[发明专利]一种新型海洋生物污染检测标志物在审
申请号: | 201811417797.X | 申请日: | 2018-11-26 |
公开(公告)号: | CN109609469A | 公开(公告)日: | 2019-04-12 |
发明(设计)人: | 郭宝英;唐祖蓉;叶莹莹;刘硕博;祁鹏志 | 申请(专利权)人: | 浙江海洋大学 |
主分类号: | C12N9/02 | 分类号: | C12N9/02;C12N15/53;C12N15/10;C12N15/70;C12Q1/6888;C12Q1/6851 |
代理公司: | 杭州浙科专利事务所(普通合伙) 33213 | 代理人: | 吴秉中 |
地址: | 316000 浙江省舟山市普陀海*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 细胞色素P450酶 海洋生物污染 厚壳贻贝 海洋污染 检测标记 检测标志物 氨基酸序 核苷酸序 检测分析 经济损失 人工养殖 氧化过程 灵敏度 有效地 检测 赤潮 可用 病害 增高 水质 基因 海洋 恶化 污染 预防 发现 | ||
1.细胞色素P450酶CYP450,其特征在于:其氨基酸序列为SEQ ID NO.2。
2.一种基因,其特征在于,所述的基因编码权利要求1所述的细胞色素P450酶CYP450的蛋白质。
3.如权利要求2所述的基因,其特征在于:所述基因的核苷酸序列为SEQ ID NO.1。
4.如权利要求1-3任一项所述的细胞色素P450酶CYP450的克隆方法,包括:样品准备、总RNA的提取、cDNA第一链的合成、核心序列的克隆、全长序列的克隆、筛选和生物信息学分析,其特征在于:细胞色素P450酶CYP450核心序列的克隆中的PCR反应的扩用引物为:
CYP450 01F:5′-GGGCTTCTTGCGAAACGC-3′,
CYP450 01R:5′-CCTCCTGGGAGGTTACGATGACC-3′。
5.根据权利要求4所述的细胞色素P450酶CYP450的克隆方法,其特征在于包括:
(一)样品准备:准备厚壳贻贝、DEPC水、DEPC处理水、75%乙醇;
(二)总RNA的提取:选取性成熟、活力较强的厚壳贻贝提取总RNA,检验纯度及其完整性;
(三)cDNA第一链的合成:利用厚壳贻贝组织提取的总RNA进行cDNA第一条链合成;
(四)核心序列的克隆:以上述cDNA为模板,以CYP450 01F和CYP450 01R为简并引物,用Taq DNA聚合酶(TaKaRa)进行PCR扩增;
(五)全长序列的克隆:分别设计引物扩增3′RACE和5′RACE未知片段,将3′端、5′端和核心片段序列进行拼接;
(六)筛选:将步骤(五)获得的产物连接至pMD18-T载体并转至DH5感受态细胞中单克隆培养,菌液PCR验证后进行测序获得CYP450全序列;
(七)生物信息学分析:厚壳贻贝细胞色素P450酶CYP450cDNA片段大小为1476bp,共编码491个氨基酸。
6.如权利要求5所述的细胞色素P450酶CYP450的克隆方法,其特征在于:所述扩增3′RACE未知片段的特异性引物是:
3′-CYP450-outter:TGTCCTGTGCTATTAATCCCCTGACTTTC和
3′-CYP450-inner:AATGTATCCACTTACAGAAGGACCA。
7.根据权利要求5所述的细胞色素P450酶CYP450的克隆方法,其特征在于:所述扩增5′RACE未知片段的特异性引物是:
5′-CYP450-outter:CTGCCACCACGGTGTTATGC和
5′-CYP450-inner:CGGCTAATATGGCTACACTG。
8.一种基于权利要求1-7任一项所述的细胞色素P450酶CYP450的新型海洋生物污染检测标志物,其特征在于:以厚壳贻贝作为检测海洋污染的生物样本,以厚壳贻贝细胞色素P450酶CYP450用作海洋污染的检测标记物。
9.一种利用权利要求8所述的新型海洋生物污染检测标记物检测海洋生物污染的方法,其特征在于包括:通过对受到污染区域厚壳贻贝的解剖提取消化腺和腮中的RNA,反转录成DNA,再利用荧光定量技术检测细胞色素P450酶CYP450在消化腺和腮中的相对表达量,即可。
10.细胞色素P450酶CYP450用作新型海洋生物污染检测标记物在海洋污染检测中的应用。
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