[发明专利]一种MSI检测方法在审
申请号: | 201811407854.6 | 申请日: | 2018-11-23 |
公开(公告)号: | CN110305958A | 公开(公告)日: | 2019-10-08 |
发明(设计)人: | 黄国英;章金涛;许芳;王文丽;赵倩伟;陈慧平;杨卫民 | 申请(专利权)人: | 郑州海普生物医药科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6858 |
代理公司: | 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 | 代理人: | 汤东凤 |
地址: | 450001 河南省郑州市*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 标记荧光 优化反应条件 正常粘膜组织 毛细管电泳 扩增引物 遗传标记 肿瘤组织 多重PCR 检测 个位 单管 耗材 扩增 通量 分析 | ||
1.一种MSI检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
S1、分别提取同一患者的正常粘膜组织的DNA与肿瘤组织的DNA,并分别选取贝斯塔遗传标记:Bat26,Bat25,D5S346,D2S123和D17S250这5个位点进行扩增引物标记荧光;
S2、分别对步骤S1中得到的同一患者的正常粘膜组织的DNA与肿瘤组织的DNA进行PCR扩增:
S2.1、取离心管,加入12μl的DNA和0.5μl的DNA Polymerase震荡混匀,离心;
S2.2、在装有PCR预混液的8联管中的前5个孔中分别加入2μl步骤S2.1中离心后的混合液;
S2.3、盖紧管盖,震荡混匀,离心,进行PCR扩增;扩增条件为:
1)95℃,3min;
2)95℃,30秒,52℃,30秒,72℃,60秒;35个循环;
3)72℃,10min;
S3、分别对步骤S2中得到的同一患者的正常粘膜组织的DNA与肿瘤组织的DNA的PCR扩增产物在基因分析仪上按照如下过程进行毛细管电泳:
分别步骤S2.3中得到的8联管的前五个孔中的PCR扩增产物各Iμl加入到新的离心管中,然后向所述新的离心管中加入0.5ul LIZ500和10ul HIDI,震荡混匀,离心,在基因分析仪上进行毛细管电泳,得到检测结果。
2.根据权利要求1所述的MSI检测方法,其特征在于,所述扩增引物的序列如下:
针对Bat25的扩增引物为:
BAT-25F:FAM-ATGGAGGATGACGAGTTG;
BAT-25R:CAGGCTTGTACTTTACAGC;
针对Bat26的扩增引物为:
BAT-26F:HEX-ATTGGATATTGCAGCAGTCA;
BAT-26R:GCTCCTTTATAAGCTTCTTCAG;
针对D2S123的扩增引物为:
D2S123F:FAM-AAACAGGATGCCTGCCTTTA;
D2S123R:CTGACTTGGATACCATCTATCT;
针对D17S250的扩增引物为:
D17S250F:HEX-CAGGCTGGTCTCAAACTC;
D17S250R:GGAAGAATCAAATAGACAAT;
针对D5S346的扩增引物为:
D5S346F:TMR-TGGTTTCCATTGTAGCATCTTGAC;
D5S346R:CTGGTTGTTTCCGTAGTATATG。
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