[发明专利]制备带有单链和双链分子标签的新一代测序接头的方法

说明书

本发明提供一种制备带有单链和双链分子标签的新一代测序接头的方法，其特征在于，包括：步骤一：合成接头序列，接头序列包含第一序列和第二序列，其中，所述第二序列包括：限制性内切酶的保护碱基和19个随机碱基的双链分子标签，第一序列和第二序列中具有互补的序列片段，步骤二：接头序列退火，混匀第一序列和第二序列，在退火体系中按退火程序退火形成双链，步骤三：补齐步骤二中所形成的双链的接头，步骤四：酶切并回收接头。本发明的制备带有单链和双链分子标签的新一代测序接头的方法，能够制备携带有样本标签、单链分子标签和双链分子标签的接头。接头中含有更长的双链分子标签，为生息分析提供更好的信息基础；适用于多种测序平台。

技术领域

本发明涉及一种制备带有单链和双链分子标签的新一代测序接头的方法，属于分子生物学领域。

背景技术

在Illumina测序平台中，接头是二代测序建库中必要的元素，目前官方的接头包含多种类型，序列中包含了p5与p7扩增引物结合序列、read1和read2测序引物结合序列、样本标签序列、分子标签序列等，并且带有用于A/T连接的3’-dT尾。

目前常于p7端设计单链分子标签用于给建库中的目标分子添加标签，使生信分析过程可以捕获到更精细的分子信息，降低变异分析的背景噪音。

另外，也可以通过双链分子标签，结合单链分子标签，通过生信将变异分析的背景噪音降得更低，使测序分析结果更加精准可靠。

但是，目前没有较好的双链标签添加方法方便于文库构建。

发明内容

本发明的目的在于提供一种制备带有单链和双链分子标签的新一代测序接头的方法，以解决上述的问题。

本发明采用了如下技术方案：

一种制备带有单链和双链分子标签的新一代测序接头的方法，其特征在于，包括：

步骤一：合成接头序列，接头序列包含第一序列和第二序列，

其中，所述第二序列包括：限制性内切酶的保护碱基和19个随机碱基的双链分子标签，第一序列和第二序列中具有互补的序列片段，

步骤二：接头序列退火，混匀第一序列和第二序列，在退火体系中按退火程序退火形成双链，

步骤三：补齐步骤二中所形成的双链的接头，

步骤四：酶切并回收接头。

进一步,本发明的制备带有单链和双链分子标签的新一代测序接头的方法，还具有这样的特征：

其中，所述第二序列中还具有随机碱基的单链分子标签。

进一步,本发明的制备带有单链和双链分子标签的新一代测序接头的方法，还具有这样的特征：其中，所述第二序列中还具有样本标签。

进一步,本发明的制备带有单链和双链分子标签的新一代测序接头的方法，还具有这样的特征：步骤三中，采用T4DNA聚合酶延伸补平步骤二中的退火产物。

进一步,本发明的制备带有单链和双链分子标签的新一代测序接头的方法，还具有这样的特征：步骤四中，采用限制性内切酶NmeAIII酶切步骤三中的延伸产物，然后去除50bp以内的残余双链小片段，保留接头。

进一步,本发明的制备带有单链和双链分子标签的新一代测序接头的方法，还具有这样的特征：第一序列的序列如下：

5-A*A*TGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGAC-GCTCTTCCGAT*C*T-3。

进一步,本发明的制备带有单链和双链分子标签的新一代测序接头的方法，还具有这样的特征：第二序列的序列如下：