[发明专利]进行脊尾白虾家系鉴定的微卫星标记组合及应用

说明书

本发明公开了用于脊尾白虾家系鉴定的微卫星标记组合以及应用方法，属于遗传育种中的分子辅助育种领域。其步骤包括(1)从基因组筛选微卫星位点，设计引物，通过扩增选择8个等位基因数目较多，多态性较高的微卫星；(2)通过微卫星分型获得微卫星数据信息，进而实现对候选母本和子代的鉴定。本发明利用脊尾白虾高度多态的8个微卫星位点进行家系鉴定，效率高，结果准确可靠，弥补了当前脊尾白虾育种中系谱记录困难的问题，可以有效提高良种选育效果。

技术领域

本发明属于遗传育种的分子辅助育种技术，具体的说是用于脊尾白虾快速、高效进行家系鉴定的微卫星标记组合和应用。

背景技术

脊尾白虾又名小白虾，绒虾，迎春虾，属节肢动物门、甲壳纲、十足目、长臂虾科，广布于整个中国大陆沿岸和朝鲜半岛西岸的浅海水域，以黄渤海产量最高。它具有繁殖能力强、生长速度快和环境适应性广等优点，是我国重要的小型经济虾。此外，脊尾白虾肉质细嫩，味道鲜美，可鲜食也可加工成虾米，因虾米呈金黄色，故也有“金钩虾米”之称。近年来，随着沿海滩涂的开发，养殖面积迅速扩大，目前脊尾白虾已成为虾蟹混养和虾贝混养的重要品种。

由于脊尾白虾的养殖种苗主要来源于海区纳苗或者池塘养殖后留种用于下年度养殖，没有经过人工选育，尚无良种可言。而且近年来由于环境污染和过度捕捞，野生脊尾白虾资源受到一定的影响。随着养殖规模的不断扩大，缺乏稳定的苗种供应，良种匮乏等问题，严重制约了产业的可持续发展。面对种质资源限制养殖业发展的情况，脊尾白虾良种选育工作引起了广泛重视。

家系选育是获得优良品种的重要手段。在这个过程中，了解完整、准确的系谱信息可以有效指导亲本选育，增强遗传多样性，从而避免近交衰退现象。传统的虾类选择育种，是将不同的家系养在不同的养殖池中以维持家系信息。由于不同养殖池间的环境因子存在差异，这可能会导致育种相关的遗传参数估计产生偏差，不利于育种计划的制定。在混合养殖群体中，是通过物理标记荧光染料等保持家系信息，但存在操作繁琐、易损伤虾体、标记在体内移动及不易于在仔虾上进行标记等缺点。

随着科学技术的发展，分子标记的出现使得混养亲缘关系的鉴定成为可能，以微卫星分型为基础的亲子鉴定技术是目前水产动物系谱确认中应用最广泛最可靠的手段之一。微卫星又称简单重复序列，由于其具有分布广、多态性高、稳定性强、共显性等遗传特点，在为水产动物选育中保持家系信息、确认亲缘关系、追踪系谱提供了有用的工具。目前已在草鱼、牡蛎、文蛤和凡纳滨对虾等水产动物中证实了微卫星在家系鉴定中的可行性和应用价值。然而，将微卫星标记应用于脊尾白虾家系鉴定的报道较少。因此，发挥微卫星标记在脊尾白虾家系鉴定中的优势，对于保护及合理开发利用脊尾白虾资源具有重要的意义。

发明内容

本发明的目的在于提供快速高效进行脊尾白虾家系鉴定的微卫星标记组合，该标记等位基因数目多，多态性高，可以用来实现脊尾白虾家系的快速鉴定，也可以应用于种质管理、家系管理和评价增殖放流效果等领域。

为实现以上目的，本发明采用的方案为：

快速高效进行脊尾白虾家系鉴定的微卫星标记组合及应用，具体包括筛选多态性高的微卫星位点，设计引物，合成带有荧光标记的引物，建立微卫星扩增体系，保证扩增体系的稳定性和目的条带准确性,通过Cervus软件读取微卫星分型数据进行家系鉴定。