[发明专利]MUT基因突变检测试剂盒有效

专利信息
申请号: 201811362101.8 申请日: 2018-11-16
公开(公告)号: CN109234370B 公开(公告)日: 2021-11-12
发明(设计)人: 张开慧;宋丽;王兴翠;范美丽;伊长英 申请(专利权)人: 济南市儿童医院(山东大学齐鲁儿童医院)
主分类号: C12Q1/6858 分类号: C12Q1/6858
代理公司: 常州万为知识产权代理事务所(普通合伙) 32441 代理人: 王杰
地址: 250000 山东*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: mut 基因突变 检测 试剂盒
【说明书】:

发明涉及一种MUT基因突变检测试剂盒,所述检测试剂盒包含:12对MUT基因特异性扩增引物、7条MUT基因特异性探针和1条MUT基因野生序列封阻探针;所述12对MUT基因特异性扩增引物的序列分别如SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.24所示;所述7条MUT基因特异性探针的序列分别如SEQ ID NO.25‑SEQ ID NO.31所示;所述MUT基因野生序列封阻探针的序列如SEQ ID NO.32所示。该试剂盒能快速、准确、灵敏的检测MUT基因突变,并可将突变检测敏感度提高至0.01%。

技术领域

本发明涉及基因突变检测技术领域,具体涉及一种MUT基因突变检测试剂盒。

背景技术

甲基丙二酸血症(methylmalonic academia,MMA)是先天有机酸代谢异常中最常见的病种,主要是由于甲基丙二酰辅酶A变位酶(mutaseapoenzyme,mut)自身缺陷或其辅酶钴胺素(Cobalamin,Cbl,VitB12)代谢缺陷所致。变位酶缺陷包括完全缺陷mut0型,部分缺陷mut-型。钴胺素代谢缺陷包括cblA、cblB、cblC、cblD、cblE、cblF、cblG和cblH 8种亚型,其中cblC、cblD和cblF可导致辅酶脱氧腺苷钴胺素和甲基钴胺素合成障碍,引起体内甲基丙二酸、同型半胱氨酸等代谢物异常蓄积,故称为甲基丙二酸血症伴同型半胱氨酸血症(简称合并型MMA)。临床表现为神经、肝脏、肾脏、骨髓等多脏器损伤,以cblC型最为常见,其编码基因为MMACHC,定位于染色体1p34.1,属于常染色体隐性遗传病。

单纯甲基丙二酸血症中编码甲基丙二酰辅酶A变位酶的基因命名为MUT,定位于6p21,含13个外显子,总长35kb。至今已发现170余种突变,多为无义突变、错义突变和剪接位点的突变,缺失和插入突变较少,且大部分影响了MCM两个主要结构域,即C-端腺苷钴胺素结合区和N-端底物CoA结合区。

目前对于基因突变的检测方法主要有测序法和ARMS-PCR方法,但这两种方法都存在其中一定缺陷,其中,测序法灵敏度较低约20%,且操作复杂,检测时间较长,假阴性率较高。ARMS-PCR方法能够达到1%的灵敏度,但是检测成本过高,限制了其临床的推广和应用。

发明内容

针对上述现有技术,本发明的目的是提供一种MUT基因突变检测试剂盒。该试剂盒能快速、准确、灵敏的检测MUT基因突变,并可将突变检测敏感度提高至0.01%。

为实现上述目的,本发明采用如下技术方案:

本发明的第一方面,提供一种MUT基因突变检测试剂盒,所述检测试剂盒包含:12对MUT基因特异性扩增引物、7条MUT基因特异性探针和1条MUT基因野生序列封阻探针;

所述12对MUT基因特异性扩增引物的序列分别如SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.24所示;

所述7条MUT基因特异性探针的序列分别如SEQ ID NO.25-SEQ ID NO.31所示;

所述MUT基因野生序列封阻探针的序列如SEQ ID NO.32所示。

其中,12对MUT基因特异性扩增引物是用于选择性扩增MUT基因2、3、4、6、8、9、12这7个外显子上的突变序列,具体如下:

Ex2F1:5,-GGGCATCATCTAAACTATCTTC-3,;(SEQ ID NO.1)

Ex2R1:5,-TGAGTAGCTCCTATTTCCCAC-3,;(SEQ ID NO.2)

Ex2F2:5,-GAAGATATGCCCGTAGCTCCTA-3,;(SEQ ID NO.3)

Ex2R2:5,-GTAGCTCTCCCACATCATTAGC-3,;(SEQ ID NO.4)

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