[发明专利]通过引物组合物用于进行缬沙坦个体化用药指导的方法在审
申请号: | 201811255370.4 | 申请日: | 2018-10-26 |
公开(公告)号: | CN111100921A | 公开(公告)日: | 2020-05-05 |
发明(设计)人: | 马庆伟;钟逾;刘昕超 | 申请(专利权)人: | 北京毅新博创生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 通过 引物 组合 用于 进行 缬沙坦 个体化 用药 指导 方法 | ||
1.一种通过如下所述的引物组合物,用于进行降高血压药物缬沙坦个体化用药指导的方法,该引物组合包括针对能判别用药型的3个SNP标记的PCR引物对和延伸引物,其中,PCR引物序列对选自如SEQ ID NO:1a-3a所示的序列,延伸引物序列选自如SEQ ID NO:1b-3b所示的序列。
2.权利要求1的方法,其中该引物组合物分为2个独立进行的多重PCR反应引物组合物,并且所述序列如下所示:
。
3.权利要求2所述的方法,其中各位点对应的延伸引物及延伸产物分子量如下所示:
。
4.权利要求3所述的方法,其中上述PCR引物序列为核心序列,其在5'端可包括5-15个保护碱基序列,优选为10bp的tag:ACGTTGGATG。
5.权利要求3所述的方法,其中延伸引物5'端可增加作为接头的碱基序列,优选接头碱基序列为1-15个碱基。
6.权利要求5所述的方法,其中接头碱基序列为1-3个碱基。
7.权利要求1-6任一所述的方法,其中包括以下步骤:
(1)多重PCR:使用上述PCR引物对,在两个反应体系中,对上述3个SNP位点所在DNA区域同时进行扩增,得到含3处多态位点所在DNA区域的PCR产物;
(2)PCR产物纯化:对步骤(1)得到的PCR产物进行纯化,以减少对后续反应的干扰;
(3)单碱基延伸:使用上述3条特异性的延伸引物,在两个反应体系中,对步骤(2)得到的纯化后PCR产物进行多重单碱基延伸,延伸引物在对应的SNP位点处延伸一个核苷酸,该核苷酸与SNP位点处的基因型互补配对;
(4)延伸产物纯化:对步骤(3)得到的延伸产物进行纯化,以获得高纯的延伸产物,避免盐离子等杂质对后续检测的影响;
(5)质谱仪检测:将步骤(4)得到的纯化产物点在含有基质的靶片上,放入质谱仪进行检测。
8.权利要求7的方法,其中步骤2的纯化过程可以选自碱性磷酸酶消化、碱性磷酸酶和外切酶ExoI消化、切胶纯化、PCR纯化柱过柱。
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