[发明专利]水稻抗褐飞虱BPH9复等位基因的通用共显性分子标记及其检测方法和应用

权利要求书

1.水稻抗褐飞虱复等位基因BPH1/10/18/21、BPH2/26、BPH7、BPH9的通用分子标记在检测水稻抗褐飞虱复等位基因BPH1/10/18/21、BPH2/26、BPH7、BPH9或在检测水稻抗褐飞虱性状中的应用，其特征在于，所述通用分子标记位于水稻第12号染色体第22874098~22874099bp处，其多态性为5’-TG-3’/5’-CC-3’/5’-CA-3’。

2.水稻抗褐飞虱复等位基因BPH1/10/18/21、BPH2/26、BPH7、BPH9的通用分子标记在水稻抗褐飞虱分子辅助育种或水稻种质资源改良中的应用，其特征在于，所述通用分子标记位于水稻第12号染色体第22874098~22874099bp处，其多态性为5’-TG-3’/5’-CC-3’/5’-CA-3’。

3.用于检测水稻抗褐飞虱复等位基因BPH1/10/18/21、BPH2/26、BPH7、BPH9的通用分子标记的引物，其特征在于，所述通用分子标记位于水稻第12号染色体第22874098~22874099bp处，其多态性为5’-TG-3’/5’-CC-3’/5’-CA-3’，

所述引物包括：

正向引物1：BPH1/9-RF：5’-TCTCAGCCGCCTGGAATC-3’;

反向引物1：BPH1/9-RR: 5’-TTGCTCCCACCGAAGTCA-3’；

正向引物2：BPH1/9-SF：5’-TGGTGGTTCTCAAGCCCC-3’;

反向引物2：BPH1/9-SR：5’-GTCCTCCTTCAATCTTCGTG-3’。

4.一种用于检测水稻抗褐飞虱复等位基因BPH1/10/18/21、BPH2/26、BPH7、BPH9的试剂盒，其特征在于，包括权利要求3所述的引物。

5.根据权利要求4所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括Mg²⁺、dNTPs、PCR反应缓冲液和DNA聚合酶。

6.权利要求3所述的引物或权利要求4或5所述的试剂盒在检测水稻抗褐飞虱复等位基因BPH1/10/18/21、BPH2/26、BPH7、BPH9或在检测水稻抗褐飞虱性状中的应用。

7.权利要求3所述的引物或权利要求4或5所述的试剂盒在水稻抗褐飞虱分子辅助育种或水稻种质资源改良中的应用。

8.一种检测水稻抗褐飞虱复等位基因BPH1/10/18/21、BPH2/26、BPH7、BPH9的方法，其特征在于，以待测水稻的基因组为模板，利用权利要求3所述的引物或权利要求4或5所述的试剂盒进行扩增，分析扩增产物的序列。

9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，所述分析扩增产物的序列为将扩增产物进行电泳检测，根据电泳条带判断扩增产物的序列。

10.根据权利要求8或9所述的方法，其特征在于，包括如下步骤：

（1）提取待测水稻的基因组DNA；

（2）以所述基因组DNA为模板，利用权利要求3所述的引物或权利要求4或5所述的试剂盒进行PCR扩增；

（3）将扩增产物进行电泳检测，根据电泳条带判断扩增产物的序列；

所述判断扩增产物的序列的标准如下：当扩增产物为360 bp条带时，待测水稻携带BPH1/10/18/21、BPH2/26、BPH7、BPH9抗褐飞虱等位基因的任意一种或两种；当扩增产物为220 bp条带时，待测水稻携带褐飞虱易感等位基因；当扩增产物为360 bp和220 bp两种带型时，待测水稻为BPH1/10/18/21、BPH226、BPH7、BPH9抗褐飞虱等位基因的任意一种和褐飞虱易感等位基因的杂合基因型。