[发明专利]CT-RCC HERV-E来源的CTL表位肽、肽库及其应用

说明书

本发明涉及CT‑RCC HERV‑E来源的CTL表位肽、肽库及其应用，包括SEQ ID No.1至16氨基序列的CT‑RCC HERV‑E来源的CTL表位肽，肽库，包含两种以上上述氨基序列的肽，上述CT‑RCC HERV‑E来源的CTL表位肽可以应用于制备肾透明细胞癌疫苗，在肾透明细胞癌的免疫治疗方面有巨大的潜在价值。

技术领域

本发明涉及CT-RCC HERV-E来源的CTL表位肽、肽库及其应用。

背景技术

HERV(Human endogenous retroviruses)是基因组中的内源性病毒组分，和逆转录病毒高度相似，并可由逆转录病毒产生，是外源逆转录病毒偶然入侵生殖细胞的后代，HERV序列占据了人类基因组大概30亿碱基对中的8%。最初始形态的HERV末端有两个唯一的3’LTR和5’LTR，中间有gag、pol、env基因。

HERV-E(Human endogenous retrovirus group E)序列稳定整合在人类基因组上，以孟德尔遗传方式传播，可以替代启动子或增强子的转录活性。HERV-E序列可以修饰临近基因表达，产生逆转录病毒蛋白，这包括免疫抑制env多肽，反过来又诱导自身抗体的产生。

人类基因组中有超过50种HERV-E序列被发现，绝大多数HERV-E以单独的LTR序列散布在基因组中，HERV-E的前病毒gag、pol、env基因和/或3’LTR缺失。

20世纪90年代到21世纪初的一段时间，美国国立卫生院Richard W. Childs团队在对晚期肾癌GVT(graft-versus-tumor)的研究过程中发现了一种在肾透明细胞癌中选择性表达的LTR2C类HERV-E序列，命名为CT-RCC。CT-RCC HERV-E序列全长定位于6号染色体6q15基因座，现已知拥有三个转录本CT-RCC-8(EU137846)、CT-RCC-9(EU137847)和CT-RCC-Env(JQ733905)，在肾透明细胞癌中选择性表达，研究表明临床上有约80%的肾透明细胞癌组织中特异性表达CT-RCCHERV-E，属于典型的肿瘤特异性抗原。目前，对于CT-RCCHERV-E的研究发现该基因存在的三个转录本编码一段共有序列(CR)，从中发现了具有高免疫原性的十肽CT-RCC-1，而CT-RCC-Env转录本编码包膜蛋白膜上和跨膜组件，亦能诱发人体免疫。综上所述，CT-RCCHERV-E具有开发靶向肾透明细胞癌特异性免疫治疗的潜能。

本发明依据美国UMDP数据库99672份中国人群样本HLA分型，选择中国人群高频表达HLA类型：HLA-A*1101(27.5%)，HLA-A*2402(15.2%)，HLA-A*0201(9.5%)，HLA-B*4001(15.4%)，HLA-B*4601(13.4%)。使用IEDB或NetMHCcons软件分析预测CT-RCCHERC-E的MHCⅠBinding表位肽，合成表位肽。同时募集健康人群志愿者进行HLA分型，筛选相应HLA类型志愿者，每个目标HLA类型入选3-4人。健康志愿者外周血单核细胞体外诱导树突状细胞(dendritic cell，DC)负载合成表位肽，和自体PBMC或T细胞共培养活化T细胞，经IFNγELISPOT检测筛选阳性CTL表位肽。所筛选阳性CTL表位肽利用LDH释放和PDX模型的抑瘤试验进一步验证，优化建立源于CT-RCC HERV-E同时适于中国人群高频HLA的通用CTL表位肽库，并开发表位肽库在肾透明细胞癌治疗药物中的应用。

发明内容

本发明目的在于提供一组源于CT-RCC HERV-E同时适于中国人群高频HLA的通用CTL表位肽。

为了实现上述目的本发明包括SEQ ID No.1至16任一氨基序列的CT-RCC HERV-E来源的CTL表位肽。

本发明还涉及上述CT-RCC HERV-E 来源的CTL表位肽在制备肾透明细胞癌疫苗中的应用。