[发明专利]一种检测基因突变的试剂盒、方法及其用途在审

专利信息
申请号: 201811628231.1 申请日: 2018-12-28
公开(公告)号: CN109971832A 公开(公告)日: 2019-07-05
发明(设计)人: 李兴民;杨欢欢 申请(专利权)人: 浙江数问生物技术有限公司
主分类号: C12Q1/6827 分类号: C12Q1/6827;C12Q1/6883;C12Q1/6886;C12N15/11
代理公司: 北京商专永信知识产权代理事务所(普通合伙) 11400 代理人: 邬玥;方挺
地址: 313200 浙江省湖州*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 试剂盒 种检测 模板合成 扩增 检测 基因转录物 检测灵敏度 逆转录产物 第二引物 第一引物 基因突变 临床样本 逆转录酶 全血样本 突变序列 基因 混合酶 突变型 突变 样本
【权利要求书】:

1.一种用于检测来自人的生物样本中基因突变的试剂盒,其特征在于,包括一对能够扩增所述基因的DNA序列的第一引物组,一对能够扩增所述基因转录物的逆转录产物序列的第二引物组,以及由依RNA为模板合成DNA的逆转录酶与依DNA为模板合成DNA的DNA聚合酶组成的混合酶,

其中,所述第一引物组包括第一上游引物和第一下游引物,所述第二引物组包括第二上游引物和第二下游引物,

优选地,所述第一引物组与所述第二引物组扩增所述基因的同一外显子,更优选地,所述第一上游引物和所述第二上游引物相同,所述第一下游引物和所述第二下游引物相同,

优选地,所述转录物为mRNA,所述逆转录产物为cDNA。

2.根据权利要求1所述试剂盒,其特征在于,所述第一上游引物和所述第一下游引物中至少有一个是ARMS引物,所述第二上游引物和所述第二下游引物中至少有一个是ARMS引物,

优选地,所述第一上游引物和所述第一下游引物中一个是ARMS引物,另一个是通用引物,更优选地,所述第一上游引物是ARMS引物,所述第一下游引物是通用引物,

优选地,所述第二上游引物和所述第二下游引物中一个是ARMS引物,另一个是通用引物,更优选地,所述第二上游引物是ARMS引物,所述第二下游引物是通用引物,

优选地,所述试剂盒还包括探针,所述探针序列能够与扩增产物结合,更优选地,所述试剂盒还包括阻断DNA序列。

3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括探针,所述探针能够与突变型基因的扩增产物结合。

4.根据权利要求1-3所述的试剂盒,其特征在于,还包括dNTP、缓冲液,

优选地,还包括内控引物,

优选地,还包括核酸提取试剂,更优选地,所述核酸提取试剂包括DNA提取试剂和RNA提取试剂,更优选地,所述核酸提取试剂可以同时提取DNA和RNA。

5.一种用于检测来自人的生物样本中基因突变的反应体系,其特征在于,所述反应体系中同时包含DNA和RNA,还同时包含依RNA为模板合成DNA的逆转录酶和依DNA为模板合成DNA的DNA聚合酶,

优选地,所述反应体系包含一对能够扩增所述基因的DNA序列的第一引物组,以及一对能够扩增所述基因转录物的逆转录产物序列的第二引物组。

6.一种检测人生物样本中基因突变的方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)提取或获取所述生物样本中的核酸,

(2)对步骤(1)获得的核酸进行检测,

其中,所述生物样本是全血样本,优选地,所述全血样本中包括红细胞、血小板、外泌体,更优选地,所述全血样本不包括白细胞,

优选地,所述核酸为DNA和/或RNA。

7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述基因为基因,优选地,所述基因选自EGFR、ALK、ROS1、BRAF、KRAS和PD-L1中的至少一种。

8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述生物样本来自肿瘤患者,更优选地,所述肿瘤为浸润性肿瘤,更优选地,所述肿瘤包括肺癌、甲状腺结节、黑色素瘤、结直肠癌,最优选地,所述肺癌为非小细胞肺癌。

9.根据权利要求6-8任一所述的方法,其特征在于,

任选地,所述步骤(2)是利用定量PCR进行的,优选地,是利用荧光定量PCR进行的,

任选地,所述步骤(2)是利用测序方法进行的,优选地,是利用二代测序或三代测序方法进行的。

10.一种检测生物样本中基因突变的方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)提取或获取所述生物样本中的总核酸,

(2)在同一个反应体系中对步骤(1)获得的总核酸进行检测,

其中,所述总核酸为DNA和RNA,

优选地,所述生物样本为血浆或全血,

优选地,所述生物样本为组织,更优选地,所述组织为新鲜组织或甲醛固定石蜡包埋组织,

优选地,所述生物样本为胸腹水。

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