[发明专利]一种与先天性气管软化相关的CNV片段及其应用

说明书

本发明公开了一种与先天性气管软化相关的CNV片段，所述CNV片段为Chr17:16673072‑20374018区间片段，所述Chr17:16673072‑20374018片段在先天性气管软化患者血液中发生拷贝数缺失。本发明提供的一种检测先天性气管软化的试剂盒，所述试剂盒包括检测Chr17:16673072‑20374018或ALDH3A1、ATPAF2基因拷贝数变异的检测，此试剂盒可用于初步检测待测样品是否患有先天性气管软化疾病。所述Chr17:16673072‑20374018或ALDH3A1、ATPAF2基因的拷贝数变异位点可以作为先天性气管软化病早期筛查和诊断的分子标记。

技术领域

本发明涉及分子生物学检测领域，具体涉及一种与先天性气管软化相关的CNV片段及其应用。

背景技术

气管软化症(tracheomalacia)指气管壁因气管软骨环完整性受到破坏或部分气管壁纵行弹性纤维萎缩或减少，导致气管弹性张力减退而坍塌狭窄的疾病。根据发病原因可将其大致分为先天性(原发性)气管软化(Congenital Tracheomalacia,CTM)和获得性(继发性)气管软化两种。目前CTM的发病机制尚未完全阐明，其发病率约为1/2100，占支气管镜检查诊断的34％。CTM以在健康人群中孤立性发现，但更多见于早产儿，发病年龄多在6个月以内。CTM常伴有其他疾病，如先天性心脏病、胃食管反流、TEF、支气管肺发育不良、神经功能损害、发育迟缓等，发生率为1.7％-78％。按气管塌陷程度，CTM可分为轻中重三级，其中重度CTM患者以反复感染、肺不张和呼吸困难为主要表现，保守治疗往往无效，在上世纪80年代死亡率高达80％，即使在今天，重度CTM患者也多有痰贮留、上呼吸道梗阻、呼吸停止甚至心脏骤停等症状出现，给家庭和社会带来严重的经济和精神负担。因此，寻找CTM的遗传基础，探索其可能的致病机制显得尤为重要和迫切。

近年来，拷贝数变异(CopyNumberVariation，CNV)在复杂疾病中的作用受到了日益广泛的关注。CNV是指由基因组发生重排而导致的，一般长度为1kb以上的基因组大片段的拷贝数增加或者减少，主要表现为亚显微水平的缺失和重复，是基因组结构变异的重要组成部分据报道CNV可涵盖基因组29.74％的区域，较SNP携带有更多的信息，此外CNV位点的突变率也远高于SNP，是人类个体之间产生遗传差异及疾病的重要致病因素之一。

目前常用的进行全基因组范围内CNVs研究的是微阵列比较基因组杂交技术(array-based comparative genomic hybridization，aCGH)和以单核苷酸多态性分型为基础的阵列技术(array-based single nucleotidepolymorphisms，SNP array)。对基因组己知的CNV检测主要包括实时荧光定量PCR(Real-time qPCR)、依赖连接的多重扩增探针杂交技术(Multiplex Ligation-Dependent Probe Amplification，MLPA和短片段多重定量技术(Quantitative Multiplex PCRofShortFluorescentFragments，QMPSF)。

特异的CNV可以解释除序列变异外的一部分疾病风险，且已经被证明与多种复杂疾病相关。目前关于CNV与CTM相关性的研究相对较少。本发明拟探讨CTM发病的遗传基础，从分子水平寻找其可能的生物标志物，将有助于CTM的早期诊断和治疗。

发明内容

本发明的目的在于提供一种与先天性气管软化相关的CNV片段，及其提供上述CNV片段在在制备预防、早期检测或治疗先天性气管软化的产品中的应用。

为实现上述目的，本发明首先提供一种与先天性气管软化相关的CNV片段，所述CNV片段为Chr17:16673072-20374018区间片段，所述Chr17:16673072-20374018片段在先天性气管软化患者血液中发生拷贝数缺失。