[发明专利]卵形鲳鲹亲子鉴定的SSR荧光标记引物及应用有效
申请号: | 201811417973.X | 申请日: | 2018-11-26 |
公开(公告)号: | CN109457035B | 公开(公告)日: | 2020-09-18 |
发明(设计)人: | 郭梁;张殿昌;杨权;郭华阳;刘宝锁;张楠;朱克诚 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院南海水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 广州知友专利商标代理有限公司 44104 | 代理人: | 宣国华;刘艳丽 |
地址: | 510300 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 卵形 亲子鉴定 ssr 荧光 标记 引物 应用 | ||
1.一种用于卵形鲳鲹亲子鉴定的SSR荧光标记引物,其特征是包括13对特异性引物,分别为引物对Tov32142、Tov25439、Tov26724、Tov6129、Tov32776、Tov16774、Tov15555、Tov4695、Tov368、Tov82、Tov533、Tov530和Tov215,其中:
Tov32142.F、Tov32142.R的序列如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示;
Tov25439.F、Tov25439.R的序列如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示;
Tov26724.F、Tov26724.R的序列如SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示;
Tov6129.F、Tov6129.R的序列如SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8所示;
Tov32776.F、Tov32776.R的序列如SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10所示;
Tov16774.F、Tov16774.R的序列如SEQ ID NO:11和SEQ ID NO:12所示;
Tov15555.F、Tov15555.R的序列如SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:14所示;
Tov4695.F、Tov4695.R的序列如SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:16所示;
Tov368.F、Tov368.R的序列如SEQ ID NO:17和SEQ ID NO:18所示;
Tov82.F、Tov82.R的序列如SEQ ID NO:19和SEQ ID NO:20所示;
Tov533.F、Tov533.R的序列如SEQ ID NO:21和SEQ ID NO:22所示;
Tov530.F、Tov530.R的序列如SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:24所示;
Tov215.F、Tov215.R的序列如SEQ ID NO:25和SEQ ID NO:26所示。
2.一种卵形鲳鲹微卫星荧光多重PCR的方法,其特征是包括以下步骤:
(1)提取卵形鲳鲹DNA:采集卵形鲳鲹亲本样品和子代样品,提取基因组DNA;
(2)合成特异性引物:筛选并合成权利要求1中的13对特异性引物,所述13对特异性引物共分为二组,分别为V1组和G36组,其中V1组包括引物对Tov32142、Tov25439、Tov26724、Tov6129、Tov32776、Tov16774、Tov15555、Tov4695和荧光标记的通用引物,G36组包括引物对Tov368、Tov82、Tov533、Tov530、Tov215和荧光标记的通用引物,用于PCR分析;
(3)多重PCR扩增:采用荧光PCR反应分别利用步骤(2)中的两组引物对步骤(1)中的基因组DNA进行PCR扩增;
(4)亲子鉴定:对扩增产物进行基因分型,利用基因分型结果对亲本基因型和子代基因型进行分析,判定子代个体的父母本;
步骤(2)中V1组微卫星位点扩增的特异引物对和荧光标记通用引物如下表1:
表1 V1组微卫星位点扩增的特异引物对和荧光标记通用引物
步骤(3)中V1组多重PCR扩增体系如下表2:
表2 V1组多重PCR扩增体系
步骤(2)中G36组微卫星位点扩增的特异引物对和荧光标记通用引物如下表3:
表3 G36组微卫星位点扩增的特异引物对和荧光标记通用引物
步骤(3)中G36组多重PCR扩增体系如下表4:
表4 G36组多重PCR扩增体系
步骤(3)中荧光PCR反应时,扩增程序为98℃ 10s,57℃ 40s,72℃ 60s,35个循环;98℃10s,53℃ 40s,72℃ 60s,15个循环;最后72℃延伸30min,4℃保存;
步骤(4)中对扩增产物在ABI3730XL基因分析仪上进行基因分型。
3.权利要求1所述的SSR荧光标记引物在卵形鲳鲹亲子鉴定中的应用。
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