[发明专利]一种快速定量硅藻细胞密度的分子检测方法有效
申请号: | 201811629453.5 | 申请日: | 2018-12-28 |
公开(公告)号: | CN109457017B | 公开(公告)日: | 2023-03-14 |
发明(设计)人: | 毕永红;常志兵;梁建奎;刘洋;米武娟;宋高飞 | 申请(专利权)人: | 中国科学院水生生物研究所 |
主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851;C12Q1/06 |
代理公司: | 武汉宇晨专利事务所(普通合伙) 42001 | 代理人: | 江丽丽;王敏锋 |
地址: | 430000 *** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 定量 硅藻 细胞 密度 分子 检测 方法 | ||
1.一种快速定量硅藻细胞密度的分子检测方法,其步骤是:
A、采集待测水样,经0.22μm或0.45μm的滤膜过滤,将过滤得到的藻类样本进行总基因组DNA的提取和纯化;
B、将提取纯化的DNA通过荧光定量PCR对rbcL基因进行扩增和定量,荧光定量PCR的正向引物序列如SEQ ID NO.1所示,反向引物序列如SEQ ID NO.2所示,目标产物大小为280bp,反应完成后记录样品的Ct值;
C、标准曲线的制作:取细胞密度已知的单种培养或纯培养硅藻作为标准藻株,提取其基因组总DNA,梯度稀释后作为标准模板,依照上述荧光定量PCR方法与待测样品同时进行定量PCR扩增,反应结束后,根据标准藻株各个稀释浓度梯度的Ct值绘制荧光定量PCR标准曲线,作为待测水样中硅藻细胞密度的计算依据;待测样品的Ct值应落在绘制标准曲线的Ct值范围内;
D、根据待测样品的Ct值和标准曲线计算样品rbcL基因的拷贝数,样品中硅藻的细胞密度等同于所述的拷贝数;
步骤C中的标准藻株选自直链藻、小环藻、冠盘藻、脆杆藻或针杆藻中的任意一种;
荧光定量PCR的反应程序为:95℃预变性5min,接着40个循环,每个循环包括95℃15s、60℃30s和72℃30s,每个循环完成后进行一次荧光检测。
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