[发明专利]人β地中海贫血基因分型检测的试剂及检测方法在审
申请号: | 201811531566.1 | 申请日: | 2018-12-14 |
公开(公告)号: | CN111321211A | 公开(公告)日: | 2020-06-23 |
发明(设计)人: | 胡晓艳;钟宇萍;吴宇亮;李科铮 | 申请(专利权)人: | 北京大学深圳医院;深圳鼎新融合科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 深圳中一联合知识产权代理有限公司 44414 | 代理人: | 张全文 |
地址: | 518000 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 地中海贫血 基因 检测 试剂 方法 | ||
1.一种人β地中海贫血基因分型检测的试剂,其特征在于,所述试剂包括:
针对βIVSⅡ654基因位点的第一对引物和第一单位点探针;
针对βCD-17基因位点的第二对引物和第二单位点探针;
针对β-28基因位点的第三对引物和第三单位点探针;
针对βCD41-42基因位点的第四对引物和第四单位点探针;
针对βCD-71-72基因位点的第五对引物和第五单位点探针;
针对βCD-26基因位点的第六对引物和第六单位点探针;
其中,所述第一引物对的核酸序列为SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2,所述第一单位点探针的核酸序列为SEQ ID NO:5;
所述第二引物对的核酸序列为SEQ ID NO:6和SEQ ID NO:7,所述第二单位点探针的核酸序列为SEQ ID NO:10;
所述第三引物对的核酸序列为SEQ ID NO:11和SEQ ID NO:12,所述第三单位点探针的核酸序列为SEQ ID NO:15;
所述第四引物对的核酸序列为SEQ ID NO:16和SEQ ID NO:17,所述第四单位点探针的核酸序列为SEQ ID NO:20;
所述第五引物对的核酸序列为SEQ ID NO:21和SEQ ID NO:22,所述第五单位点探针的核酸序列为SEQ ID NO:25;
所述第六引物对的核酸序列为SEQ ID NO:26和SEQ ID NO:27,所述第六单位点探针的核酸序列为SEQ ID NO:30;
其中,所述第一单位点探针、第二单位点探针、第三单位点探针、第四单位点探针、第五单位点探针、第六单位点探针的5'端均连接有荧光报告分子,且3'端均连接有猝灭剂。
2.如权利要求1所述的人β地中海贫血基因分型检测的试剂,其特征在于,所述荧光报告分子包括FAM、HEX、Texas Red和Cy5中的至少一种。
3.如权利要求1所述的人β地中海贫血基因分型检测的试剂,其特征在于,所述猝灭剂包括BHQ1、BHQ2和Dabcyl中的至少一种。
4.如权利要求1~3任一项所述的人β地中海贫血基因分型检测的试剂,其特征在于,所述试剂进行检测时,6个位点用a孔和b孔两个孔检测,每个孔加一个内参基因。
5.如权利要求4所述的人β地中海贫血基因分型检测的试剂,其特征在于,所述的a孔中包括针对a孔的内参基因a的第七对引物和第七单位点探针;所述b孔中包括针对b孔的内参基因b的第八对引物和第八单位点探针。
6.如权利要求5所述的人β地中海贫血基因分型检测的试剂,其特征在于,所述第七引物对的核酸序列为SEQ ID NO:31和SEQ ID NO:32,所述第七单位点探针的核酸序列为SEQID NO:35;
所述第八引物对的核酸序列为SEQ ID NO:36和SEQ ID NO:37,所述第八单位点探针的核酸序列为SEQ ID NO:40。
7.一种人β地中海贫血基因分型的检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
获取待测DNA;
将所述待测DNA与PCR试剂、权利要求1-6任一项所述的试剂混合,进行多重不对称荧光定量PCR扩增,得到熔解曲线的Tm值;
根据所述Tm值,判断所述待测DNA中的βIVSⅡ654、βCD-17、β-28、βCD41-42、βCD-71-72、βCD-26的基因型。
8.如权利要求7所述的检测方法,其特征在于,所述待测DNA来自人的全血、口腔上皮细胞、唾液、皮肤和头发中任一种的全基因组。
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