[发明专利]一种目标DNA富集的方法和应用有效
申请号: | 201811583375.X | 申请日: | 2018-12-24 |
公开(公告)号: | CN109355288B | 公开(公告)日: | 2020-12-08 |
发明(设计)人: | 王永利;宋卓 | 申请(专利权)人: | 人和未来生物科技(长沙)有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人: | 李小焦;彭家恩 |
地址: | 410000 湖南省长沙市高新*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 目标 dna 富集 方法 应用 | ||
1.一种目标DNA富集的方法,其特征在于:包括以下步骤,
蛋白核酸复合物制备步骤,包括将同源重组酶与待测样本的单链DNA组装成稳定的蛋白核酸复合物;
同源性重组步骤,包括采用带有生物素标记的与目标DNA具有同源性的双链DNA探针与所述蛋白核酸复合物反应,在同源重组酶的作用下,双链DNA探针与单链的目标DNA结合;
生物素标记分离步骤,包括利用所述双链DNA探针中的生物素标记,将与之结合的同源性单链目标DNA分离、富集;
所述双链DNA探针采用以下方法制备获得,
采用扩增引物对待测样本的DNA进行PCR扩增,并且,在PCR扩增的过程中,采用的dATP、dGTP、dCTP和dTTP中的至少一种带有生物素标记;PCR扩增产物即双链DNA探针;其中,扩增引物能够特异性的扩增待测样本的目标DNA的全部或部分序列。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:还包括解组装步骤,所述解组装步骤包括,在生物素标记分离步骤之后,采用解组装试剂,使富集的单链目标DNA从蛋白核酸复合物中解离出来。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:还包括对待测样本的核酸进行变性处理,获得单链DNA。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于:在进行变性处理之前或之后对待测样本进行打断处理。
5.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:所述生物素标记分离步骤,具体采用亲和素修饰的磁珠进行。
6.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:所述同源重组酶为RecA、RecBCD、RecF、RecO、RecR、Rad51和Mre11-Rad50中的至少一种。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于:所述同源重组酶为RecA或Rad51。
8.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:所述所述双链DNA探针的长度为50bp-100bp。
9.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:所述双链DNA探针,其制备方法还包括对PCR扩增产物进行打断处理,获得长度为50bp-100bp的双链DNA探针。
10.根据权利要求9所述的方法,其特征在于:所述双链DNA探针,其制备方法还包括对PCR扩增产物或打断处理的产物进行纯化,获得双链DNA探针。
11.根据权利要求1-10任一项所述的方法在目标DNA的测序或文库构建中的应用。
12.一种目标DNA的文库构建方法,其特征在于:包括采用权利要求1-10任一项所述的方法对目标DNA进行富集,然后再进行后续的文库构建步骤。
13.一种目标DNA的测序方法,其特征在于:包括采用权利要求12所述的文库构建方法制备测序文库,然后对制备的测序文库进行测序。
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