[发明专利]一种基于基因组学以及生物信息学的在线交互云平台有效

专利信息
申请号: 201811293911.2 申请日: 2018-11-01
公开(公告)号: CN109582292B 公开(公告)日: 2022-02-18
发明(设计)人: 夏昊强;周煌凯;陆才瑞;高川;张羽;陶勇;罗玥;阮碧波 申请(专利权)人: 广州基迪奥生物科技有限公司
主分类号: G06F8/20 分类号: G06F8/20;G06Q50/20
代理公司: 广州三环专利商标代理有限公司 44202 代理人: 颜希文;宋静娜
地址: 510000 广东省广州市广州国*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 基因组 以及 生物 信息学 在线 交互 平台
【说明书】:

发明公开了一种基于基因组学及生物信息学的在线交互云平台,包括:云分析平台,用于获取生物信息数据,并提供对生物信息数据的自动分析,输出分析结果;在线教育平台,用于提供用户生物信息分析相关的教育视频课程以及远程教学服务;知识分享论坛,用于通过多个分区以提供用户对生物信息分析相关知识的分享,本发明可提供用户对生物信息数据的自动分析,并通过在线教育以及知识分享,方便用户获得前沿知识技能,极大提高生物科学研究领域对基因组学技术的应用能力。

技术领域

本发明涉及生物信息分析技术领域,特别是涉及一种基于基因组学以及生物信息学的在线交互云平台。

背景技术

基因测序目前全球市场规模约有200亿美元,高通量测序技术已成为生命科学研究重要工具,对该技术的应用水准直接影响一个国家的生物技术发展水平。数据的检测与挖掘是组学研究的两个核心内容。随着测序技术的进步与发展,数据检测手段不断丰富的同时,其检测的准确性也大大提高。数据的大量形成与累积,带来的下一个烦恼就是数据的挖掘。目前,高通量测序技术产生的数据总量已达EB级,因此如何利用生物信息技术从海量数据中挖掘有价值的核心信息,数据展示便于实时解析和关键报告数据挖掘,已成为该领域科研人员的核心难题。

在生物信息分析平台方面,比较著名的国内外平台包括:国外的Galaxy生物信息分析平台、华大基因的BGI online平台。这些平台功能强大,适合专业生物信息用户,但对没有任何生物信息基础的用户使用尚有难度。另外,虽然国内外也有一系列优秀的生物信息交流论坛,例如国外的SEQanswers、BioStar,以及国内的“生物信息学天空”等。但这些技术论坛主要提供技术交流讨论的平台,而没有同步提供系统在线教育以及生物信息分析功能。

总之,目前在国内外暂没有同时满足理论教育、综合实操和用户互助的生物信息学公共服务平台,因此,若能够提供一种可解决上述问题的在线交互平台,方便用户获得前沿知识技能,提高生物科学研究领域对基因组学技术的应用能力,将会有巨大的行业需求。

发明内容

为克服上述现有技术存在的不足,本发明之目的在于提供一种基于基因组学以及生物信息学的在线交互云平台,以提供用户对生物信息数据的自动分析,并通过在线教育以及知识分享,方便用户获得前沿知识技能,极大提高生物科学研究领域对基因组学技术的应用能力。

为达上述及目的,本发明提出一种基于基因组学及生物信息学的在线交互云平台,包括:

云分析平台,用于获取生物信息数据,并提供对生物信息数据的自动分析,输出分析结果;

在线教育平台,用于提供用户生物信息分析相关的教育视频课程以及远程教学服务;

知识分享论坛,用于通过多个分区以提供用户对生物信息分析相关知识的分享。

优选地,所述云分析平台的自动分析功能模块包括

动态交互分析模块,用于利用统计检验寻找富集GO功能,并通过图表交互形式对结果进行动态分析;

序列处理模块,用于对原始序列和目标序列来进行比对,并输出比对结果;

基础绘图模块,用于将表格数据绘制成图形;

功能分析模块,用于应用超几何检验,找出与整个基因组背景相比,在差异表达基因中显著富集的GO条目;

统计检验模块,用于对两组样本进行两组样本的差异分析;

格式转换模块,用于将当前格式的数据转换成其它常用格式;

数据关系分析模块,用于根据两组样品间的差异基因绘制相应图形,以可视化展示结果;

表格处理模块,用于将多个表格合并成一个表格;

排序分析模块,用于将多个变量通过线性变换,筛选出数个比较重要的变量。

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