[发明专利]基于模糊优先性的DNA编码序列设计方法及装置有效
申请号: | 201811308435.7 | 申请日: | 2018-11-05 |
公开(公告)号: | CN109360602B | 公开(公告)日: | 2020-09-01 |
发明(设计)人: | 王延峰;申永鹏;葛高瑞;杨小亮;赵俊;刘胜;郑竹风;孙建彬;王涛 | 申请(专利权)人: | 郑州轻工业学院 |
主分类号: | G16B20/00 | 分类号: | G16B20/00 |
代理公司: | 北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙) 11371 | 代理人: | 唐维虎 |
地址: | 450000 河南省郑州*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 模糊 优先 dna 编码 序列 设计 方法 装置 | ||
1.一种基于模糊优先性的DNA编码序列设计方法,其特征在于,包括:
获取当前DNA编码序列总集合,其中,所述当前DNA编码序列总集合包括N个DNA编码序列集合,每一个所述DNA编码序列集合包括d个DNA编码序列;
对所述当前DNA编码序列总集合进行多目标模糊优先性计算,进而得到所述N个DNA编码序列集合在当前进化过程中的模糊优先值;
如果当前进化代数等于预设进化代数,则将所述模糊优先值中最小的模糊优先值所对应的DNA编码序列集合作为目标DNA编码序列集合;
其中,对所述当前DNA编码序列总集合进行多目标模糊优先性计算包括:
对当前DNA编码序列总集合DXt中的每一个DNA编码序列集合分别求解HP二级结构性能,连续性性能和汉明距离性能,得到所述当前DNA编码序列总集合DXt的精确目标值矩阵其中,F表示所述精确目标值矩阵,fs1表示DNA编码序列集合的HP二级结构性能,fs2表示所述DNA编码序列集合的连续性性能,fs3表示所述DNA编码序列集合的汉明距离性能,t表示当前进化代数,s=[1,2,…N];
将所述精确目标值矩阵转化为三角模糊数形式的目标值矩阵其中,表示所述三角模糊数形式的目标值矩阵,表示所述DNA编码序列集合三角模糊数形式的HP二级结构性能,表示所述DNA编码序列集合三角模糊数形式的连续性性能,表示所述DNA编码序列集合三角模糊数形式的汉明距离性能,lsj=msj=rsj=fsj,s=[1,2,…N],j=[1,2,3];
对所述三角模糊数形式的目标值矩阵进行归一化操作,得到归一化的三角模糊数形式的目标值矩阵其中,表示所述归一化的三角模糊数形式的目标值矩阵,表示所述DNA编码序列集合归一化的HP二级结构性能,表示所述DNA编码序列集合归一化的连续性性能,表示所述DNA编码序列集合归一化的汉明距离性能,表示第j列中rsj的最大数,表示第j列中msj的最大数,表示第j列中lsj的最大数,s=[1,2,…N],j=[1,2,3],∧'表示取左右算子中的较小值;
将所述HP二级结构性能,所述连续性性能和所述汉明距离性能的偏好信息按照预设映射规则映射为对应的三角模糊数集合其中表示所述三角模糊数集合,所述偏好信息为对所述HP二级结构性能,所述连续性性能和所述汉明距离性能进行人为设定得到的;
基于算式确定模糊效用矩阵其中,表示所述模糊效用矩阵,表示所述DNA编码序列集合的HP二级结构性能的模糊效用,表示所述DNA编码序列集合的连续性性能的模糊效用,表示所述DNA编码序列集合的汉明距离性能的模糊效用,s=[1,2,…N],j=[1,2,3];
计算模糊效用矩阵的模糊理想解其中,表示所述模糊理想解,的隶属度函数为∧表示取小的广义模糊算子;
基于算式s∈(1,2,…N)计算所述当前DNA编码序列总集合DXt的每一个DNA编码序列集合与所述模糊理想解之间的欧式距离,进而得到N个欧式距离,其中,Ds表示所述当前DNA编码序列总集合DXt的第s个DNA编码序列集合的欧式距离,j=[1,2,3];
将所述N个欧式距离作为所述N个DNA编码序列集合在当前进化过程中的模糊优先值。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:
如果所述当前进化代数小于所述预设进化代数,则将所述当前DNA编码序列总集合进行迭代更新,直至达到所述预设进化代数。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,当所述当前DNA编码序列总集合为空集合时,获取当前DNA编码序列总集合包括:
随机生成N个DNA编码序列集合X,其中,所述DNA编码序列集合X中的每一个DNA编码序列Xi的长度为|Xi|,i=[1,2,…d];
将所述N个DNA编码序列集合X作为所述当前DNA编码序列总集合。
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