[发明专利]一种药物重定位方法、装置、电子设备及存储介质有效
申请号: | 201811521644.X | 申请日: | 2018-12-12 |
公开(公告)号: | CN109637595B | 公开(公告)日: | 2020-04-10 |
发明(设计)人: | 伯晓晨;何松;文昱琦;宋欣雨;刘祯;杨晓曦 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院 |
主分类号: | G16C20/50 | 分类号: | G16C20/50;G16C20/70 |
代理公司: | 北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙) 11371 | 代理人: | 王术兰 |
地址: | 100000 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 药物 定位 方法 装置 电子设备 存储 介质 | ||
1.一种药物重定位方法,其特征在于,包括:
获取不同维度下的药物相似度网络;
通过相似性网络融合算法将不同维度下的药物相似度网络融合成一个目标药物相似度网络;
通过预设规则从所述目标药物相似度网络中筛选出满足药物重定位条件的药物,作为药物重定位的候选药物。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,通过预设规则从所述目标药物相似度网络中筛选出满足药物重定位条件的药物,作为药物重定位的候选药物,包括:
计算所述目标药物相似度网络中每两个药物之间的相似度;
按照从高到低的顺序对计算结果进行排序;
选取排名大于预设阈值的各个药物相似对,作为药物重定位的候选药物。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,通过预设规则从所述目标药物相似度网络中筛选出满足药物重定位条件的药物,作为药物重定位的候选药物,包括:
通过谱聚类算法将所述目标药物相似度网络划分成多个社团;
对所述多个社团中的每个社团进行富集分析,以确定每个社团的主题;
从每个社团中筛选出与自身主题相异的药物,作为药物重定位的候选药物。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述富集分析,包括:对药物类别的富集分析、对靶标类别的富集分析和/或对药物注释的富集分析。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的方法,其特征在于,获取不同维度下的药物相似度网络,包括:
获取以下任意两种或两种以上维度下的药物相似度网络,
其中,第一种维度为:基于药物副作用数据的相似度网络;
第二种维度为:基于药物表达谱数据的相似度网络;
第三种维度为:基于药物三维结构数据的相似度网络;
第四种维度为:基于药物二维结构数据的相似度网络;
第五种维度为:基于药物靶标PPI网络数据的相似度网络;
第六种维度为:基于药物靶标序列数据的相似度网络。
6.一种药物重定位装置,其特征在于,包括:
获取模块,用于获取不同维度下的药物相似度网络;
融合模块,用于通过相似性网络融合算法将不同维度下的药物相似度网络融合成一个目标药物相似度网络;
筛选模块,用于通过预设规则从所述目标药物相似度网络中筛选出满足药物重定位条件的药物,作为药物重定位的候选药物。
7.根据权利要求6所述的装置,其特征在于,所述筛选模块,还用于计算所述目标药物相似度网络中每两个药物之间的相似度;按照从高到低的顺序对计算结果进行排序;选取排名大于预设阈值的各个药物相似对,作为药物重定位的候选药物。
8.根据权利要求6所述的装置,其特征在于,所述筛选模块,还用于通过谱聚类算法将所述目标药物相似度网络划分成多个社团;对所述多个社团中的每个社团进行富集分析,以确定每个社团的主题;从每个社团中筛选出与自身主题相异的药物,作为药物重定位的候选药物。
9.一种电子设备,其特征在于,包括:存储器和处理器,所述存储器和所述处理器连接;
所述存储器用于存储程序;
所述处理器用于调用存储于所述存储器中的程序,以执行如权利要求1-5中任一项所述的方法。
10.一种存储介质,其特征在于,所述存储介质包括计算机程序,所述计算机程序被计算机运行时执行如权利要求1-5任一项所述的方法。
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