[发明专利]卵形鲳鲹亲子鉴定的SSR荧光标记引物及应用有效

专利信息
申请号: 201811417973.X 申请日: 2018-11-26
公开(公告)号: CN109457035B 公开(公告)日: 2020-09-18
发明(设计)人: 郭梁;张殿昌;杨权;郭华阳;刘宝锁;张楠;朱克诚 申请(专利权)人: 中国水产科学研究院南海水产研究所
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11
代理公司: 广州知友专利商标代理有限公司 44104 代理人: 宣国华;刘艳丽
地址: 510300 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 卵形 亲子鉴定 ssr 荧光 标记 引物 应用
【权利要求书】:

1.一种用于卵形鲳鲹亲子鉴定的SSR荧光标记引物,其特征是包括13对特异性引物,分别为引物对Tov32142、Tov25439、Tov26724、Tov6129、Tov32776、Tov16774、Tov15555、Tov4695、Tov368、Tov82、Tov533、Tov530和Tov215,其中:

Tov32142.F、Tov32142.R的序列如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示;

Tov25439.F、Tov25439.R的序列如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示;

Tov26724.F、Tov26724.R的序列如SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示;

Tov6129.F、Tov6129.R的序列如SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8所示;

Tov32776.F、Tov32776.R的序列如SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10所示;

Tov16774.F、Tov16774.R的序列如SEQ ID NO:11和SEQ ID NO:12所示;

Tov15555.F、Tov15555.R的序列如SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:14所示;

Tov4695.F、Tov4695.R的序列如SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:16所示;

Tov368.F、Tov368.R的序列如SEQ ID NO:17和SEQ ID NO:18所示;

Tov82.F、Tov82.R的序列如SEQ ID NO:19和SEQ ID NO:20所示;

Tov533.F、Tov533.R的序列如SEQ ID NO:21和SEQ ID NO:22所示;

Tov530.F、Tov530.R的序列如SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:24所示;

Tov215.F、Tov215.R的序列如SEQ ID NO:25和SEQ ID NO:26所示。

2.一种卵形鲳鲹微卫星荧光多重PCR的方法,其特征是包括以下步骤:

(1)提取卵形鲳鲹DNA:采集卵形鲳鲹亲本样品和子代样品,提取基因组DNA;

(2)合成特异性引物:筛选并合成权利要求1中的13对特异性引物,所述13对特异性引物共分为二组,分别为V1组和G36组,其中V1组包括引物对Tov32142、Tov25439、Tov26724、Tov6129、Tov32776、Tov16774、Tov15555、Tov4695和荧光标记的通用引物,G36组包括引物对Tov368、Tov82、Tov533、Tov530、Tov215和荧光标记的通用引物,用于PCR分析;

(3)多重PCR扩增:采用荧光PCR反应分别利用步骤(2)中的两组引物对步骤(1)中的基因组DNA进行PCR扩增;

(4)亲子鉴定:对扩增产物进行基因分型,利用基因分型结果对亲本基因型和子代基因型进行分析,判定子代个体的父母本;

步骤(2)中V1组微卫星位点扩增的特异引物对和荧光标记通用引物如下表1:

表1 V1组微卫星位点扩增的特异引物对和荧光标记通用引物

步骤(3)中V1组多重PCR扩增体系如下表2:

表2 V1组多重PCR扩增体系

步骤(2)中G36组微卫星位点扩增的特异引物对和荧光标记通用引物如下表3:

表3 G36组微卫星位点扩增的特异引物对和荧光标记通用引物

步骤(3)中G36组多重PCR扩增体系如下表4:

表4 G36组多重PCR扩增体系

步骤(3)中荧光PCR反应时,扩增程序为98℃ 10s,57℃ 40s,72℃ 60s,35个循环;98℃10s,53℃ 40s,72℃ 60s,15个循环;最后72℃延伸30min,4℃保存;

步骤(4)中对扩增产物在ABI3730XL基因分析仪上进行基因分型。

3.权利要求1所述的SSR荧光标记引物在卵形鲳鲹亲子鉴定中的应用。

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