[发明专利]降高血压药物尼群地平个体化用药指导基因检测试剂盒在审
申请号: | 201811429746.9 | 申请日: | 2018-11-28 |
公开(公告)号: | CN111235251A | 公开(公告)日: | 2020-06-05 |
发明(设计)人: | 马庆伟;钟逾 | 申请(专利权)人: | 北京毅新博创生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
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地址: | 102206 北京市昌平*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 高血压 药物 尼群地平 个体化 用药 指导 基因 检测 试剂盒 | ||
1.一种用于判别降高血压药物尼群地平的用药型的引物组合物,其特征在于,该引物组合包括针对能判别尼群地平的2个SNP标记的PCR引物对和延伸引物,其中,PCR引物序列对选自如SEQ ID NO:1a-2a所示的序列,延伸引物序列选自如SEQ ID NO:1b-2b所示的序列。
2.权利要求1所述的引物组合物,其中所述SNP分别选自:
rs5186、rs1137617。
3.权利要求1所述的引物组合物,其中上述PCR引物序列为核心序列,其在5'端可包括5-15个保护碱基序列,优选为10bp的tag:ACGTTGGATG。
4.权利要求1-3所述的引物组合物,其中延伸引物5'端可增加作为接头的碱基序列,其中优选为1-15个碱基,更优选1-3个碱基。
5.由权利要求1-4的引物组合物所制备的用于判别尼群地平用药型的检测产品,包括:
(1)用于PCR的反应试剂,包括:上述扩增引物对,耐高温的DNA聚合酶,dNTPs,PCR反应缓冲液;
(2)用于PCR产物纯化的试剂;
(3)用于单碱基延伸反应的试剂,包括:上述延伸引物,耐高温的单碱基延伸酶(SAP酶),ddNTPs,延伸反应缓冲液。
6.权利要求5所述的检测产品,其中还包括用于质谱检测且保护上述SNP组合的载体,优选质谱芯片和质谱仪。
7.使用权利要求1-4的引物组合物,或权利要求5-6的检测产品,进行质谱法判别尼群地平用药型的方法,包括以下步骤:
(1)多重PCR:使用上述PCR引物对,在两个反应体系中,对上述2个SNP位点所在DNA区域同时进行扩增,得到含4处多态位点所在DNA区域的PCR产物;
(2)PCR产物纯化:对步骤(1)得到的PCR产物进行纯化,以减少对后续反应的干扰;
(3)单碱基延伸:使用上述2条特异性的延伸引物,在两个反应体系中,对步骤(2)得到的纯化后PCR产物进行多重单碱基延伸,延伸引物在对应的SNP位点处延伸一个核苷酸,该核苷酸与SNP位点处的基因型互补配对;
(4)延伸产物纯化:对步骤(3)得到的延伸产物进行纯化,以获得高纯的延伸产物,避免盐离子等杂质对后续检测的影响;
(5)质谱仪检测:将步骤(4)得到的纯化产物点在含有基质的靶片上,放入质谱仪进行检测。
8.权利要求7的方法,其中步骤2的纯化过程可以选自碱性磷酸酶消化、碱性磷酸酶和外切酶ExoI消化、切胶纯化、PCR纯化柱过柱。
9.使用权利要求1-4的引物组合物,或权利要求5-6的检测产品,用于指导降高血压药物尼群地平的用药。
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