[发明专利]一种敲除酿酒酵母菌HO基因的方法在审

专利信息
申请号: 201811434012.X 申请日: 2018-11-28
公开(公告)号: CN109402162A 公开(公告)日: 2019-03-01
发明(设计)人: 应汉杰;奚迅;陈勇;杨乐云;刘娜;任培芳;孙文俊 申请(专利权)人: 南京工业大学
主分类号: C12N15/81 分类号: C12N15/81;C12N15/90;C12N15/55;C12R1/865
代理公司: 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 代理人: 丁静静;肖明芳
地址: 210009 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 敲除 单倍体菌株 抗性基因 酿酒酵母 单倍体 工业酿酒酵母 酿酒酵母菌株 酿酒酵母菌 阳性转化子 出发菌株 基因敲除 连续培养 质粒转化 半乳糖 重组菌 质粒 成功率 诱导 转化
【说明书】:

发明公开了一种敲除酿酒酵母HO基因的方法,以酿酒酵母单倍体菌株为出发菌株,将基因敲除片段转化酿酒酵母单倍体菌株,G418抗性筛选获得阳性转化子,将含有Cre重组酶基因的质粒转化HO基因敲除的单倍体菌株,利用半乳糖诱导Cre重组酶表达,使kanMX抗性基因丢失,得到抗性基因丢失的重组菌,再通过连续培养丢失质粒,既得到敲除HO基因的酿酒酵母菌株。本发明可快速、高效地分离获得不含外来抗性基因的工业酿酒酵母单倍体,具有工艺简单、单倍体分离率高、敲除成功率高的优点。

技术领域

本发明属于基因工程技术领域,具体涉及一种敲除酿酒酵母菌HO基因的方法。

背景技术

工业酿酒酵母菌株大多数是来自于自然界或发酵产品中分离而来,野生型的菌株多为二倍体,其复杂的倍性给酵母改良、代谢工程改造和遗传研究带来了诸多困难,由于多倍体菌株缺少营养缺陷型等筛选标记,增加了改造难度,而以单倍体形式存在的酿酒酵母基因信息简单明了,因此,一般先将二倍体或多倍体菌株通过生孢拆分获得单倍体菌株,筛选出性状优良利于后期分子改造、基因功能探索的单倍体菌株。综上可见,单倍体的筛选分离是极为关键的一步。

现有研究表明,酿酒酵母的HO基因能表达一种内切酶,在酵母生长过程中将导致单倍体配型(a型或α型)转换,从而与周围的异型孢子结合恢复为二倍体。现有技术一般直接通过同源重组技术敲除双倍体酿酒酵母HO基因,筛选阳性转化子,然后利用转化菌株生孢、蜗牛酶酶解以及YPD平板分离来获得单倍体。

但是对多倍体酿酒酵母HO基因双敲难度大,难以获得完全沉默HO基因的多倍体酿酒酵母,而HO基因单敲除的酿酒酵母的单倍体分离成功率低;单一的蜗牛酶酶解效率低,孢子释放率低;释放出的孢子粘连情况严重,导致单倍体分离率较低。

发明内容

本发明要解决的技术问题是,提供一种敲除酿酒酵母HO基因的方法,以解决现有技术中多倍体酿酒酵母HO基因双敲难度大,难以获得完全沉默HO基因的多倍体酿酒酵母的问题。

为解决上述技术问题,本发明采用如下技术方案:

一种敲除酿酒酵母菌HO基因的方法,包括如下步骤:

(1)筛选酿酒酵母单倍体菌株;

(2)将基因敲除片段转化酿酒酵母单倍体菌株,利用G418抗性筛选获得阳性转化子,所述基因敲除片段的核苷酸序列如SEQ ID NO:12所示;

(3)将含有Cre重组酶基因的质粒转化步骤(2)中的阳性转化子,利用半乳糖诱导质粒中Cre重组酶表达,使抗性基因丢失,得到抗性基因丢失的重组菌,连续培养,使含有Cre重组酶基因的质粒丢失,即得到敲除HO基因的无抗性的酿酒酵母单倍体菌株。

其中,筛选酿酒酵母单倍体菌株的方法如下:

将酿酒酵母涂布在产孢培养基上,30℃培养5~7d,取酵母菌泥经混合酶酶解破壁处理,超声处理,超声功率为12~60W,时间为5~20min;再将其稀释103~106倍,涂布于YPD培养基,PCR筛选酿酒酵母单倍体菌株。

其中,所述混合酶为蜗牛酶与纤维素酶的混合物,其中,蜗牛酶的含量为1~1010mg/ml,纤维素酶的含量为1~100mg/ml。

其中,所述含有Cre重组酶基因的质粒为pSH65。

有益效果:

本发明公开了一种敲除酿酒酵母菌HO基因的方法可快速、高效地分离获得不含外来抗性基因的工业酿酒酵母单倍体,具有工艺简单、单倍体分离率高、敲除成功率高的优点。

附图说明

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