[发明专利]一种建兰茎腐病菌LAMP检测引物组及其快速检测方法在审
申请号: | 201811312674.X | 申请日: | 2018-11-06 |
公开(公告)号: | CN109182591A | 公开(公告)日: | 2019-01-11 |
发明(设计)人: | 姚锦爱;余德亿;黄鹏;陈南川 | 申请(专利权)人: | 福建省农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/77 |
代理公司: | 福州元创专利商标代理有限公司 35100 | 代理人: | 蔡学俊 |
地址: | 350013 福建省*** | 国省代码: | 福建;35 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 病菌 快速检测 引物组 检测 琼脂糖凝胶电泳 现场快速检测 待测样品 基层单位 扩增产物 内侧引物 田间病害 引物序列 荧光染料 早期诊断 茎腐病 扩增 显色 引物 灵敏 监测 防治 应用 | ||
1.一种建兰茎腐病菌LAMP检测引物组,其特征在于所述引物组由1对外侧引物F3/B3和1对内侧引物FIP/BIP组成,F3/B3和FIP/BIP引物序列包括如下:
F3: 5’-GCCTGTTCGAGCGTCATT-3’;
B3: 5’-ACCTGATCCGAGGTCAACAT-3’;
FIP: 5’-GCCAATCAATTTGGGGAACGCGTCAACCCTCAAGCACAGC-3’;
BIP: 5’-GGTCACGTCGAGCTTCCATAGCAGTTGGGGTTTAACGGCG-3’。
2.如权利要求1所述的引物组在建兰茎腐病菌LAMP快速检测中的应用。
3.根据权利要求2所述引物组在建兰茎腐病菌LAMP快速检测中的应用,其特征在于,其检测方法包括以下步骤:
(1)提取待测样品基因组DNA;
(2)LAMP反应体系的建立:以步骤(1)提取的DNA为模板,利用权利要求1所述的外侧引物F3/B3和内侧引物FIP/BIP进行LAMP扩增,LAMP检测反应体系为25 μL,其中包括以下终浓度成分:20 mMTris-HCl、10 mM (NH4)2SO4、6.0 mM MgSO4、50 mM KCl、0.8 mM 甜菜碱、1.4mmol·L-1dNTPs、8U Bst DNA聚合酶、1.6 μmol·L-1的FIP和BIP、0.2 μmol·L-1的F3和B3,50-100 ng的模板DNA,无菌双蒸水补充至25 μL,在PCR管盖上加入2 μL的1000×SYBRGreenⅠ;
(3)LAMP反应条件:65℃温育60 min,85℃灭活10 min,冰上终止反应;
(4)反应结果的测定:采用荧光染料目测观察法或琼脂糖凝胶电泳法进行测定;所述荧光染料目测观察法具体方法为,待LAMP反应结束后,瞬时离心,将SYBR GreenⅠ离心到PCR管的底部,观察颜色变化,显色结果观察到绿色荧光的判断为阳性,存在建兰茎腐病菌,橙色或橘黄色判断为阴性,不存在建兰茎腐病菌;所述琼脂糖凝胶电泳法具体方法为,取2.0 μLLAMP扩增产物用2%琼脂糖凝胶电泳检测,出现梯形条带判断为阳性,存在建兰茎腐病菌,没有出现条带则判断为阴性,不存在建兰茎腐病菌。
4.如权利要求1-3任一所述的引物组在建兰茎腐病菌的早期诊断、监测和鉴定上的应用。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于福建省农业科学院植物保护研究所,未经福建省农业科学院植物保护研究所许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201811312674.X/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。