[发明专利]一种检测白纹伊蚊抗药性基因突变的引物、探针及方法有效

专利信息
申请号: 201811296130.9 申请日: 2018-11-01
公开(公告)号: CN109234408B 公开(公告)日: 2021-08-20
发明(设计)人: 周冬根 申请(专利权)人: 宁波国际旅行卫生保健中心
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 北京知汇林知识产权代理事务所(普通合伙) 11794 代理人: 董涛
地址: 315012 浙*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 一种 检测 白纹伊蚊 抗药性 基因突变 引物 探针 方法
【权利要求书】:

1.一种检测白纹伊蚊抗药性基因突变的专用引物对和探针,所述引物对由F和R组成,其特征在于,所述F的核苷酸序列如序列表中SEQ ID №:1所示,所述R的核苷酸序列如序列表中SEQ ID №:2所示;

所述探针包括:

1)探针P1的苷酸序列如序列表中SEQ ID №:3所示核;

2)探针P2的核苷酸序列如序列表中SEQ ID №:4所示;

3)探针P3的核苷酸序列如序列表中SEQ ID №:5所示。

2.根据权利要求1所述的专用引物对和探针,其特征在于,

探针P1为将3’末端增加MGB基团、5’端标记FAM发光基团后制备得到;

探针P2为将3’末端增加MGB基团、5’端标记FAM发光基团后制备得到;

探针P3为将3’末端增加MGB基团、5’端标记VIC发光基团后制备得到。

3.一种检测白纹伊蚊抗药性基因突变的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1或2所述的专用引物对和探针。

4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:

1)试剂A,所述试剂A包括权利要求2所述的专用引物对探针P2和探针P3;

2)试剂B,所述试剂B包括权利要求2所述的专用引物对探针P1和探针P3;

3)TaqMan反应缓冲液。

5.一种检测或辅助检测白纹伊蚊中kdr基因的突变位点的方法,其特征在于,所述方法包括使用权利要求1或2所述的专用引物对和探针或权利要求3或4所述的试剂盒进行检测。

6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述方法包括:

使用权利要求4所述的试剂A对待测白纹伊蚊进行TaqMan PCR扩增反应,得到A反应产物;

使用权利要求4所述的试剂B对待测白纹伊蚊进行TaqMan PCR扩增反应,得到B反应产物;

检测A反应产物和B反应产物:

若A反应产物在FAM和VIC通道均无信号,且B反应产物仅在FAM通道有信号,则所述kdr基因不含或候选不含有所述突变位点,突变位点所在位置的碱基为TTG/TTG;

若A反应产物在FAM通道有信号且在VIC通道无信号,且B反应产物在FAM和VIC通道均无信号,则所述kdr基因突变位点为或候选为L1014C,突变位点所在位置的碱基为TGT/TGT;

若A反应产物在FAM通道无信号且在VIC通道有信号,且B反应产物仅在VIC通道有信号,则所述kdr基因的突变位点为或候选为L1014F,突变位点所在位置的碱基为TTT/TTT;

若A反应产物在FAM通道有信号且在VIC通道无信号,且B反应产物仅在FAM通道有信号,则所述kdr基因的突变位点为或候选为L1014C,突变位点所在位置的碱基为TTG/TGT;

若A反应产物在FAM通道无信号且在VIC通道有信号,且B反应产物在FAM通道和VIC通道均有信号,则所述kdr基因突变位点为或候选为L1014F,突变位点所在位置的碱基为TTG/TTT;

若A反应产物在FAM通道和VIC通道均有信号,且B反应产物仅在VIC通道有信号,则所述kdr基因突变位点为或候选为L1014F和L1014C;突变位点所在位置的碱基为TTT/TGT。

7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述方法还包括下述1)-4)中的至少一种:

1)所述TaqMan PCR扩增反应的反应体系中,引物各自的终浓度均为9μM;

2)所述TaqMan PCR扩增反应的反应体系中,探针各自的终浓度均为5μM;

3)所述TaqMan PCR扩增反应的反应体系中,以待测白纹伊蚊的基因组DNA为模板;

4)所述TaqMan PCR扩增反应的退火温度为60℃-65℃。

8.一种检测或辅助检测白纹伊蚊中kdr基因的基因型的方法,其特征在于,所述方法包括使用权利要求1或2所述的专用引物对和探针或权利要求3或4所述的试剂盒进行检测。

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