[发明专利]检测水稻耐低温基因COLD1基因型的dCAPS标记及应用有效

专利信息
申请号: 201811338846.0 申请日: 2018-11-12
公开(公告)号: CN109251996B 公开(公告)日: 2022-03-25
发明(设计)人: 储黄伟;曹黎明;程灿;涂荣剑;周继华;牛付安;孙滨;杨佳;胡雪娇 申请(专利权)人: 上海市农业科学院
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 浙江千克知识产权代理有限公司 33246 代理人: 黎双华
地址: 201106 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 检测 水稻 低温 基因 cold1 基因型 dcaps 标记 应用
【权利要求书】:

1.检测水稻耐低温基因COLD1基因型的dCAPS标记,其特征在于,所述dCAPS标记的序列为:

dcaps-F:5'-CCGTCAATCTGCCTTACAGCTATCTGTCAC-3',

dcaps-R:5'-TGAGCTGCCTTTCCAATGTTTTGAAGGCC-3'。

2.检测水稻耐低温基因COLD1基因型的方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)以待测样本的基因组DNA为模板,利用dCAPS标记通过PCR方法扩增目标序列;所述dCAPS标记的序列为:

dcaps-F:5'-CCGTCAATCTGCCTTACAGCTATCTGTCAC-3',

dcaps-R:5'-TGAGCTGCCTTTCCAATGTTTTGAAGGCC-3';

PCR反应程序如下:94℃,5min;94℃,30s,60℃,30s,72℃,30s,35个循环;72℃,10min;

(2)利用限制性内切酶StuI对扩增产物进行酶切,再对酶切产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,然后用硝酸银染色检测;

(3)根据电泳结果判定COLD1的基因型,当电泳结果是196 bp时,待测样本为粳稻COLD1jap基因型,当电泳结果是169 bp时,待测样本为籼稻COLD1ind基因型。

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