[发明专利]一种西北春小麦全基因组关联分析方法有效

专利信息
申请号: 201811480751.2 申请日: 2018-12-05
公开(公告)号: CN109545280B 公开(公告)日: 2022-12-06
发明(设计)人: 刘德梅;王海庆;陈志国;刘瑞娟;窦全文;袁飞敏;权有娟;李想 申请(专利权)人: 中国科学院西北高原生物研究所
主分类号: G16B20/30 分类号: G16B20/30
代理公司: 北京方圆嘉禾知识产权代理有限公司 11385 代理人: 董芙蓉
地址: 810008*** 国省代码: 青海;63
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摘要:
搜索关键词: 一种 西北 春小麦 基因组 关联 分析 方法
【权利要求书】:

1.一种西北春小麦全基因组关联分析方法,其特征在于,所述方法包括:选择小麦种子并种植;成熟期,测量株高、穗长、小穗数、穗粒数、基部不孕小穗数;成熟后,收获种子,采用高通量分子仪测定收获种子的粒宽、粒长、重量,计算千粒重;用CTAB法提取DNA,将DNA浓度调至50-100ng·μl-1,制备DArT芯片;采用STRUCTURE计算小麦品种的群体结构,利用贝叶斯模型划分群体结构,采用TASSEL进行群体连锁不平衡分析,分别获得与产量和种子特性相关的DArT分子标记;所述分子标记包括:

与株高相关的DArT分子标记的数量为12个,分别位于2BS、2BL、3AL、3DL、4AL、6BL和7BL染色体上;

与穗长相关的DArT分子标记的数量为2个,分别位于1BL和1DS染色体上;

与小穗数相关的DArT分子标记的数量为8个,分别位于2BL、4AL、4BS和7AS染色体上;

与穗粒数相关的DArT分子标记的数量为3个,分别位于2BS、3B、4AS染色体上;

与不实小穗数相关的DArT分子标记的数量为4个,分别位于4AL和2AS染色体上;

与粒长相关的DArT分子标记的数量为3个,分别位于3AL、3DL和6BL染色体上;

与千粒重相关的DArT分子标记的数量为1个,分别位于4BS染色体上;

与粒宽相关的DArT分子标记的数量为4个,分别位于1BL、4BS和6BS染色体上。

2.如权利要求1所述的一种西北春小麦全基因组关联分析方法,其特征在于,所述与株高相关的DArT分子标记名称分别为3948001,其在染色体上的定位点为2BS-49.35;分子标记名称为977285 2,其在染色体上的定位点为2BL-147.5;分子标记名称为1095515,其在染色体上的定位点为2B-169.5;分子标记名称为1110999,其在染色体上的定位点为2BL-149.1;分子标记名称为3022662,其在染色体上的定位点为3A-251.6;分子标记名称为3034494,其在染色体上的定位点为3B-102.6;分子标记名称为2242056,其在染色体上的定位点为3DL-30.91;分子标记名称为1084423,其在染色体上的定位点为4AL-211.5;分子标记名称为1407545,其在染色体上的定位点为6BL-27.69;分子标记名称为2289515,其在染色体上的定位点为6BL-140.5;分子标记名称为1121404其在染色体上的定位点为7BL-39.3;分子标记名称为1696288其在染色体上的定位点为7BL-111.3。

3.如权利要求1所述的一种西北春小麦全基因组关联分析方法,其特征在于,所述与穗长相关的DArT分子标记名称为1399704,其在染色体上的定位点为1BL-329.68,分子标记名称为3952261,其在染色体上的定位点为1DS-206.1;

所述与小穗数相关的DArT分子标记名称为1241626,其在染色体上的定位点为2BL-148.86,分子标记名称为1090024,其在染色体上的定位点为2BL-156.7,分子标记名称为1101447,其在染色体上的定位点为2BL-148.8,分子标记名称为1101543,其在染色体上的定位点为2BL-153.1。

4.如权利要求1所述的一种西北春小麦全基因组关联分析方法,其特征在于,所述与穗粒数相关的DArT分子标记名称为1162334,其在染色体上的定位点为2BS-139.8,分子标记名称为1148843,其在染色体上的定位点为3B-16.73,分子标记名称为1082451,其在染色体上的定位点为4AS-45.7。

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