[发明专利]一种检测基因突变的试剂盒、方法及其用途在审
申请号: | 201811628231.1 | 申请日: | 2018-12-28 |
公开(公告)号: | CN109971832A | 公开(公告)日: | 2019-07-05 |
发明(设计)人: | 李兴民;杨欢欢 | 申请(专利权)人: | 浙江数问生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6827 | 分类号: | C12Q1/6827;C12Q1/6883;C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 北京商专永信知识产权代理事务所(普通合伙) 11400 | 代理人: | 邬玥;方挺 |
地址: | 313200 浙江省湖州*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 试剂盒 种检测 模板合成 扩增 检测 基因转录物 检测灵敏度 逆转录产物 第二引物 第一引物 基因突变 临床样本 逆转录酶 全血样本 突变序列 基因 混合酶 突变型 突变 样本 | ||
1.一种用于检测来自人的生物样本中基因突变的试剂盒,其特征在于,包括一对能够扩增所述基因的DNA序列的第一引物组,一对能够扩增所述基因转录物的逆转录产物序列的第二引物组,以及由依RNA为模板合成DNA的逆转录酶与依DNA为模板合成DNA的DNA聚合酶组成的混合酶,
其中,所述第一引物组包括第一上游引物和第一下游引物,所述第二引物组包括第二上游引物和第二下游引物,
优选地,所述第一引物组与所述第二引物组扩增所述基因的同一外显子,更优选地,所述第一上游引物和所述第二上游引物相同,所述第一下游引物和所述第二下游引物相同,
优选地,所述转录物为mRNA,所述逆转录产物为cDNA。
2.根据权利要求1所述试剂盒,其特征在于,所述第一上游引物和所述第一下游引物中至少有一个是ARMS引物,所述第二上游引物和所述第二下游引物中至少有一个是ARMS引物,
优选地,所述第一上游引物和所述第一下游引物中一个是ARMS引物,另一个是通用引物,更优选地,所述第一上游引物是ARMS引物,所述第一下游引物是通用引物,
优选地,所述第二上游引物和所述第二下游引物中一个是ARMS引物,另一个是通用引物,更优选地,所述第二上游引物是ARMS引物,所述第二下游引物是通用引物,
优选地,所述试剂盒还包括探针,所述探针序列能够与扩增产物结合,更优选地,所述试剂盒还包括阻断DNA序列。
3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括探针,所述探针能够与突变型基因的扩增产物结合。
4.根据权利要求1-3所述的试剂盒,其特征在于,还包括dNTP、缓冲液,
优选地,还包括内控引物,
优选地,还包括核酸提取试剂,更优选地,所述核酸提取试剂包括DNA提取试剂和RNA提取试剂,更优选地,所述核酸提取试剂可以同时提取DNA和RNA。
5.一种用于检测来自人的生物样本中基因突变的反应体系,其特征在于,所述反应体系中同时包含DNA和RNA,还同时包含依RNA为模板合成DNA的逆转录酶和依DNA为模板合成DNA的DNA聚合酶,
优选地,所述反应体系包含一对能够扩增所述基因的DNA序列的第一引物组,以及一对能够扩增所述基因转录物的逆转录产物序列的第二引物组。
6.一种检测人生物样本中基因突变的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取或获取所述生物样本中的核酸,
(2)对步骤(1)获得的核酸进行检测,
其中,所述生物样本是全血样本,优选地,所述全血样本中包括红细胞、血小板、外泌体,更优选地,所述全血样本不包括白细胞,
优选地,所述核酸为DNA和/或RNA。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述基因为基因,优选地,所述基因选自EGFR、ALK、ROS1、BRAF、KRAS和PD-L1中的至少一种。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述生物样本来自肿瘤患者,更优选地,所述肿瘤为浸润性肿瘤,更优选地,所述肿瘤包括肺癌、甲状腺结节、黑色素瘤、结直肠癌,最优选地,所述肺癌为非小细胞肺癌。
9.根据权利要求6-8任一所述的方法,其特征在于,
任选地,所述步骤(2)是利用定量PCR进行的,优选地,是利用荧光定量PCR进行的,
任选地,所述步骤(2)是利用测序方法进行的,优选地,是利用二代测序或三代测序方法进行的。
10.一种检测生物样本中基因突变的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取或获取所述生物样本中的总核酸,
(2)在同一个反应体系中对步骤(1)获得的总核酸进行检测,
其中,所述总核酸为DNA和RNA,
优选地,所述生物样本为血浆或全血,
优选地,所述生物样本为组织,更优选地,所述组织为新鲜组织或甲醛固定石蜡包埋组织,
优选地,所述生物样本为胸腹水。
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