[发明专利]一种建兰茎腐病菌LAMP检测引物组及其快速检测方法在审

专利信息
申请号: 201811312674.X 申请日: 2018-11-06
公开(公告)号: CN109182591A 公开(公告)日: 2019-01-11
发明(设计)人: 姚锦爱;余德亿;黄鹏;陈南川 申请(专利权)人: 福建省农业科学院植物保护研究所
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/77
代理公司: 福州元创专利商标代理有限公司 35100 代理人: 蔡学俊
地址: 350013 福建省*** 国省代码: 福建;35
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摘要:
搜索关键词: 病菌 快速检测 引物组 检测 琼脂糖凝胶电泳 现场快速检测 待测样品 基层单位 扩增产物 内侧引物 田间病害 引物序列 荧光染料 早期诊断 茎腐病 扩增 显色 引物 灵敏 监测 防治 应用
【权利要求书】:

1.一种建兰茎腐病菌LAMP检测引物组,其特征在于所述引物组由1对外侧引物F3/B3和1对内侧引物FIP/BIP组成,F3/B3和FIP/BIP引物序列包括如下:

F3: 5’-GCCTGTTCGAGCGTCATT-3’;

B3: 5’-ACCTGATCCGAGGTCAACAT-3’;

FIP: 5’-GCCAATCAATTTGGGGAACGCGTCAACCCTCAAGCACAGC-3’;

BIP: 5’-GGTCACGTCGAGCTTCCATAGCAGTTGGGGTTTAACGGCG-3’。

2.如权利要求1所述的引物组在建兰茎腐病菌LAMP快速检测中的应用。

3.根据权利要求2所述引物组在建兰茎腐病菌LAMP快速检测中的应用,其特征在于,其检测方法包括以下步骤:

(1)提取待测样品基因组DNA;

(2)LAMP反应体系的建立:以步骤(1)提取的DNA为模板,利用权利要求1所述的外侧引物F3/B3和内侧引物FIP/BIP进行LAMP扩增,LAMP检测反应体系为25 μL,其中包括以下终浓度成分:20 mMTris-HCl、10 mM (NH4)2SO4、6.0 mM MgSO4、50 mM KCl、0.8 mM 甜菜碱、1.4mmol·L-1dNTPs、8U Bst DNA聚合酶、1.6 μmol·L-1的FIP和BIP、0.2 μmol·L-1的F3和B3,50-100 ng的模板DNA,无菌双蒸水补充至25 μL,在PCR管盖上加入2 μL的1000×SYBRGreenⅠ;

(3)LAMP反应条件:65℃温育60 min,85℃灭活10 min,冰上终止反应;

(4)反应结果的测定:采用荧光染料目测观察法或琼脂糖凝胶电泳法进行测定;所述荧光染料目测观察法具体方法为,待LAMP反应结束后,瞬时离心,将SYBR GreenⅠ离心到PCR管的底部,观察颜色变化,显色结果观察到绿色荧光的判断为阳性,存在建兰茎腐病菌,橙色或橘黄色判断为阴性,不存在建兰茎腐病菌;所述琼脂糖凝胶电泳法具体方法为,取2.0 μLLAMP扩增产物用2%琼脂糖凝胶电泳检测,出现梯形条带判断为阳性,存在建兰茎腐病菌,没有出现条带则判断为阴性,不存在建兰茎腐病菌。

4.如权利要求1-3任一所述的引物组在建兰茎腐病菌的早期诊断、监测和鉴定上的应用。

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