[发明专利]同步检测鉴定禽类、鱼类、反刍类三大类成分的多重液相基因芯片的核酸和方法及试剂盒有效

专利信息
申请号: 201811644290.8 申请日: 2018-12-30
公开(公告)号: CN109609662B 公开(公告)日: 2022-02-15
发明(设计)人: 陈茹;高小博;梅明珠;段燕喻;刘志玲;翁文川;阳静 申请(专利权)人: 广州海关技术中心
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12Q1/6837;C12N15/11
代理公司: 北京中济纬天专利代理有限公司 11429 代理人: 杨永莉
地址: 510623 广东省广州*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 同步 检测 鉴定 禽类 鱼类 反刍 大类 成分 多重 基因芯片 核酸 方法 试剂盒
【权利要求书】:

1.一组用于同步检测禽类、鱼类、反刍类三大类成分的多重液相基因芯片的引物及探针,其特征在于,由禽类、鱼类、反刍类中各类别的通用上游引物、通用下游引物和通用探针组成,其中,所述禽类的通用上游引物序列如SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示,其通用下游引物序列如SEQ ID No.3所示,通用探针如SEQ ID No.4所示;

所述鱼类的通用上游引物序列如SEQ ID No.5所示,其通用下游引物序列如SEQ IDNo.6所示,通用探针如SEQ ID No.7;

所述反刍类的通用上游引物序列如SEQ ID No.8所示,其通用下游引物序列如SEQ IDNo.9所示,通用探针如SEQ ID No.10所示;其中,SEQ ID No.10中的R表示简并碱基,代表G或A;

所有下游引物的5’端标记生物素,所有探针的5’端C12标记氨基。

2.一种用于同步检测禽类、鱼类、反刍类三大类物种成分的多重液相基因芯片的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括如权利要求1所述的禽类、鱼类、反刍类的各类别通用上游引物、通用下游引物和通用探针。

3.如权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,还包括2×PCR缓冲液和DNA聚合酶,其中,所述2×PCR缓冲液中包括:浓度为40mmol/L、pH8.0的Tris-HCl,8mmol/L的MgCl2,400μmol/L的dNTP,300mmol/L的KCl,1mg/mL的BSA和体积浓度为6%的甘油。

4.一种用于同步检测禽类、鱼类、反刍类三大类物种成分的多重液相基因芯片的方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:

S1、提取待检样品中的核酸;

S2、利用如权利要求1所述的用于检测鉴定禽类、鱼类、反刍类三大类成分的液相基因芯片的通用上游引物、通用下游引物对上述步骤S1提取的待检样品中的核酸进行不对称PCR扩增,获得PCR扩增产物;

S3、利用分别偶联有如上所述禽类、鱼类、反刍类的通用探针的聚苯乙烯乳胶微球,与步骤S2获得的扩增产物进行杂交反应;

S4、用液相芯片仪检测步骤S3杂交反应后的信号值即MFI值,根据检测的本底值,判定检测结果;

其中,所述本底值的设定:同步平行设定3个空白对照进行上述步骤S2、步骤S3的反应,其中在所述空白对照,用水取代待测样品模板,其余试剂成分与反应条件不变;计算3个空白对照的测得的MFI值的平均值,作为本底值;

结果判定:当被检样品的MFI值大于5倍本底值时,判为阳性,否则判为阴性。

5.如权利要求4所述的方法,其特征在于,步骤S2中,所述PCR扩增的扩增体系,包括禽类、鱼类、反刍类的各类别通用上游引物、通用下游引物、PCR缓冲液、DNA聚合酶、待检样品模板和水;其中,禽类的通用上游引物SEQ ID No.1终浓度为20nmol/L,SEQ ID No.2的终浓度为50nmol/L,禽类的通用下游引物的终浓度为120nmol/L;鱼类的通用上游引物的终浓度为50nmol/L,其通用下游引物终浓度为120nmol/L;反刍类的通用上游引物终浓度为50nmol/L,其通用下游引物终浓度为120nmol/L。

6.如权利要求4所述的方法,其特征在于,步骤S2中,所述PCR扩增的扩增反应条件为:95℃预变性2分钟;95℃变性5秒,58℃退火8秒,72℃延伸2秒,共进行35个循环;最后72℃延伸1分钟;4℃停留。

7.如权利要求4所述的方法,其特征在于,步骤S3中,所述杂交反应包括:

S301、将禽类、鱼类、反刍类的通用探针偶联到聚苯乙烯乳胶微球,所述聚苯乙烯乳胶微球带有COOH;

S302、将步骤S2获得的扩增产物与上述步骤S301中偶联聚苯乙烯乳胶微球的探针进行杂交反应;

S303、杂交反应后,进行洗涤,之后加入链亲和素藻红蛋白进行温育,

S304、取步骤S303获得的溶液进行检测MFI值。

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