序列的碱基互补结合的核苷酸序列;

2)从5′→3′的连接方向,依次包括:与部分和/或全部靶核苷酸序列的碱基互补结合的核苷酸序列、3′端通用引物序列;且核酸序列的5′端的第一个核苷酸经过磷酸化修饰。

2.根据权利要求1所述的组合物,其特征在于,所述组合物还包括下述1)-8)中的至少一种:

1)荧光探针;

2)连接酶;

3)连接酶反应缓冲液;

4)实时荧光定量PCR反应缓冲液;

5)实时荧光定量PCR反应的引物对,其中,一条引物的核苷酸序列与权利要求1所述5′端通用引物序列的核苷酸序列一致,另一条引物的核苷酸序列与权利要求1所述3′端通用引物序列的核苷酸序列反向互补;

6)dNTP;

7)所述5′端通用引物序列包括序列表中的SEQ ID №:15所示的核苷酸序列;和/或将序列表中SEQ ID №:15所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:15所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列;

8)所述3′端通用引物序列序列包括序列表中的SEQ ID №:16所示的核苷酸序列;和/或将序列表中SEQ ID №:16所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:16所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列。

3.根据权利要求2所述的组合物,其特征在于,所述组合物还包括下述1)-13)中的至少一种:

1)序列表中SEQ ID №:5所示的核苷酸序列;和/或将序列表中SEQ ID №:5所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:5所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列;

2)序列表中SEQ ID №:6所示的核苷酸序列,且序列的5′端的第一个核苷酸经过磷酸化修饰;和/或将序列表中SEQ ID №:6所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:6所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列,且序列的5′端的第一个核苷酸经过磷酸化修饰;

3)序列表中SEQ ID №:7所示的核苷酸序列;和/或将序列表中SEQ ID№:7所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:7所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列;

4)序列表中SEQ ID №:8所示的核苷酸序列,且序列的5′端的第一个核苷酸经过磷酸化修饰;和/或将序列表中SEQ ID №:8所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:8所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列,且序列的5′端的第一个核苷酸经过磷酸化修饰;

5)序列表中SEQ ID №:9所示的核苷酸序列;和/或将序列表中SEQ ID №:9所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:9所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列;

6)序列表中SEQ ID №:10所示的核苷酸序列,且序列的5′端的第一个核苷酸经过磷酸化修饰;和/或将序列表中SEQ ID №:10所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:10所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列,且序列的5′端的第一个核苷酸经过磷酸化修饰;

7)序列表中SEQ ID №:11所示的核苷酸序列;和/或将序列表中SEQ ID №:11所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:11所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列;

8)序列表中SEQ ID №:12所示的核苷酸序列,且序列的5′端的第一个核苷酸经过磷酸化修饰;和/或将序列表中SEQ ID №:12所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:12所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列,且序列的5′端的第一个核苷酸经过磷酸化修饰;

9)当所述组合物还包括荧光探针时,所述荧光探针的核苷酸序列为序列表中SEQ ID№:13所示的核苷酸序列;和/或将序列表中SEQ ID №:13所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:13所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列;

10)当所述组合物还包括荧光探针时,所述荧光探针的核苷酸序列为序列表中SEQ ID№:14所示的核苷酸序列;和/或将序列表中SEQ ID №:14所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:14所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列;

11)当所述组合物还包括荧光探针时,所述荧光探针的5′端标记了荧光基团VIC,3′端标记了荧光淬灭基团BHQ1;

12)当所述组合物还包括荧光探针时,所述荧光探针的5′端标记了荧光基团FAM,3′端标记了荧光淬灭基团BHQ1;

13)当所述组合物还包括实时荧光定量PCR反应的引物对时,所述实时荧光定量PCR反应的一条引物的核苷酸序列为序列表中SEQ ID №:15所示的核苷酸序列;和/或将序列表中SEQ ID №:15所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:15所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列;所述实时荧光定量PCR反应的另一条引物的核苷酸序列为序列表中SEQ ID №:17所示的核苷酸序列;和/或将序列表中SEQ ID №:17所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:17所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列。

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