[发明专利]一种高通量单分子力谱方法有效
申请号: | 201811400595.4 | 申请日: | 2018-11-22 |
公开(公告)号: | CN109557341B | 公开(公告)日: | 2021-05-18 |
发明(设计)人: | 李宾;刘文静;张萍 | 申请(专利权)人: | 中国科学院上海应用物理研究所 |
主分类号: | G01Q60/24 | 分类号: | G01Q60/24 |
代理公司: | 上海智信专利代理有限公司 31002 | 代理人: | 邓琪;余永莉 |
地址: | 201800 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 通量 分子力 方法 | ||
1.一种高通量单分子力谱方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)以DNA折纸为基底,根据该DNA折纸的几何结构在该DNA折纸上分别选取若干修饰位点,在所选修饰位点的寡核苷酸链的5’端延伸一段目标DNA短链,所述目标DNA短链可与固定于AFM探针上的DNA短链互补配对;以及
2)采用原子力显微镜单分子力谱的方法对位于DNA折纸和AFM探针上的两条互补DNA短链间的相互作用力进行测定,并收集特异性力-距曲线数据;
其中,步骤1)包括:以一条长链DNA为主链,与若干订书钉单链以及若干目标DNA短链混合进行杂交反应,实现目标DNA短链在DNA折纸上的修饰。
2.根据权利要求1所述的高通量单分子力谱方法,其特征在于,所述DNA折纸是具有任意一种形状的二维或三维纳米结构。
3.根据权利要求1所述的高通量单分子力谱方法,其特征在于,所述步骤1)具体包括:将脚手架链M13mp18 DNA与若干订书钉单链以及目标DNA短链按1:10:10的摩尔比混合后置于1xTAE/Mg2+缓冲液体系中,再置于PCR仪上从95℃退火至20℃,退火速度为0.1℃/10s。
4.根据权利要求1所述的高通量单分子力谱方法,其特征在于,所述步骤2)包括:将合成的带有目标DNA短链的DNA折纸溶液滴加于衬底上吸附一定时间,之后置于原子力显微镜的样品台上,于液相Peak force Tapping模式下的Spot and Shoot对DNA折纸进行成像,然后利用单点Ramp功能在目标位点做特异性力-距曲线。
5.根据权利要求4所述的高通量单分子力谱方法,其特征在于,所述带有目标DNA短链的DNA折纸溶液的浓度为1~5nM,用量为1~5μL。
6.根据权利要求1所述的高通量单分子力谱方法,其特征在于,DNA短链在AFM探针上的固定是通过修饰在该DNA短链的3’端的巯基与AFM探针上的镀金表面在室温下反应1~3h完成。
7.根据权利要求6所述的高通量单分子力谱方法,其特征在于,所述DNA短链在AFM探针上的固定所采用的DNA短链的浓度为1~10nM,用量为50~150μL。
8.根据权利要求1所述的高通量单分子力谱方法,其特征在于,所使用的原子力显微镜扫描头为J型扫描头,AFM探针为BL-TR400PB的全镀金的氮化硅探针。
9.根据权利要求4所述的高通量单分子力谱方法,其特征在于,所述步骤2)中所使用的衬底是新解离的云母片,该云母片预先被黏贴于铁片上,使用时将云母进行剥离以获得平整且干净的云母片,然后把合成的带有目标DNA短链的DNA折纸溶液滴于所述云母片上吸附2-5min,之后置于原子力显微镜样品台上进行AFM成像。
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