[发明专利]水稻广谱抗稻瘟病基因Pigm的SNP标记开发和应用有效
| 申请号： | 201811512430.6 | 申请日： | 2018-12-11 |
| 公开（公告）号： | CN109628627B | 公开（公告）日： | 2022-03-18 |
| 发明（设计）人： | 彭佩;江南;李为国;梁毅;肖金华 | 申请（专利权）人： | 华智生物技术有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京市中联创和知识产权代理有限公司 11364 | 代理人： | 康秀敏;王铮 |
| 地址： | 410000 湖*** | 国省代码： | 湖南;43 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 水稻 广谱 稻瘟病 基因 pigm snp 标记 开发 应用 | ||
1.一种与抗稻瘟病基因Pigm紧密连锁的SNP分子标记在检测抗稻瘟病基因Pigm中的应用，其特征在于，所述分子标记是与抗稻瘟病基因Pigm共分离的SNP标记K_060508，所述K_060508的多态性碱基为G或A，所述K_060508位于水稻第6号染色体的第10421726位碱基处；检测所述K_060508的引物组合包括：两条特异性引物：Primer X：5’-CCAAGCAAATTACCACAACG-3’；Primer Y：5’-CCAAGCAAATTACCACAACA-3’；一条通用引物：Primer C：5’-TTGTTATACGGTTTAATTAAGGTGA-3’。
2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述抗稻瘟病基因Pigm紧密连锁的SNP分子标记的检测方法包括如下步骤：
S1、提取水稻样品基因组DNA；
S2、以水稻基因组DNA为模板，利用权利要求1所述引物组合进行KASP反应检测；其中，两条特异性引物分别连接不同的荧光接头；
S3、若只检测到引物Primer Y所连荧光接头对应的荧光信号，则检测位点为碱基A，判断水稻样品为携带抗稻瘟病基因Pigm的纯和型；若只检测到引物Primer X所连荧光接头对应的荧光信号，则检测位点为碱基G，判断水稻样品为不含抗稻瘟病基因Pigm的纯和型；若同时检测到两种荧光，则判断水稻样品为抗稻瘟病基因Pigm的杂合型。
3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，引物Primer Y、Primer X的5’段连接FAM或HEX荧光接头。
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