[发明专利]一种在IBD炎症性肠病中高表达的NCAPD2/NCAPD3序列及其检测方法在审

专利信息
申请号: 201811435073.8 申请日: 2018-11-28
公开(公告)号: CN109504756A 公开(公告)日: 2019-03-22
发明(设计)人: 杨柏霖;刘平;袁昌文;徐治中;沈伟 申请(专利权)人: 江苏省中医院
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12Q1/6844;C12N15/11
代理公司: 上海精晟知识产权代理有限公司 31253 代理人: 冯子玲
地址: 210000 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 高表达 炎症性肠病 炎症细胞 检测 沉淀 蛋白沉淀液 核苷酸序列 细胞裂解液 异丙醇溶液 室温孵育 芯片检测 血液样本 乙醇洗涤 正常组织 标本 离心管 裂解物 裂解液 乙醇 酶水 液氮 配对 溶解 筛选
【说明书】:

发明公开了一种在IBD炎症性肠病中高表达的NCAPD2/NCAPD3序列及其检测方法,具有如序列表中SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列;该检测方法包括:取血液样本于离心管,加细胞裂解液,室温孵育离心;弃清上清,加入核裂解液,向裂解物中加入蛋白沉淀液,室温离心,取上清;加入异丙醇溶液,使DNA沉淀出现,离心,弃上清;加入乙醇洗涤沉淀,离心,弃去乙醇,自然挥干,加无核酶水溶解沉淀,吸取DNA样品用于DNA定量。本发明由20个IBD炎症细胞和配对的15个正常组织标本,取得标本后存冻于液氮罐中,集齐后采用T‑UCR芯片检测筛选出两条在IBD炎症细胞中高表达的UCR。

技术领域

本发明涉及一种NCAPD2/NCAPD3序列及其检测方法,特别是涉及一种在IBD炎症性肠病中高表达的NCAPD2/NCAPD3序列及其检测方法,属于细胞分子生物学技术领域。

背景技术

炎症性肠病IBD是一种病因尚不明确的慢性非特异性肠道炎性疾病,包括溃疡性结肠炎UC和克罗恩病CD,IBD病程迁延反复,治疗手段虽多,效果均不理想且预后不佳,严重影响患者生活质量,耗费大量卫生资源且是导致肠道肿瘤的癌前病变之一,研究表明,IBD在既往高发病率的西方国家趋于稳定,而在亚洲国家呈逐渐增加的趋势。

中国IBD诊断存在的最大一个问题是与感染性肠道疾病的鉴别诊断,而最难的是与肠结核的鉴别诊断;近年来有很多报道提出血清学标志物对于IBD的鉴别诊断具有较大价值;欧美国家多数研究表明抗中性粒细胞胞浆抗体ANCA、人抗酿酒酵母抗体ASCA约诊断敏感度达60%,特异度达70%;但国际上关于血清标志物诊断的价值在不同种族疾病人群中存在差异,且其他血清标志物(如抗胰腺腺泡抗体PAB)尚未应用于我国临床中,其临床价值还有待进一步探讨;因此,寻找并研制能够准确诊断IBD、监测IBD疾病进展状况的临床试剂盒对提高我国IBD患者的临床治疗具有重要意义和价值。

发明内容

为了解决上述问题,本发明的主要目的是为了提供一种在IBD炎症性肠病中高表达的NCAPD2/NCAPD3序列及其检测方法。

本发明的目的可以通过采用如下技术方案达到:

一种在IBD炎症性肠病中高表达的NCAPD2/NCAPD3序列,该NCAPD2/NCAPD3序列具有如序列表中SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列。

一种在IBD炎症性肠病中高表达的NCAPD2/NCAPD3序列的检测方法,包括根据核苷酸序列为SEQ ID NO.1的长链非编码RNA设计并合成出特异性用于LAMP检测的特异性引物。

进一步的,特异性引物包括内引物FIP和内引物BIP和一对外引物F3和B3,其分别为:

内引物FIP为Pair 1上游引物:SEQ ID NO.2;

内引物BIP为Pair 1下游引物:SEQ ID NO.3;

外引物F3为Pair2上游引物:SEQ ID NO.4;

外引物B3为Pair 2下游引物:SEQ ID NO.5。

进一步的,包括如下步骤:

步骤1:取血液样本于离心管中,加入细胞裂解液,混匀,室温孵育离心;

步骤2:弃清上清,加入核裂解液,混匀,向裂解物中加入蛋白沉淀液,室温离心,取上清;

步骤3:加入异丙醇溶液,使DNA沉淀出现,离心,弃上清;

步骤4:加入等体积的乙醇洗涤沉淀,离心,弃去乙醇,自然挥干,加无核酶水溶解沉淀,吸取DNA样品用于DNA定量。

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