[发明专利]一种马铃薯杂交育种亲本的选择方法有效
申请号: | 201811572281.2 | 申请日: | 2018-12-21 |
公开(公告)号: | CN109566398B | 公开(公告)日: | 2022-06-03 |
发明(设计)人: | 黄三文;张春芝;唐蝶 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院农业基因组研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;G16B20/20;A01H1/02;A01H1/04 |
代理公司: | 北京布瑞知识产权代理有限公司 11505 | 代理人: | 孟潭 |
地址: | 518124 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 马铃薯 杂交育种 亲本 选择 方法 | ||
1.一种马铃薯杂交育种亲本的选择方法,其特征在于,所述亲本包括父本和母本,所述父本和所述母本通过所述父本与所述母本之间的相同有害突变的比例而从亲本样本中进行选择;
所述相同有害突变的比例低于所述亲本样本相同有害突变比例的平均值;
所述相同有害突变的比例的计算公式为:
其中,ratio表示父本和母本之间相同有害突变的比例,a表示父本和母本中均为纯合的有害突变的数目;b表示父本为纯合,母本为杂合,或父本为杂合,母本为纯合的有害突变的数目;c表示父本和母本均为杂合的有害突变的数目,d表示父本和母本共同检测到的有害突变的数目;
所述相同有害突变为利用SIFT软件检测每个SNP位点时,所得的SIFT分值小于等于0.05的位点;
所述平均值是通过将所有亲本样品中任意两份样品之间相同有害突变进行比较计算出两两之间相同有害突变的值,再根据两两之间相同有害突变的值计算出平均值。
2.根据权利要求1所述的马铃薯杂交育种亲本的选择方法,其特征在于,所述相同有害突变的比例等于或低于0.3。
3.根据权利要求1所述的马铃薯杂交育种亲本的选择方法,其特征在于,所述平均值为0.3、0.29、0.28、0.27、0.26、0.25、0.24、0.23、0.22、0.21、0.2、0.19、0.18、0.17、0.16、0.15、0.14、0.13、0.12、0.11、0.10、0.09、0.08、0.07、0.06、0.05或0.04;或所述相同有害突变的比例为0.29、0.28、0.27、0.26、0.25、0.24、0.23、0.22、0.21、0.2、0.19、0.18、0.17、0.16、0.15、0.14、0.13、0.12、0.11、0.10、0.09、0.08、0.07、0.06、0.05或0.04。
4.如权利要求1所述的马铃薯杂交育种亲本的选择方法,其特征在于,所述相同有害突变为利用SIFT软件检测每个SNP位点时,所得的SIFT分值小于等于0.05的位点。
5.如权利要求1所述的马铃薯杂交育种亲本的选择方法,其特征在于,所述有害突变分布于近着丝粒区域。
6.如权利要求1所述的马铃薯杂交育种亲本的选择方法,其特征在于,所述方法具体包括:
(1)预测所述父本与所述母本之间相同有害突变的比例并分析其在染色体上的分布;
(2)选择所述父本与所述母本之间相同有害突变的比例低的作为杂交育种的亲本。
7.如权利要求6所述的马铃薯杂交育种亲本的选择方法,其特征在于,所述预测是通过对所述父本与所述母本进行基因组测序,根据全基因组测序结果进行预测。
8.一种马铃薯育种方法,其特征在于,由权利要求1-7中任一项所述的马铃薯杂交育种亲本的选择方法选择出的马铃薯亲本进行杂交产生后代。
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