[发明专利]一种用于进行族源推断的复合体系及其推断方法和应用

说明书

本发明公开了一种用于进行族源推断的复合体系及其推断方法和应用。该复合体系包括用于扩增20个AIMs位点的复合引物，以及与上述20个AIMs位点一一对应的单碱基延伸引物；复合引物具体序列如SEQ ID NO.1～40所示，单碱基延伸引物具体序列如SEQ ID NO.41～60所示。本发明采用20个特异性AIMs位点的组合构成了能对未知个体进行有效的复合扩增的检测体系。

技术领域

本发明属于法医检测技术领域，具体涉及一种用于进行族源推断的复合体系及其推断方法和应用。

背景技术

族源推断是通过评估一系列祖先信息标记(Ancestry Informative Markers,AIMs)从而推断未知来源样本或个体的地理起源或其遗传信息中不同地理起源成分的构成比例。在法医的实践应用中，当数据库中缺少与嫌疑人匹配的数据时，进行推断能提供更多的线索。近年来，报道了许多以单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)和插入缺失标记(InDels)作为族源推断的位点组合(panel)，大多数位点组合可以区分三到五个群体，一般是区分不同大陆地区的祖先来源，例如非洲、欧洲、亚洲、美洲等。但是针对亚群内部进行区分的位点组合很少，而且目前研究报道的进行亚群祖先推断的位点组合都是在已有的位点组合中进行进一步的筛选得到的，因此为了更精细的区分亚群，我们需要寻找新的次级的祖先信息标记的组合。

发明内容

针对现有技术中的上述不足，本发明提供一种用于进行族源推断的复合体系及其推断方法和应用，提供一种对更精细的区分亚群进行族源推断的方法。

为实现上述目的，本发明解决其技术问题所采用的技术方案是：

一种用于进行族源推断的复合体系，包括用于扩增20个AIMs位点的复合引物，以及与上述20个AIMs位点一一对应的单碱基延伸引物；所述位点包括rs200189385、rs76102765、rs201197181、rs3827760、rs17034666、rs922452、rs1426654、rs57108441、rs12441154、rs12440301、rs1834640、rs72643557、rs72643559、rs434124、rs10444771、rs174592、rs1071803、rs9805939、rs34505674以及rs59950930；

用于扩增20个AIMs位点的复合引物具体序列如下所示：

rs1071803-F:AGACCTACATCTGCAACGTGA；(SEQ ID NO.1)

rs1071803-R:CTGGACTGGGGCTGCATAG；(SEQ ID NO.2)

rs34505674-F:ACAGAACAGAAGTGCCAGGA；(SEQ ID NO.3)

rs34505674-R:GGACAAGTGACCTCAGGCAT；(SEQ ID NO.4)

rs12440301-F:TAGTGCACACCTACCCCAAG；(SEQ ID NO.5)

rs12440301-R:AGCCAATTCTAGACTCCACCT；(SEQ ID NO.6)

rs1426654-F:TCAGCCCTTGGATTGTCTCA；(SEQ ID NO.7)

rs1426654-R:TGCCAATATCTCCCTTTGTGAT；(SEQ ID NO.8)

rs174592-F:CGCCGAGAAAATGAAGCCTT；(SEQ ID NO.9)

rs174592-R:TCTGAGCAGGAACGTGGATT；(SEQ ID NO.10)