[发明专利]检测分枝杆菌的方法及其套组

说明书

提供一种检测分枝杆菌的方法，包含下列步骤：提供样本；提供引子对，其是选自于由SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、与SEQ ID NO:1具约45％至约99％相似度的序列、与SEQ ID NO:2具约60％至约99％相似度的序列、SEQ ID NO:1的互补链以及SEQ ID NO:2的互补链所组成的群；提供探针，其是选自于由SEQ ID NO:3、与SEQ ID NO:3具约70％至约99％相似度的序列及SEQ ID NO:3的互补链所组成的群；利用引子对、探针与样本进行聚合酶连锁反应以获得产物；以及分析产物以检测分枝杆菌的存在。还提供一种检测分枝杆菌的套组，包含前述引子对与探针。

技术领域

本发明是关于一种检测方法及其套组，特别是一种检测分枝杆菌的方法及其套组。

背景技术

分枝杆菌可分为结核分枝杆菌群(Mycobacterium tuberculosis complex,MTBC)和非结核分枝杆菌群。结核病的一些致病原是属于结核分枝杆菌群(MTBC)的细菌，例如M.africanum、M.bovis、M.caprae、M.canettii、M.microti、M.pinnipedii以及M.tuberculosis。这些致病原会造成人类或动物的结核病，其中又以M.africanum、M.bovis以及M.tuberculosis为临床上人类肺结核病的主要菌种。

结核病可发生在任何器官或组织，例如肺脏、淋巴结、脑膜、胸膜、肾脏、骨骼、皮肤、消化道及泌尿生殖道等等。若在早期给予适当的抗结核药物治疗，结核病几乎可以百分之百痊愈。但若没有在早期时予以治疗，在三年内约有一半的致死率。所以目前极需一种检测方法能够在临床上早期检测出是否受到结核分枝杆菌群的病原的感染，其对于疾病治愈率的提升非常重要。

发明内容

本发明的一实施例为一种检测分枝杆菌的方法，包含下列步骤：提供一样本；提供一引子对，引子对选自于由SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、与SEQ ID NO:1具约45％至约99％相似度的序列、与SEQ ID NO:2具约60％至约99％相似度的序列、SEQ ID NO:1的互补链以及SEQ ID NO:2的互补链所组成的群；提供一探针，探针选自于由SEQ ID NO:3、与SEQ IDNO:3具约70％至约99％相似度的序列及SEQ ID NO:3的互补链所组成的群。利用引子对、探针与样本进行聚合酶连锁反应(Polymerase chain reaction,PCR)以获得产物。最后，分析产物以检测分枝杆菌的存在。

根据本发明的一些实施方式，步骤「提供样本」包含：提供检体包含结核分枝杆菌群(Mycobacterium tuberculosis complex,MTBC)。

根据本发明的一些实施方式，检体为血液、痰液、支气管肺泡冲洗液、尿液、粪便或其组合。

根据本发明的一些实施方式，利用引子对、探针与样本进行聚合酶连锁反应以获得产物步骤，包含进行聚合酶连锁反应使得引子对增幅结核分枝杆菌群中IS6110序列的部分序列以获得产物，其中此部分序列为SEQ ID NO:4。

根据本发明的一些实施方式，利用引子对、探针与样本进行聚合酶连锁反应以获得产物步骤，聚合酶连锁反应为实时定量聚合酶连锁反应(Real-time polymerase chainreaction，real-time PCR)。

本发明的另一实施例为一种检测分枝杆菌的套组，包含引子对与探针。上述引子对选自于由SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、与SEQ ID NO:1具约45％至约99％相似度的序列、与SEQ ID NO:2具约60％至约99％相似度的序列、SEQ ID NO:1的互补链以及SEQ ID NO:2的互补链所组成的群。探针选自于由SEQ ID NO:3、与SEQ ID NO:3具约70％至约99％相似度的序列及SEQ ID NO:3的互补链所组成的群。