[发明专利]一种用于检测的组合物及检测方法在审
申请号: | 201811237061.4 | 申请日: | 2018-10-23 |
公开(公告)号: | CN109402232A | 公开(公告)日: | 2019-03-01 |
发明(设计)人: | 许文涛;罗云波;牛晨启;黄昆仑;徐瑗聪;杜再慧;贺晓云 | 申请(专利权)人: | 中国农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 100083 北京市海淀*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 探针连接产物 荧光探针序列 多重PCR反应 可视化检测 特异性检测 转基因大豆 转基因玉米 定量检测 内参基因 探针序列 特异基因 荧光探针 准确定量 灵敏度 假阳性 转基因 研发 填充 成功 | ||
1.一种组合物,其特征在于,所述组合物至少包括下述1)和2)所述的核酸序列:
1)从5′→3′的连接方向,依次包括:5′端通用引物序列、与荧光探针的核苷酸序列一致的核苷酸序列、与部分和/或全部靶核苷酸序列的碱基互补结合的核苷酸序列;
2)从5′→3′的连接方向,依次包括:与部分和/或全部靶核苷酸序列的碱基互补结合的核苷酸序列、3′端通用引物序列;且核酸序列的5′端的第一个核苷酸经过磷酸化修饰。
2.根据权利要求1所述的组合物,其特征在于,所述组合物还包括下述1)-8)中的至少一种:
1)荧光探针;
2)连接酶;
3)连接酶反应缓冲液;
4)实时荧光定量PCR反应缓冲液;
5)实时荧光定量PCR反应的引物对,其中,一条引物的核苷酸序列与权利要求1所述5′端通用引物序列的核苷酸序列一致,另一条引物的核苷酸序列与权利要求1所述3′端通用引物序列的核苷酸序列反向互补;
6)dNTP;
7)所述5′端通用引物序列包括序列表中的SEQ ID №:15所示的核苷酸序列;和/或将序列表中SEQ ID №:15所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:15所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列;
8)所述3′端通用引物序列序列包括序列表中的SEQ ID №:16所示的核苷酸序列;和/或将序列表中SEQ ID №:16所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:16所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列。
3.根据权利要求2所述的组合物,其特征在于,所述组合物还包括下述1)-13)中的至少一种:
1)序列表中SEQ ID №:5所示的核苷酸序列;和/或将序列表中SEQ ID №:5所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:5所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列;
2)序列表中SEQ ID №:6所示的核苷酸序列,且序列的5′端的第一个核苷酸经过磷酸化修饰;和/或将序列表中SEQ ID №:6所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:6所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列,且序列的5′端的第一个核苷酸经过磷酸化修饰;
3)序列表中SEQ ID №:7所示的核苷酸序列;和/或将序列表中SEQ ID№:7所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:7所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列;
4)序列表中SEQ ID №:8所示的核苷酸序列,且序列的5′端的第一个核苷酸经过磷酸化修饰;和/或将序列表中SEQ ID №:8所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:8所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列,且序列的5′端的第一个核苷酸经过磷酸化修饰;
5)序列表中SEQ ID №:9所示的核苷酸序列;和/或将序列表中SEQ ID №:9所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:9所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列;
6)序列表中SEQ ID №:10所示的核苷酸序列,且序列的5′端的第一个核苷酸经过磷酸化修饰;和/或将序列表中SEQ ID №:10所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:10所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列,且序列的5′端的第一个核苷酸经过磷酸化修饰;
7)序列表中SEQ ID №:11所示的核苷酸序列;和/或将序列表中SEQ ID №:11所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:11所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列;
8)序列表中SEQ ID №:12所示的核苷酸序列,且序列的5′端的第一个核苷酸经过磷酸化修饰;和/或将序列表中SEQ ID №:12所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:12所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列,且序列的5′端的第一个核苷酸经过磷酸化修饰;
9)当所述组合物还包括荧光探针时,所述荧光探针的核苷酸序列为序列表中SEQ ID№:13所示的核苷酸序列;和/或将序列表中SEQ ID №:13所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:13所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列;
10)当所述组合物还包括荧光探针时,所述荧光探针的核苷酸序列为序列表中SEQ ID№:14所示的核苷酸序列;和/或将序列表中SEQ ID №:14所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:14所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列;
11)当所述组合物还包括荧光探针时,所述荧光探针的5′端标记了荧光基团VIC,3′端标记了荧光淬灭基团BHQ1;
12)当所述组合物还包括荧光探针时,所述荧光探针的5′端标记了荧光基团FAM,3′端标记了荧光淬灭基团BHQ1;
13)当所述组合物还包括实时荧光定量PCR反应的引物对时,所述实时荧光定量PCR反应的一条引物的核苷酸序列为序列表中SEQ ID №:15所示的核苷酸序列;和/或将序列表中SEQ ID №:15所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:15所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列;所述实时荧光定量PCR反应的另一条引物的核苷酸序列为序列表中SEQ ID №:17所示的核苷酸序列;和/或将序列表中SEQ ID №:17所示核苷酸序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列表中SEQ ID №:17所示核苷酸序列具有相同功能的核苷酸序列。
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