[发明专利]用于检测直肠癌放化疗敏感性的组合物、微阵列和计算机系统

权利要求书

1.一种用于检测直肠癌放化疗敏感性的组合物，其包括特异性结合至选自由ABL1、AR、CDK1、HDAC1、IRF1、JUN、PRKCB、RELA-3、STAT1-2、SUMO1-3、ACTB、CSNK1G2、FARP1、GAPDH和RPLP0组成的组中的基因的部分连续区域的寡核苷酸。

2.根据权利要求1所述的用于检测直肠癌放化疗敏感性的组合物，其中所述部分连续区域为对应基因的保守区域。

3.根据权利要求1所述的用于检测直肠癌放化疗敏感性的组合物，其中所述寡核苷酸被设计为能够将其一末端固定结合至基材，且至少部分序列能够特异性结合至选自由ABL1、AR、CDK1、HDAC1、IRF1、JUN、PRKCB、RELA-3、STAT1-2、SUMO1-3、ACTB、CSNK1G2、FARP1、GAPDH和RPLP0组成的组中的基因的部分连续区域，从而能够在样品中捕获所需的基因。

4.一种用于检测直肠癌放化疗敏感性的微阵列，其包括根据权利要求1-3任一项所述的组合物和基材，所述基材的表面具有多个独立设置的位点。

5.根据权利要求4所述的用于检测直肠癌放化疗敏感性的微阵列，其中各位点分别具有能够与所述寡核苷酸结合的反应性官能团；或者各位点分别结合所述寡核苷酸中的一种。

6.根据权利要求4或5所述的用于检测直肠癌放化疗敏感性的微阵列，其中各位点以相临位点之间的间隔在0.1-20μm范围内的方式规则排列，各位点的面积小于1μm²。

7.根据权利要求4或5所述的用于检测直肠癌放化疗敏感性的微阵列，其中所述寡核苷酸包括多个靶区域的重复序列，且所述寡核苷酸的序列长度为50-500nt。

8.根据权利要求4-7任一项所述的用于检测直肠癌放化疗敏感性的微阵列的使用方法，其包括：

(1)提取待检样品总RNA，并反转录为待杂交产物的步骤；

(2)在适于反应的条件下使所述待杂交产物与微列阵反应的步骤；

(3)检测杂交信号获得基因检测数据的步骤。

9.一种用于检测直肠癌放化疗敏感性的计算机系统，其包括：

a.用于接收对象数据的输入装置，其中所述对象数据包括来自根据权利要求4-7任一项所述的微阵列的基因检测数据；

b.具有数据库的存储器，其用于存储至少所述基因检测数据；

c.处理器，其与存储器进行通信，且被配置为：

利用所述基因检测数据通过算法模型计算敏感性指数；和

d.配置为根据所述敏感性指数发送通知的输出装置。

10.根据权利要求9所述的用于检测直肠癌放化疗敏感性的计算机系统，其中所述算法模型为：

RSI＝-0.0098009×(AR)+0.0128283×(JUN)+0.0254552×(STAT1-2)-0.0017589×(PRKCB)-0.0038171×(RELA-3)+0.1070213×(ABL1)-0.0002509×(SUMO1-3)-0.0092431×(CDK1)-0.0204469×(HDAC1)-0.0441683×(IRF1)；

所述基因检测数据包括激光共聚焦扫描所述微阵列得到的荧光信号的强度和比值。