[发明专利]一种西北春小麦全基因组关联分析方法有效
申请号: | 201811480751.2 | 申请日: | 2018-12-05 |
公开(公告)号: | CN109545280B | 公开(公告)日: | 2022-12-06 |
发明(设计)人: | 刘德梅;王海庆;陈志国;刘瑞娟;窦全文;袁飞敏;权有娟;李想 | 申请(专利权)人: | 中国科学院西北高原生物研究所 |
主分类号: | G16B20/30 | 分类号: | G16B20/30 |
代理公司: | 北京方圆嘉禾知识产权代理有限公司 11385 | 代理人: | 董芙蓉 |
地址: | 810008*** | 国省代码: | 青海;63 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 西北 春小麦 基因组 关联 分析 方法 | ||
1.一种西北春小麦全基因组关联分析方法,其特征在于,所述方法包括:选择小麦种子并种植;成熟期,测量株高、穗长、小穗数、穗粒数、基部不孕小穗数;成熟后,收获种子,采用高通量分子仪测定收获种子的粒宽、粒长、重量,计算千粒重;用CTAB法提取DNA,将DNA浓度调至50-100ng·μl-1,制备DArT芯片;采用STRUCTURE计算小麦品种的群体结构,利用贝叶斯模型划分群体结构,采用TASSEL进行群体连锁不平衡分析,分别获得与产量和种子特性相关的DArT分子标记;所述分子标记包括:
与株高相关的DArT分子标记的数量为12个,分别位于2BS、2BL、3AL、3DL、4AL、6BL和7BL染色体上;
与穗长相关的DArT分子标记的数量为2个,分别位于1BL和1DS染色体上;
与小穗数相关的DArT分子标记的数量为8个,分别位于2BL、4AL、4BS和7AS染色体上;
与穗粒数相关的DArT分子标记的数量为3个,分别位于2BS、3B、4AS染色体上;
与不实小穗数相关的DArT分子标记的数量为4个,分别位于4AL和2AS染色体上;
与粒长相关的DArT分子标记的数量为3个,分别位于3AL、3DL和6BL染色体上;
与千粒重相关的DArT分子标记的数量为1个,分别位于4BS染色体上;
与粒宽相关的DArT分子标记的数量为4个,分别位于1BL、4BS和6BS染色体上。
2.如权利要求1所述的一种西北春小麦全基因组关联分析方法,其特征在于,所述与株高相关的DArT分子标记名称分别为3948001,其在染色体上的定位点为2BS-49.35;分子标记名称为977285 2,其在染色体上的定位点为2BL-147.5;分子标记名称为1095515,其在染色体上的定位点为2B-169.5;分子标记名称为1110999,其在染色体上的定位点为2BL-149.1;分子标记名称为3022662,其在染色体上的定位点为3A-251.6;分子标记名称为3034494,其在染色体上的定位点为3B-102.6;分子标记名称为2242056,其在染色体上的定位点为3DL-30.91;分子标记名称为1084423,其在染色体上的定位点为4AL-211.5;分子标记名称为1407545,其在染色体上的定位点为6BL-27.69;分子标记名称为2289515,其在染色体上的定位点为6BL-140.5;分子标记名称为1121404其在染色体上的定位点为7BL-39.3;分子标记名称为1696288其在染色体上的定位点为7BL-111.3。
3.如权利要求1所述的一种西北春小麦全基因组关联分析方法,其特征在于,所述与穗长相关的DArT分子标记名称为1399704,其在染色体上的定位点为1BL-329.68,分子标记名称为3952261,其在染色体上的定位点为1DS-206.1;
所述与小穗数相关的DArT分子标记名称为1241626,其在染色体上的定位点为2BL-148.86,分子标记名称为1090024,其在染色体上的定位点为2BL-156.7,分子标记名称为1101447,其在染色体上的定位点为2BL-148.8,分子标记名称为1101543,其在染色体上的定位点为2BL-153.1。
4.如权利要求1所述的一种西北春小麦全基因组关联分析方法,其特征在于,所述与穗粒数相关的DArT分子标记名称为1162334,其在染色体上的定位点为2BS-139.8,分子标记名称为1148843,其在染色体上的定位点为3B-16.73,分子标记名称为1082451,其在染色体上的定位点为4AS-45.7。
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