[发明专利]关系预测方法、装置及电子设备有效

专利信息
申请号: 201811516860.5 申请日: 2018-12-12
公开(公告)号: CN109712678B 公开(公告)日: 2020-03-06
发明(设计)人: 何松;伯晓晨;宋欣雨;文昱琦;杨晓曦;刘祯 申请(专利权)人: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
主分类号: G16C20/50 分类号: G16C20/50;G16C20/40
代理公司: 北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙) 11371 代理人: 王术兰
地址: 100000 北*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 关系 预测 方法 装置 电子设备
【说明书】:

发明实施例提供一种关系预测方法、装置及电子设备,该关系预测方法包括:分别对多个药物单属性相似性网络、多个靶标单属性相似性网络、多个疾病单属性相似性网络进行融合,得到融合药物相似性网络、融合靶标相似性网络、融合疾病相似性网络;根据融合药物相似性网络、融合靶标相似性网络、融合疾病相似性网络构建三元异质网络;对三元异质网络的网络节点进行预测,得到第一关联关系,该第一关联关系包括第一药靶关联关系、第一药病关联关系、第一靶病关联关系。以此能够充分挖掘药物‑靶标‑疾病三元关联关系信息,融合了药物、疾病和靶标多个属性的相似性网络,不会因使用单一属性带来的偏性从而影响预测结果的准确性。

技术领域

本发明涉及数据分析领域,具体而言,涉及一种关系预测方法、装置及电子设备。

背景技术

对于现有的药靶关联关系预测或者药病关联关系预测方法,只使用了药物、靶标、疾病三者中的一种单一属性数据,仅能得到二元关联关系的预测结果,数据分析较为片面,可靠性低。

发明内容

有鉴于此,本发明实施例的目的在于提供一种关系预测方法、装置及电子设备,以提供可靠、全面的预测数据。

第一方面,本发明实施例提供一种关系预测方法,所述方法包括:

分别对多个药物单属性相似性网络、多个靶标单属性相似性网络、多个疾病单属性相似性网络进行融合,得到融合药物相似性网络、融合靶标相似性网络、融合疾病相似性网络;

根据所述融合药物相似性网络、所述融合靶标相似性网络、所述融合疾病相似性网络构建三元异质网络;

对所述三元异质网络的网络节点进行预测,得到第一关联关系,所述第一关联关系包括第一药靶关联关系、第一药病关联关系、第一靶病关联关系。

通过上述方法,充分利用了多源属性数据的互补性,先得到具有多种属性的融合相似性网络,并考虑到了药物、靶标、疾病之间可能存在隐含的关系,构建了三元异质网络,对所述三元异质网络中的网络节点进行预测,挖掘药、靶、病三者之间的关系,相较于仅考虑单一属性的预测方法而言,预测分析结果更为可靠,数据更为全面。

在一个可能的设计中,在所述分别对多个药物单属性相似性网络、多个靶标单属性相似性网络、多个疾病单属性相似性网络进行融合,得到融合药物相似性网络、融合靶标相似性网络、融合疾病相似性网络之前,所述方法还包括:

根据药物、靶标、疾病各自的属性分别建立多个药物单属性相似性网络、多个靶标单属性相似性网络、多个疾病单属性相似性网络;

其中,任一药物单属性相似性网络表示为药物×药物的相似性矩阵,所述药物×药物的相似性矩阵中的值表示药物的相似性分数;任一靶标单属性相似性网络表示为靶标×靶标的相似性矩阵,所述靶标×靶标的相似性矩阵中的值表示靶标的相似性分数;任一疾病单属性相似性网络表示为疾病×疾病的相似性矩阵,所述疾病×疾病的相似性矩阵中的值表示疾病的相似性分数。

通过上述方法,提供了一种建立单属性相似性网络的可能的实现方式,能够得到所有药物两两之间的相似性、所有靶标两两之间的相似性、所有疾病两两之间的相似性。

在一个可能的设计中,所述根据药物、靶标、疾病各自的属性分别建立多个药物单属性相似性网络、多个靶标单属性相似性网络、多个疾病单属性相似性网络,包括:

对于药物,基于副作用、药物结构、物化性质、治疗属性构建四个药物单属性相似性网络;

对于靶标,基于靶标的共通路、蛋白质-蛋白质相互作用网络的拓扑距离、基因本体论、蛋白质序列构建四个靶标单属性相似性网络;

对于疾病,基于疾病的共通路、疾病本体论、症状构建三个疾病单属性相似性网络。

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