[发明专利]一种与大白猪生长性状相关的SNP分子标记及其应用

说明书

本发明公开了属于分子标记育种技术领域的一种与大白猪生长性状相关的SNP分子标记及其应用。该SNP分子标记位于大白猪DHRS4基因的rs701332503位点。所述大白猪中DHRS4基因的核苷酸序列自5’端rs701332503位点与大白猪的生长性状相关，即大白猪DHRS4基因rs701332503位点上的SNP分子标记与大白猪生长性状(饲料转化率)相关，是一个新的分子标记，通过确定待测大白猪SNP位点的基因型，从而对大白猪生长性状(饲料转化率)进行种猪筛选，可有效节省生产成本并加快遗传进展，更好地服务于大白猪种猪的筛选，既能满足巨大的市场需求，又具有很大的经济应用价值和科研价值。

技术领域

本发明属于分子标记育种技术领域，特别涉及一种与大白猪生长性状相关的SNP分子标记及其应用。

背景技术

单核苷酸位点多态性(Single Nucleotide PolymorpHisms，SNP)是基因组上由单个核苷酸产生的碱基变异，其具有分布数量多、多态性丰富等特点，是继微卫星分子标记之后又一重要的分子遗传标记，被称为第三代分子遗传标记。该标记已广泛应用于动植物标记辅助育种、基因定位、遗传多样性研究等领域。

畜牧业在现代农业发展中占据着非常重要的地位，其在农业生产中所占有的比值通常用来衡量一个国家和地区发展程度的重要指标。猪肉作为我国最主要的肉类来源，生猪养殖产业在我国畜牧业中占据着举足轻重的地位。在20世纪80年代中期，我国肉类产量约2000万吨，猪肉约占85％，2012年猪肉产量达到了5335万吨，约占肉类总量的63.63％。虽然猪肉所占比重逐渐下降，但其始终占据了主导地位。

在养猪行业中，饲料成本占养猪总成本的65-75％。因此，降低生猪养殖中的饲料消耗，提高饲料利用效率，降低饲料成本关系到养猪企业发展乃至生存，对于改良猪的生长性状和经济性状有重要意义。

DHRS4是一种广泛存在于多种哺乳动物内催化视黄醇和视黄醛之间相互转化的脱氢还原酶。近年来还发现它的多种剪接亚型，可实现不同的功能定位和表达。DHRS4在维甲酸合成、类固醇代谢、苯甲基代谢中发挥着重要的作用，并可能通过影响维甲酸合成对细胞的增殖分化、细胞信号传导、肿瘤生成进行调控。

在动物生长性状方面，有研究发现DHRS4基因的SNP与猪肌肉的pH值密切相关，具有在猪肉质方面的遗传标记的潜力。全反式维甲酸(atRA)作为DHRS4的活性形式，通过研究发现在小鼠和人体中抑制处于不成熟阶段肌肉的分化表达，有利于增强肌细胞的周期性表达。同时，DHRS4基因研究主要集中于小鼠和人体肿瘤细胞中，在猪肌肉发育中的研究鲜有报道，在猪生长性状的通路中的相关分子通路及机制仍需要进一步研究。饲料转化率作为猪生长性状的重要指标，因此，可以从猪DHRS4基因单核苷酸多态性与饲料转化率的相关性着手，用以改良猪的生长性状和经济性状。

大白猪，又称大约克夏猪，是猪的一个著名品种。原产于英国约克郡，由当地猪与中国猪等杂交育成。全身白色，耳向前挺立。有大、中、小三种，分别称为大白猪、中白猪和小白猪。大白猪属腌肉型，为全世界分布最广的猪种。体长大，成年公猪体重三百至五百公斤，母猪两百至三百五十公斤。繁殖力强，每胎产仔十到十二头。小白猪早熟易肥，属脂肪型。中白猪体型介于两者之间，属肉用型。中国饲养大白猪较多，因此，对于生长性能较优的种猪的市场需求较大。

发明内容

为克服以上现有技术中的不足或缺陷，提供一种与大白猪生长性状相关的SNP分子标记及其应用，本发明运用全基因组关联分析的方法寻找与大白猪生长性状相关的SNP分子标记及单倍型，以此作为与大白猪生长性状相关的SNP分子标记及单倍型在标记辅助选择中的应用。

本发明所采取的技术方案是：

一种与大白猪生长性状相关的SNP分子标记，所述SNP分子标记位于大白猪DHRS4基因的rs701332503位点。

所述SNP分子标记在大白猪种猪筛选中的应用。