[发明专利]与水稻稻瘟病抗性基因Pi2紧密连锁的分子标记R060939-2

说明书

与水稻稻瘟病抗性基因Pi2紧密连锁的分子标记R060939‑2。本发明提供了一种与水稻稻瘟病抗性基因Pi2紧密连锁的分子标记，该分子标记含有SEQ ID NO：1所示序列。本发明还涉及扩增该分子标记的引物、该分子标记和引物在水稻稻瘟病抗性基因Pi2定位或水稻遗传育种中的用途，以及一种水稻育种方法。本发明的分子标记将基因组DNA序列与水稻稻瘟病抗性基因Pi2联系起来，有利于水稻分子标记辅助育种体系的建立；所述分子标记与水稻稻瘟病抗性基因Pi2紧密连锁。本发明的分子标记及分子标记扩增引物可以简便、快速、高通量地应用于水稻育种实践和资源及品种鉴定。

技术领域

本发明属于分子生物学领域，涉及一种分子标记，特别是涉及一种与水稻稻瘟病抗性基因Pi2紧密连锁的分子标记。本发明还涉及扩增该分子标记的引物、该分子标记和引物在水稻稻瘟病抗性基因Pi2定位或水稻遗传育种中的用途。

背景技术

水稻稻瘟病(Rice Blast)是水稻的重要病害之一,该病害可引起水稻产量大幅度减产，严重时减产40％～50％，甚至绝收。稻瘟病的防治对于我国粮食安全的保障起着至关重要的作用。目前种植抗病品种是防治该病害最经济有效的措施，但生产上的抗病品种较少且许多抗病品种在推广种植3～5年后就丧失了抗稻瘟病抗性。因此，培育出具有持久广谱抗稻瘟病的水稻是确保水稻安全生产的重要手段。

传统抗病育种是根据分离群体的表现和育种者的经验进行选择，通常受环境条件、显隐性关系、基因上位等因素的影响，费时、费力、不准确，具体地，针对抗稻瘟病育种，在常规育种实践中，一般通过田间稻瘟病病菌接种实验或者在稻瘟病易发区来鉴定材料的稻瘟病抗性，通过实验，根据植株菌斑面积和发病叶片数等信息来判定苗子的稻瘟病抗性级别，进行分级，从而选择具有稻瘟病抗性的材料。总之，从鉴定一个植物抗病种到培育出抗病良种需花费十多年时间，而病原菌一旦侵袭，其扩散速度要比育种速度快得多。

近年来生物技术的发展，尤其是分子标记技术的应用给水稻遗传育种带来了巨大变化。分子标记辅助选择为育种者提供了对目标性状进行选择的有效手段，它大大加速了育种进程，提高了育种选择效率，同时减少了盲目选择和人力、物力的大量浪费，展示出极其广阔的应用前景。

目前，虽然已经定位了一些水稻稻瘟病的抗性基因和抗病位点，如Pi-a、Pii、Pik，Pi2等，但由于水稻抗稻瘟病的遗传机制较复杂，仍然缺乏足够数量的与抗稻瘟病性相关的QTLs及分子标记。随着基因组学和生物信息的发展，通过基因组测序，开发与抗稻瘟病基因尤其是具有广谱持久的抗性且对中国大多数稻瘟病生理小种具有抗性的Pi2基因紧密连锁的分子标记，将为水稻的遗传研究及育种开辟新的思路和方法。

发明内容

本发明的目的是提供一种与水稻稻瘟病抗性基因Pi2紧密连锁的分子标记。

本发明的另一目的是提供一种可用于PCR扩增与水稻稻瘟病抗性基因Pi2紧密连锁的分子标记的引物对，以及由该引物对扩增获得的分子标记。

本发明的再一目的是提供上述分子标记在水稻稻瘟病抗性基因Pi2定位、检测以及水稻辅助育种中的用途以及上述分子标记的检测方法。

本发明的目的还包括提供一种包括上述分子标记的重组载体，以及含有该重组载体的重组细胞；提供一种包括使用上述分子标记的水稻稻瘟病抗性基因Pi2的定位方法，和使用所述分子标记的水稻辅助育种方法。

为了实现上述目的，本发明采用了以下技术方案：

本发明公开了一种与水稻稻瘟病抗性基因Pi2紧密连锁的分子标记，所述分子标记含有SEQ ID NO：1所示核苷酸序列；优选的，所述分子标记为SEQ ID NO：1所示核苷酸序列。