[发明专利]宫颈小细胞癌相关的HPV整合基因位点及其应用

权利要求书

1.一种用于诊断宫颈小细胞癌的生物标志物，其特征在于，所述生物标志物为以下基因家族：MYC基因家族、NR4A基因家族或ANKRD基因家族或其组合，或其所编码的蛋白，其中，所述生物标志物整合有HPV的部分序列或全部序列。

2.如权利要求1所述的生物标志物，其特征在于，所述MYC基因家族包括MYC基因和MYCN基因；所述NR4A基因家族包括NR4A2基因；所述ANKRD基因家族包括ANKD12基因。

3.如权利要求1或2所述的生物标志物，其特征在于，所述HPV为HPV16和/或HPV18。

4.如权利要求1-3任一项所述的生物标志物，其特征在于，所述生物标志物整合HPV的部分序列或全部序列如SEQ ID NO：97至SEQ ID NO：144所示。

5.如权利要求1-4任一项所述的生物标志物，其特征在于，所述生物标志物整合HPV的部分序列或全部序列产生断点，所述断点包括HPV断点及人基因组上的断点如以下表格

所示。

6.如权利要求1-5任一项所述的生物标志物，其特征在于，所述生物标志物还包括INSM1和/或ASCL1。

7.如权利要求1-6任一项所述的生物标志物，其特征在于，所述生物标志物通过WGS、VCS或免疫组化检测。

8.如权利1-7任一项所述的生物标志物在制备宫颈小细胞癌的诊断标志物或含其的试剂盒中的用途。

9.一种诊断宫颈小细胞癌的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括用于检测如权利要求1-7任一项所述生物标志物的试剂；优选地，所述试剂为引物，更优选地，所述引物的扩增产物为如SEQ ID NO：97至SEQ ID NO：144所示的序列；

最优选地，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，下游核苷酸序列如SEQ IDNO：49所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：2所示，下游核苷酸序列如SEQ IDNO：50所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：3所示，下游核苷酸序列如SEQ IDNO：51所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：4所示，下游核苷酸序列如SEQ IDNO：52所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：5所示，下游核苷酸序列如SEQ IDNO：53所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：6所示，下游核苷酸序列如SEQ IDNO：54所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：7所示，下游核苷酸序列如SEQ IDNO：55所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：8所示，下游核苷酸序列如SEQ IDNO：56所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：9所示，下游核苷酸序列如SEQ IDNO：57所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：10所示，下游核苷酸序列如SEQID NO：58所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：11所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：59所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：12所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：60所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：13所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：61所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：14所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：62所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：15所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：63所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：16所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：64所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：17所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：65所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：18所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：66所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：19所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：67所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：20所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：68所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：21所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：69所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：22所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：70所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ IDNO：23所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：71所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQID NO：24所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：72所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：25所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：73所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：26所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：74所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：27所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：75所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：28所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：76所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：29所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：77所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：30所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：78所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：31所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：79所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：32所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：80所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：33所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：81所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：34所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：82所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：35所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：83所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：36所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：84所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：37所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：85所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：38所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：86所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：39所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：87所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：40所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：88所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：41所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：89所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：42所示，下游核苷酸序列如SEQ IDNO：90所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：43所示，下游核苷酸序列如SEQID NO：91所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：44所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：92所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：45所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：93所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：46所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：94所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：47所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：95所示；或，所述引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO：48所示，下游核苷酸序列如SEQ ID NO：96所示。

10.根据权利要求9所述的试剂盒，其特征在于，还包括DNA提取试剂和PCR扩增用试剂。