[发明专利]多重引物组及利用该引物组基于高通量测序构建人类T细胞免疫组库的方法在审
申请号: | 201811597549.8 | 申请日: | 2018-12-26 |
公开(公告)号: | CN109554440A | 公开(公告)日: | 2019-04-02 |
发明(设计)人: | 李艳艳;尚小云;张金凤;马立敏;张通 | 申请(专利权)人: | 山东艾克韦生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12N15/11;C12N15/10;C40B50/06 |
代理公司: | 济南泉城专利商标事务所 37218 | 代理人: | 张贵宾 |
地址: | 250000 山东省济南市高新*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 构建 测序引物 条码 引物 高通量测序 多重引物 免疫组库 特异性引物 人类T细胞 上游引物 下游引物 引物组 串联 分子生物学检测 多样性信息 全面覆盖 恒定区 可变区 | ||
1.一种多重引物组,其特征在于:由一组上游引物和一条下游引物组成,所述上游引物由接头1、引物条码1、测序引物1、针对可变区V区设计的特异性引物V1-V24串联而成;所述下游引物由接头2、引物条码2、测序引物2、针对恒定区C区设计的特异性引物Vc串联而成;引物条码1和引物条码2的序列不同;测序引物1与测序引物2序列相同。
2.如权利要求1所述的多重引物组,其特征在于:接头1序列为AAT GAT ACG GCG ACCACC GAG ATC TAC AC;接头2序列为CAA GCA GAA GAC GGC ATA CGA GAT。
3.如权利要求1所述的多重引物组,其特征在于:测序引物1与测序引物2的序列为GCTCTT CCG ATC T。
4.如权利要求1所述的多重引物组,其特征在于:引物条码1、引物条码2由6个或者8个核苷酸组成,不同样本的引物条码1、引物条码2间至少有一个核苷酸的差异。
5.如权利要求1所述的多重引物组,其特征在于,
上游引物中特异性引物V1-V24分别为:
V1:5′ CAA CAG TTC CRT GAC TMG CAC-3′
V2:5′- CAT ATG AGA WTG GAT TAG TCA TT-3′
V3:5′- TAC TTT AAY AAC AAC GCT CCG-3′
V4:5′- TCT CGA AAA KAG AAG ACG TAT-3′
V5:5′- GAG TCA GGA MTG CCA CAG GAA-3′
V6:5′- AGG CCT SAG GGA TCC AGC TC-3′
V7:5′- GAC AAA GGA GW A GTC AGA GAT-3′
V8:5′- ACA GTC TCC TCT ATA AGG ACG-3′
V9:5′-TCT AGA GAG TTC AAG GAG CGC-3′
V10:5′- GAT ATG AGA ATG AGG AYG CAG-3′
V11:5′- TCA ACC ARG CAA CGG TGA CCT-3′
V12:5′- TTC AGT GAG AYA CAG ARA AAC-3′
V13:5′- CTG AAT GCC AAT ACA GMT CTC-3′
V14:5′- GAC CAA CCT GAA GTC CMC AAT-3′
V15:5′- TCT GAG GTG GGG CAG AYT CTC-3′
V16:5′- CAC AGA AAG TAA AMG ATT TTC AG-3′
V17:5′- GAG TCT TTT CAG GAT GTG TCC-3′
V18:5′-TCA TTT CGT AAC ATG AAA AMA TGC-3′
V19:5′- AAA GAT TTT CAG AAT GAA YCA GAC-3′
V20:5′- GTC TCT CGAGCA GCA CAM GCT-3′
V21:5′- CAG AGA TCA CTG AAA GAT TCG A-3′
V22:5′- CCT AAC TAT AMC TCT GAG GTG-3′
V23:5′- AAA TCT GCA GAC AYA GAT CAC-3′
V24:5′- GTT GGT GAG RGT GCA ACT GCC-3′;
下游引物中特异性引物为:
Vc:5‘- GTGTCATGGGTTCACMTTYTTCAGGTGC -3'。
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