[发明专利]一种与水稻抗稻瘟病基因Pi2紧密连锁的分子标记R061007及应用

说明书

一种与水稻抗稻瘟病基因Pi2紧密连锁的分子标记R061007及应用。本发明属于分子生物学领域，涉及一种分子标记，具体的，涉及一种与水稻抗稻瘟病基因Pi2紧密连锁的分子标记，该分子标记含有Seq ID No.1所示序列。本发明还涉及扩增该分子标记的引物、该分子标记和引物在水稻抗稻瘟病基因Pi2定位或水稻遗传育种中的用途，以及一种水稻育种方法。本发明公开的与水稻抗稻瘟病基因Pi2紧密连锁的分子标记、扩增引物可以对水稻抗稻瘟病基因Pi2进行良好分型，可以用于水稻抗稻瘟病的分子标记辅助育种，为实现水稻抗稻瘟病性状的早期鉴定和筛选育种提供分子辅助技术支持，对于加快水稻品种的遗传选育和改良进程具有重要的理论和实践指导意义。

技术领域

本发明属于分子生物学领域，涉及一种分子标记，特别是涉及一种水稻抗稻瘟病基因Pi2紧密连锁的分子标记。本发明还涉及扩增该分子标记的引物、该分子标记和引物在水稻抗稻瘟病基因Pi2定位或水稻遗传育种中的用途。

背景技术

水稻(Oryza sativa)是我国最重要的粮食作物之一，全国水稻种植面积约占粮食作物面积的30％，产量接近粮食总产量的一半，稻谷是我国60％以上人口的主食。

稻瘟病是水稻重要病害之一，可引起大幅度减产，严重时减产40％～50％，甚至颗粒无收。稻瘟病是真菌寄生引起，稻瘟病菌主要以分生孢子和菌丝在病稻或病谷上越冬。到第二年，当温度、湿度适宜稻瘟病菌生长时，病菌就会产生大量的分生孢子，青灰色霉即是病菌的分生孢子，病害的扩展靠分生孢子在空气中传播，当分生孢子接触寄主表皮上的机动细胞后，其尖端释放的粘胶及芽胞使孢子紧密地附着在寄主上，接着分生孢子便利用自身孢子的内源营养而萌发形成发芽管，发芽管又特异性分化产生具黑色素的附着胞，附着胞产生侵染栓穿透寄主组织的角质层和表皮细胞壁，继而在寄主细胞中生长，侵染邻近表皮细胞并深入叶肉细胞，稻瘟病菌侵染水稻5～7天后出现症状，完成侵染后，被侵染的细胞又产生新的菌丝和分生孢子梗，分生孢子梗又分化出分生孢子并从病斑中释放出来，依靠气流再次传播，形成重复侵染。稻瘟病在水稻的各个时期及各部位都有发生，四叶期至分蘖期和抽穗期最易感染稻瘟病，以叶瘟和穗瘟最为常见，危害也最大。为保证水稻高产、稳产，人们主要采用两种防治技术，一是用化学防治方法，二是培育和种植抗病品种。由于化学防治成本高且污染环境，因此培育和种植抗病品种成为水稻育种的主要目标。

传统抗病育种是根据分离群体的表现和育种者的经验进行选择，通常受环境条件、显隐性关系、基因上位等因素的影响，费时、费力、不准确，从鉴定一个植物抗病种到培育出抗病良种需花费十多年时间，而病原菌一旦侵袭，其扩散速度要比育种速度快得多。

近年来生物技术的发展，尤其是分子标记技术的应用给水稻遗传育种带来了巨大变化。分子标记辅助选择(Marker Assisted Selection，MAS)为育种者提供了对目标性状进行选择的有效手段，它大大加速了育种进程，提高了育种选择效率，同时减少了盲目选择和人力、物力的大量浪费，展示出极其广阔的应用前景。

分子标记辅助选择是借助与目标基因紧密连锁的分子标记鉴定群体中是否含有目标基因个体的技术。MAS技术可以大大缩短育种选育的周期，使育种家更快获得遗传稳定的目标单株。对于粒型性状这类的数量性状而言，利用分子标记能够在育种中对有利的基因和数量性状位点(quantitative trait locus,QTLs)进行动态跟踪，可以把这些有利的QTLs聚合到目标育种材料中，从而培育出性能更加优秀的新品种。因此，开展MAS的关键在于重要性状相关QTLs的定位及相关分子标记开发。

自1923年Sasaki首次描述水稻抗稻瘟病基因以来，目前已有近百个水稻抗稻瘟病基因被鉴定。众多抗稻瘟病基因的遗传规律已基本清楚且已被初步定位。在已定位的抗稻瘟病基因中，超过半数的基因以基因簇的形式分布于水稻的不同染色体区域。