[发明专利]DNA编码化合物库中On-DNA芳硝基化合物还原成On-DNA芳胺化合物的方法有效
申请号: | 201811546746.7 | 申请日: | 2018-12-18 |
公开(公告)号: | CN109680342B | 公开(公告)日: | 2021-09-28 |
发明(设计)人: | 吴阿亮;温石阳;曲毅;徐艳芬;袁友浪;张朝欣;裴增飞;陈雯婷;李科;蒯乐天;杨洪芳;彭宣嘉 | 申请(专利权)人: | 上海药明康德新药开发有限公司 |
主分类号: | C40B40/06 | 分类号: | C40B40/06;C40B50/08;C40B70/00 |
代理公司: | 上海浦一知识产权代理有限公司 31211 | 代理人: | 郑权 |
地址: | 200131 上海市浦东*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | dna 编码 化合物 on 硝基 还原 方法 | ||
1.一种DNA编码化合物库构建中的由On-DNA芳硝基化合物经还原反应将硝基还原为氨基制备On-DNA芳胺化合物的方法,其特征在于,所述On-DNA芳硝基化合物的结构式为:DNA-Ar-NO2,所述On-DNA芳胺化合物的结构式为:DNA-Ar-NH2;其中,
结构式中的DNA是由经人工修饰的和/或未修饰的核苷酸单体聚合得到的单链或双链的核苷酸链;
其中,结构式中的Ar是单环或双环的芳香环,所述On-DNA芳硝基化合物的-NO2连接于Ar的环上,所述On-DNA芳胺化合物的NH2连接于Ar的环上;
其中,结构式中的DNA与Ar通过一个或多个化学键连接;
将DNA-Ar-NO2溶于浓度为250 mM且pH = 9.4的硼酸缓冲液中至摩尔浓度为0.1~2.0mM,加入10~2000摩尔当量的硼试剂,20~100 °C下反应1~24小时直至反应结束;
所述硼试剂为四羟基二硼。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述Ar选自以下基团:
R1为氢、卤素、氨基、硝基、氰基、羟基、巯基、芳基甲酮、烷基甲酮、C1-C12烷基、C1-C6烯烃基、C1-C6炔烃基、C3-C8环烷基、C1-C6烷基氧基、C1-C6烷基氨基中的任意一种,Ar上有一个或多个R1基团;R2为连接DNA部分的功能团,所述R2是氨基、羧基、醛基、芳卤中的任意一种;X为O、S、NH或烷基取代氨基中的任意一种;
所述卤素:指氟、氯、溴、或碘;
所述C1-C12烷基:指C1-C12的直链或支链烷基;
所述C1-C6烯烃基:指直链或支链烯烃基,含有一个或多个烯烃基团;
所述C1-C6炔烃基:指直链或支链炔烃基,含有一个或多个炔烃基团;
所述C3-C8环烷基:指饱和或不饱和的环烷基。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述DNA-Ar-NO2溶于硼酸缓冲液后的摩尔浓度是0.1 mM,0.2 mM,0.3 mM,0.4 mM,0.5 mM,0.6 mM,0.7 mM,0.8 mM,0.9 mM,1.0 mM,1.1mM,1.2 mM,1.3 mM,1.4 mM,1.5 mM,1.6 mM,1.7 mM,1.8 mM,1.9 mM或2.0 mM。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述硼试剂是10~1000摩尔当量。
5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述硼试剂是10摩尔当量,20摩尔当量,30摩尔当量,40摩尔当量,50摩尔当量,60摩尔当量,70摩尔当量,80摩尔当量,90摩尔当量,100摩尔当量,150摩尔当量,200摩尔当量,250摩尔当量,300摩尔当量,350摩尔当量,400摩尔当量,450摩尔当量,500摩尔当量,550摩尔当量,600摩尔当量,650摩尔当量,700摩尔当量,750摩尔当量,800摩尔当量,850摩尔当量,900摩尔当量,950摩尔当量,或1000摩尔当量。
6.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述还原反应的反应温度为20 °C,25 °C,30°C,35 °C,40 °C,45 °C,50 °C,55 °C,60 °C,65 °C,70 °C,75 °C,80 °C,85 °C,90 °C,95°C,或100 °C。
7.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述还原反应的反应时间为1小时,2小时,3小时,4小时,5小时,6小时,7小时,8小时,9小时,10小时,11小时,12小时,13小时,14小时,15小时,16小时,17小时,18小时,19小时,20小时,21小时,22小时,23小时,或24小时。
8.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法用于批量的多孔板操作。
9.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法用于多孔板的DNA编码化合物库的合成。
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