[发明专利]一种基于卷积神经网络的三维肺结节识别方法有效
申请号: | 201811243707.X | 申请日: | 2018-10-24 |
公开(公告)号: | CN109544510B | 公开(公告)日: | 2021-10-26 |
发明(设计)人: | 黄文恺;彭广龙;胡凌恺;薛义豪;倪皓舟;何杰贤;朱静;吴羽 | 申请(专利权)人: | 广州大学 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06N3/04;G06N3/08 |
代理公司: | 广州市华学知识产权代理有限公司 44245 | 代理人: | 裘晖;林梅繁 |
地址: | 510006 广东省广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 卷积 神经网络 三维 结节 识别 方法 | ||
1.一种基于卷积神经网络的三维肺结节识别方法,其特征在于,包括步骤:
S1、肺部三维CT图像数据集预处理,将预处理后的CT图像数据集分成训练数据集和测试数据集;
S2、建立DenseNet和Squeeze-and-Excitation Net相结合的神经网络模型;
S3、设置由S2得到的神经网络模型的超参数:批量大小、dropout层的超参数、每层输出的特征图数量、训练总时期、学习率以及SE block中全连接层的超参数;
S4、将训练数据集导入由S3设置好的神经网络模型中,采用随机梯度下降算法和学习率逐步递减的训练方式进行训练,待模型充分收敛之后,保存并导出模型结构和权重参数,得到训练好的神经网络模型;
神经网络模型计算三次反向传播算法,三次反向传播算法分别计算关于肺结节的位置x、y、z的参数更新值;采用GPU并行处理模式中的同步模式,在同步模式下所有GPU同时读取参数的取值,并且当反向传播算法完成之后同步更新参数的取值,当所有设备完成反向传播算法的计算之后,计算出不同GPU上参数梯度的平均值,最后再根据平均值对参数进行更新;
S5、用训练好的神经网络模型对测试数据集中每组三维CT图像进行测试,得到每组三维CT图像中的肺结节识别结果;
步骤S2所述的DenseNet和Squeeze-and-Excitation Net相结合的神经网络模型在DenseNet的基础上保留bottleneck layer结构,去除transition layer结构,添加SEblock结构,将SE block嵌入到DenseNet当中;Squeeze-and-Excitation Net为每个特征通道生成权重,衡量每个特征通道的重要性;每个SE block结构串接在相邻两个bottlenecklayer结构之间;每个bottleneck layer结构的输出为后续所有bottleneck layer结构的输入;所建立的神经网络模型还包括依次连接的Drop out层、全连接层和Softmax层,最后一个bottleneck layer结构的输出端与Drop out层连接;
DenseNet网络结构由dense block组成,DenseNet每层以之前层的输出为输入,denseblock中每一层的输入都是来自于前面所有层的输出;在dense block中,每次经过bottleneck layer之后进行通道上的连接,最后再嵌入SE block,实现在进行连接之前所有层的通道之后再对每个通道添加权重。
2.根据权利要求1所述的三维肺结节识别方法,其特征在于,每个bottleneck layer结构均包括第一部分和第二部分,每部分均包括BN层、relu层和三维卷积层;第一部分的三维卷积层的步长为1、卷积核是1*1*1;第二部分的三维卷积层的步长为1、卷积核是3*3*3。
3.根据权利要求1所述的三维肺结节识别方法,其特征在于,SE block结构包括依次连接的全局平均池化层、全连接层、Relu激活函数、全连接层及Sigmoid激活函数。
4.根据权利要求1所述的三维肺结节识别方法,其特征在于,步骤S1包括:
1)对原始肺部三维CT图像进行图像预处理,包括:读取原始数据集的CT图像数据,对其进行肺分割并统一图像大小;读取结点标注信息csv文件,对图像进行贴标签的操作;通过阈值调整与轮廓提取算法进行肺分割操作;以结节为中心进行提取,如果结节的坐标位于图像的边缘位置,则对其进行零填充;
2)将预处理后的图像数据集分成训练数据集和测试数据集。
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