[发明专利]关系预测方法、装置及电子设备有效
申请号: | 201811516860.5 | 申请日: | 2018-12-12 |
公开(公告)号: | CN109712678B | 公开(公告)日: | 2020-03-06 |
发明(设计)人: | 何松;伯晓晨;宋欣雨;文昱琦;杨晓曦;刘祯 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院 |
主分类号: | G16C20/50 | 分类号: | G16C20/50;G16C20/40 |
代理公司: | 北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙) 11371 | 代理人: | 王术兰 |
地址: | 100000 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 关系 预测 方法 装置 电子设备 | ||
本发明实施例提供一种关系预测方法、装置及电子设备,该关系预测方法包括:分别对多个药物单属性相似性网络、多个靶标单属性相似性网络、多个疾病单属性相似性网络进行融合,得到融合药物相似性网络、融合靶标相似性网络、融合疾病相似性网络;根据融合药物相似性网络、融合靶标相似性网络、融合疾病相似性网络构建三元异质网络;对三元异质网络的网络节点进行预测,得到第一关联关系,该第一关联关系包括第一药靶关联关系、第一药病关联关系、第一靶病关联关系。以此能够充分挖掘药物‑靶标‑疾病三元关联关系信息,融合了药物、疾病和靶标多个属性的相似性网络,不会因使用单一属性带来的偏性从而影响预测结果的准确性。
技术领域
本发明涉及数据分析领域,具体而言,涉及一种关系预测方法、装置及电子设备。
背景技术
对于现有的药靶关联关系预测或者药病关联关系预测方法,只使用了药物、靶标、疾病三者中的一种单一属性数据,仅能得到二元关联关系的预测结果,数据分析较为片面,可靠性低。
发明内容
有鉴于此,本发明实施例的目的在于提供一种关系预测方法、装置及电子设备,以提供可靠、全面的预测数据。
第一方面,本发明实施例提供一种关系预测方法,所述方法包括:
分别对多个药物单属性相似性网络、多个靶标单属性相似性网络、多个疾病单属性相似性网络进行融合,得到融合药物相似性网络、融合靶标相似性网络、融合疾病相似性网络;
根据所述融合药物相似性网络、所述融合靶标相似性网络、所述融合疾病相似性网络构建三元异质网络;
对所述三元异质网络的网络节点进行预测,得到第一关联关系,所述第一关联关系包括第一药靶关联关系、第一药病关联关系、第一靶病关联关系。
通过上述方法,充分利用了多源属性数据的互补性,先得到具有多种属性的融合相似性网络,并考虑到了药物、靶标、疾病之间可能存在隐含的关系,构建了三元异质网络,对所述三元异质网络中的网络节点进行预测,挖掘药、靶、病三者之间的关系,相较于仅考虑单一属性的预测方法而言,预测分析结果更为可靠,数据更为全面。
在一个可能的设计中,在所述分别对多个药物单属性相似性网络、多个靶标单属性相似性网络、多个疾病单属性相似性网络进行融合,得到融合药物相似性网络、融合靶标相似性网络、融合疾病相似性网络之前,所述方法还包括:
根据药物、靶标、疾病各自的属性分别建立多个药物单属性相似性网络、多个靶标单属性相似性网络、多个疾病单属性相似性网络;
其中,任一药物单属性相似性网络表示为药物×药物的相似性矩阵,所述药物×药物的相似性矩阵中的值表示药物的相似性分数;任一靶标单属性相似性网络表示为靶标×靶标的相似性矩阵,所述靶标×靶标的相似性矩阵中的值表示靶标的相似性分数;任一疾病单属性相似性网络表示为疾病×疾病的相似性矩阵,所述疾病×疾病的相似性矩阵中的值表示疾病的相似性分数。
通过上述方法,提供了一种建立单属性相似性网络的可能的实现方式,能够得到所有药物两两之间的相似性、所有靶标两两之间的相似性、所有疾病两两之间的相似性。
在一个可能的设计中,所述根据药物、靶标、疾病各自的属性分别建立多个药物单属性相似性网络、多个靶标单属性相似性网络、多个疾病单属性相似性网络,包括:
对于药物,基于副作用、药物结构、物化性质、治疗属性构建四个药物单属性相似性网络;
对于靶标,基于靶标的共通路、蛋白质-蛋白质相互作用网络的拓扑距离、基因本体论、蛋白质序列构建四个靶标单属性相似性网络;
对于疾病,基于疾病的共通路、疾病本体论、症状构建三个疾病单属性相似性网络。
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