[发明专利]基于UBXN11基因多态性位点预测A(H7N9)易感人群的用途及试剂盒及方法有效
申请号: | 201811545165.1 | 申请日: | 2018-12-17 |
公开(公告)号: | CN109536600B | 公开(公告)日: | 2021-11-05 |
发明(设计)人: | 张曦;赵雪;秦胜营;贺林;滕峥;袁政安;李崇山;王嘉瑜;房方皓;匡小舟 | 申请(专利权)人: | 上海市疾病预防控制中心;上海交通大学 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
代理公司: | 上海天翔知识产权代理有限公司 31224 | 代理人: | 吕伴 |
地址: | 200336 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 ubxn11 基因 多态性 预测 h7n9 感人 用途 试剂盒 方法 | ||
本发明所公开的一种基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的用途,其特征在于,所述的UBXN11基因多态性位点为rs189256251,其中,所述的UBXN11基因rs189256251多态性位点有两种基因型,分别为CT和CC,当rs189256251多态性位点基因型为CT时,预测该样本为A(H7N9)易感人群,当rs189256251多态性位点基因型为CC时,预测该样本为A(H7N9)非易感人群。本发明还公开了一种基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的试剂盒及基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的分析方法。通过本发明所提供的预测A(H7N9)易感人群的方法快速、简便、有效、准确度高,为预测A(H7N9)易感人群后续靶向药的研制和进一步发病机理的研究提供了新的思路和方向。
技术领域
本发明涉及生物分析应用领域,具体涉及一种基于UBXN11基因多态性位点预测A(H7N9)易感人群的用途及试剂盒及方法。
背景技术
A(H7N9)禽流感疫情给疾病防控带来较大挑战。2013年2月一种可感染人的A(H7N9)禽流感病毒首次在上海被发现报道。到2016年8月,三年多时间确诊患者807例,病死率达40.0%,疫情出现了三次流行高峰。不断出现的病例,较高的病死率和持续扩大的地域给疾病预防带来巨大挑战,给公众造成心理恐慌。对病毒的研究发现,该病毒同时带有可以结合禽的α-2,3和人的α-2,6唾液酸受体,相对于其他禽流感,人群对其更易感。同时,家庭聚集性病例提示有限的人-人传播,病毒内部基因在进化过程中呈现“本地化”特质,使其作为“大流行潜力株”进一步引起国际上重点关注。
UBX(泛素调控X因子)蛋白质家族在泛素化相关的过程中起着重要的作用,如细胞周期调控、转录调控、信号转导、发育、胁迫响应、细胞程序性死亡、内吞作用和DNA修复。
UBXN11基因编码的蛋白是UBX家族的成员之一,这个蛋白C端有一个松散的UBX结构域,3-D结构显示,在UBXN11蛋白的3’端活性结构域有一个Arg400His错义突变。以往研究表明,UBXN11与EIF4E及RNF213有相互作用,EIF4B和RNF5分别是EIF4E和RNF213的类似物,EIF4B和RNF5通过调节信号通路对抗流感病毒的感染。另一篇研究中提到,UBX家族的另一个成员,UBXN11的同源蛋白UBXN1,在宿主调控抗流感免疫反应中起到重要作用。以上证据提示我们,UBXN11在宿主应对流感病毒过程中也起到重要作用。
发明内容
为了克服现有技术所存在的上述缺陷,本发明的目的之一在于提供一种基于UBXN11基因多态性位点预测A(H7N9)易感人群的用途。
本发明的目的之二在于提供一种基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的试剂盒。
本发明的目的之三在于提供一种基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的分析方法。
为了实现本发明的目的之一,所采用的技术方案是:一种基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的用途,所述的UBXN11基因多态性位点为rs189256251,其中,所述的UBXN11基因rs189256251多态性位点有两种基因型,分别为CT和CC,当rs189256251多态性位点基因型为CT时,预测该样本为A(H7N9)易感人群,当rs189256251多态性位点基因型为CC时,预测该样本为A(H7N9)非易感人群。
在本发明的一个优选实施例中,其中,rs189256251的多态性位点基因序列为:
其中,B为特异性位点,CC基因型的特异性位点为C;CT基因型的特异性位为T。
为了实现本发明的目的之二,所采用的技术方案是:一种基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的试剂盒,包含以下组成部分:
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