[发明专利]一种与澳洲白绵羊毛发粗细极显著相关的SNP标记、分子标记及应用

说明书

本发明属于动物遗传育种和SNP标记及应用领域，具体涉及一种与澳洲白绵羊毛发粗细极显著相关的SNP标记、分子标记及应用。该分子标记核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第111位碱基处存在一个A/G的等位基因突变，且当SEQ ID NO:1上的第111位核苷酸为G时，澳洲白绵羊的毛发较粗。本发明还公开了与澳洲白绵羊毛发粗细相关的分子标记的制备方法及其关联分析方法的应用。本发明为澳洲白绵羊粗毛性状的分子标记辅助选择提供了一个新的SNP分子标记，本发明的SNP分子标记可用于澳洲白绵羊新品系选育及利用澳洲白绵羊培育新品种过程中的选配及早期选择，可提高选择准确性，加快选育及纯化进展。

技术领域

本发明属于基因工程及分子生物学领域，涉及动物遗传育种和SNP标记及应用，特别是一种与澳洲白绵羊毛发粗细极显著相关的SNP标记、分子标记及应用。

背景技术

澳洲白绵羊是澳大利亚澳洲白绵羊育种者协会集成了白头杜泊绵羊，万瑞绵羊，无角陶赛特羊和特克塞尔羊的品种优良基因，采取特定比例的基因组合培育而成的粗毛型专门化肉羊品种。该品种2009年10月在澳大利亚正式注册，2011年3月上市。2011年5月，澳洲白绵羊由天津奥群牧业有限公司从澳大利亚HVD育种公司引进。针对引种及本土驯化遇到的问题，在完成引种适应性试验后，结合本地情况，逐步改进种羊饲养管理方法的同时，加强性能测定，应用所建立的小群体选育方法开展品系选育。经过持续选育，高效快繁，及不同规模和饲养环境下饲养管理技术的调整后，表现出适应性良好、体型大、生长快、成熟早、全年发情、自动换毛、抗逆性好及羔羊成活率高等特点。

近年来，合成材料的发展以及消费观念的改变使得人们对羊毛和羊肉的需求关系发生变化，对羊肉的需求量增加。羊毛生长过程中，细毛羊的营养需求更高，料肉转化率低于粗毛羊，筛选毛发更粗的羊可减少其在羊毛生长上的营养消耗，降低料肉比。同时粗毛型绵羊抗病、抗逆、耐粗饲性能更优，因而筛选并提高其中的粗毛个体比例可有效提高澳洲白绵羊的产肉性能。

基因组选择育种是通过对动物基因型分析来计算育种值，可有效降低表型鉴定中主观评价导致的误差，并能实现目标性状的早期选择，降低饲养成本，加快育种进程。本发明中发现的SNP与澳洲白绵羊毛发粗细性状的相关性达到了极显著水平，有助于加快澳洲白绵羊粗毛新品系的培育。

通过对公开专利文献的检索，并未发现与本专利申请相同的公开专利文献。

发明内容

本发明的目的在于克服现有技术的不足，提供一种与澳洲白绵羊毛发粗细极显著相关的SNP标记、分子标记及应用。

本发明解决其技术问题是采取以下技术方案实现的：

一种与澳洲白绵羊毛发粗细极显著相关的SNP标记，其特征在于：所述标记存在A和G两种等位基因，位于国际绵羊基因组Oar_v4.025号染色体上第7270707核苷酸位点Chr25:7270707。

而且，所述SNP标记位于国际绵羊基因组Oar_v4.025号染色体上第7270707核苷酸位点，且具有A/G多态性，所述SNP标记与澳洲白绵羊毛发粗细极显著相关P0.01。

而且，具有A/G多态性的为g.7270707A/G。

而且，g.7270707A/G位点G等位基因数量与毛发粗度极显著相关。

一种基于与澳洲白绵羊毛发粗细极显著相关的SNP标记的分子标记，其特征在于：所述分子标记的序列为SEQ ID NO:1。

一种基于与澳洲白绵羊毛发粗细极显著相关的SNP标记的分子标记制备方法，其特征在于：所述方法以含有SNP标记的核苷酸序列为基础序列，设计引物对，以澳洲白绵羊基因组DNA为模板进行PCR扩增，使所述的SNP标记转化为300bp的分子标记。

而且，所述引物对的上游引物为：SEQ ID NO:2，下游引物为：SEQ ID NO:3。