[发明专利]一种微生物多样性的提取方法在审

专利信息
申请号: 201811566799.5 申请日: 2018-12-19
公开(公告)号: CN109609492A 公开(公告)日: 2019-04-12
发明(设计)人: 侯明飞;肖聪;朱月艳;孙子奎 申请(专利权)人: 上海派森诺生物科技股份有限公司
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10
代理公司: 上海天翔知识产权代理有限公司 31224 代理人: 吕伴
地址: 200030 上海市*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 微生物多样性 深孔板 混匀 破碎处理 人员操作 室温放置 样品细胞 冰浴 磁珠 样本 节约
【说明书】:

发明提供了一种微生物多样性的提取方法,包括如下步骤:样品细胞破碎处理步骤;96孔板提取步骤:13000×g(12000rpm)室温离心5min。转移600μl上清至96深孔板中,加入200μl Buffer SP2后混匀,加入100μl HTR Reagent;冰浴5min。4000×g(3700rpm)离心10min;转移上清400μl至96深孔板中,加入40μl磁珠,450μl Binding Buffer,混匀,室温放置2min;后借助仪器进行96孔板的操作。本发明通过更简便和稳定快速的方法,节约了人员操作时间,减少了因多个步骤所导致的误差,在大批量样本的处理时,也具规范性和可操作性。

技术领域

本发明涉及微生物分析技术领域,具体涉及一种微生物多样性的提取方法。

背景技术

随着生物学的发展,对于环境中微生物的研究逐渐增加,而从环境中提取菌群总DNA的方法是进行分析的关键,伴随着技术的成熟及其样本数量的增加,单管提取DNA已经不适合大批量的操作。

现有的微生物多样性的提取方法为单管提取,而当样本量较大时,单管提取需要耗费更多的人力物力,而目前对于样本提取而进行后续DNA分析的大量需求的大背景下,如何提高样本提取的效率的同时保证提取的质量,是目前提取方法的主要发展方向。

发明内容

为了克服现有技术所存在的上述缺陷,本发明的目的之一在于提供一种微生物多样性的提取方法。

为了实现本发明的目的之一,所采用的技术方案是:一种微生物多样性的提取方法,包括如下步骤:

样品细胞破碎处理步骤;

96孔板提取步骤;其中,96孔板处理步骤包括:13000×g(12000rpm)室温离心5min。转移600μl上清至新的96深孔板中,加入200μlBuffer SP2,用手轻轻振荡混匀,加入100μl HTR Reagent(用前混匀,吸取时要注意粘稠,可以适当剪一下枪头),振荡混匀充分;冰浴5min-10min。4000×g(3700rpm)离心10-15min;小心地转移上清400μl至96深孔板中,加入40μl磁珠,450μl Binding Buffer,混匀,室温放置2min;后续借助相关仪器进行96孔板的操作。

在本发明的一个优选实施例中,所述的一种微生物多样性的提取方法具体包括以下步骤:

1)将预处理好的样品放到对应编号且预装有500mg glassbeads的2ml离心管中;

2)向上述样品管中加入0.8ml Buffer SLX Mlus,于组织破碎仪25HZ振荡7-10min;

3)加入80μl Buffer DS,振荡混匀;

4)90℃孵育10-15min,孵育期间颠倒离心管以混匀其中液体1~2次(因不知样品中是否含有难裂解的细菌,故将孵育温度提高至90℃);

5)13000×g(12000rpm)室温离心5min。转移600μl上清至新的96深孔板中,加入200μlBuffer SP2,用手轻轻振荡混匀。加入100μl HTR Reagent(用前混匀,吸取时要注意粘稠,可以适当剪一下枪头),振荡混匀充分;

6)冰浴5-10min。4000×g(3700rpm)离心10min;

7)小心地转移上清400μl至96深孔板中,加入40μl磁珠,450μl Binding Buffer,混匀,室温放置2-5min;

8)后续借助相关仪器进行96孔板的操作。

本发明的有益效果在于:

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