[发明专利]与藏绵羊高原低氧适应性相关的遗传标记及其应用有效
| 申请号： | 201811382697.8 | 申请日： | 2018-11-20 |
| 公开（公告）号： | CN109576376B | 公开（公告）日： | 2022-06-07 |
| 发明（设计）人： | 刘秀;贺延玉;何建文;张伟;李少斌;胡江;王继卿;罗玉柱 | 申请（专利权）人： | 甘肃农业大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 | 代理人： | 崔自京 |
| 地址： | 730070 *** | 国省代码： | 甘肃;62 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 绵羊 高原 低氧 适应性 相关 遗传 标记 及其 应用 | ||
1.与藏绵羊高原低氧适应性相关的遗传标记，其特征在于：其位于HMOX1基因上，存在四个优势基因型AA、BB、AB和AC；当藏绵羊的基因型为AA、BB和AC时，藏绵羊高原低氧适应性良好；当藏绵羊的基因型为AB时，藏绵羊高原低氧适应性差；
所述基因型AA，在序列表SEQ ID No.1的第31位处为C/C，在序列表SEQ ID No.1的第76位处为G/G，在序列表SEQ ID No.1的第115位处为G/G；
所述基因型BB，在序列表SEQ ID No.1的第31位处为T/T，在序列表SEQ ID No.1的第76位处为A/A，在序列表SEQ ID No.1的第115位处为G/G；
所述基因型AC，在序列表SEQ ID No.1的第31位处为C/T，在序列表SEQ ID No.1的第76位处为A/G，在序列表SEQ ID No.1的第115位处为G/A；
所述基因型AB，在序列表SEQ ID No.1的第31位处为C/T，在序列表SEQ ID No.1的第76位处为G/A，在序列表SEQ ID No.1的第115位处为G/G。
2.检测权利要求1所述的遗传标记的试剂在制备鉴定藏绵羊高原低氧适应性的试剂中的应用，其特征在于：所述应用包括以下步骤：
1)提取待测藏绵羊的总RNA，反转录成cDNA；
2)以待测藏绵羊的cDNA为模板，利用引物对进行PCR扩增；所述引物对为：
上游引物：GATAGAACGCAACAAGGAGAA，
下游引物：CCTGGAGTCGCTGAACATAG；
3)对PCR扩增产物进行鉴定，当基因型为AA、BB和AC时，藏绵羊高原低氧适应性良好；当基因型为AB时，藏绵羊高原低氧适应性差；
所述基因型AA，在序列表SEQ ID No.1的第31位处为C/C，在序列表SEQ ID No.1的第76位处为G/G，在序列表SEQ ID No.1的第115位处为G/G；
所述基因型BB，在序列表SEQ ID No.1的第31位处为T/T，在序列表SEQ ID No.1的第76位处为A/A，在序列表SEQ ID No.1的第115位处为G/G；
所述基因型AC，在序列表SEQ ID No.1的第31位处为C/T，在序列表SEQ ID No.1的第76位处为A/G，在序列表SEQ ID No.1的第115位处为G/A；
所述基因型AB，在序列表SEQ ID No.1的第31位处为C/T，在序列表SEQ ID No.1的第76位处为G/A，在序列表SEQ ID No.1的第115位处为G/G。
3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于：步骤3)中，所述PCR扩增产物采用SSCP检测，同时设置阳性对照，凝胶电泳后染色，得到SSCP电泳带型图，根据图谱中条带的类型和阳性对照结果对待测样本的藏绵羊高原低氧适应性进行判断。
4.检测权利要求1所述的遗传标记的试剂在制备选留高原低氧适应性良好的藏绵羊的试剂中的应用，其特征在于：所述应用包括以下步骤：
1)提取待测藏绵羊的总RNA，反转录成cDNA；
2)以待测藏绵羊的cDNA为模板，利用引物对进行PCR扩增；所述引物对为：
上游引物：GATAGAACGCAACAAGGAGAA，
下游引物：CCTGGAGTCGCTGAACATAG；
3)对PCR扩增产物进行鉴定，当基因型为AA、BB和AC时，藏绵羊高原低氧适应性良好；当基因型为AB时，藏绵羊高原低氧适应性差；选留基因型为AA、BB和AC的藏绵羊；
所述基因型AA，在序列表SEQ ID No.1的第31位处为C/C，在序列表SEQ ID No.1的第76位处为G/G，在序列表SEQ ID No.1的第115位处为G/G；
所述基因型BB，在序列表SEQ ID No.1的第31位处为T/T，在序列表SEQ ID No.1的第76位处为A/A，在序列表SEQ ID No.1的第115位处为G/G；
所述基因型AC，在序列表SEQ ID No.1的第31位处为C/T，在序列表SEQ ID No.1的第76位处为A/G，在序列表SEQ ID No.1的第115位处为G/A。
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