[发明专利]用于游离循环肿瘤DNA提取的增强剂、提取外周血中游离循环肿瘤DNA的试剂盒及方法有效
申请号: | 201811645358.4 | 申请日: | 2018-12-30 |
公开(公告)号: | CN109371018B | 公开(公告)日: | 2022-04-22 |
发明(设计)人: | 潘晓西;姬晓勇;霍旭;王建伟;伍启熹;刘倩;刘珂弟;唐宇 | 申请(专利权)人: | 北京优迅医疗器械有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 赵囡囡;金田蕴 |
地址: | 100195 北京市海淀区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 游离 循环 肿瘤 dna 提取 增强 外周血中 试剂盒 方法 | ||
1.一种用于游离循环肿瘤DNA提取的增强剂,其特征在于,包括:1μg/μL~5μg/μLCarrier RNA、1μg/μL~5μg/μL多聚腺苷酸、1μg/μL~5μg/μL糖原、0~5μg/μL线性丙烯酰胺、1μg/μL~5μg/μL酵母tRNA、2μg/μL~10μg/μL大马哈鱼精子DNA和/或鲱鱼精子DNA和水;所述多聚腺苷酸的残基数为2100~10000nt,所述线性丙烯酰胺的重均分子量为100万~500万;所述Carrier RNA、所述多聚腺苷酸、所述糖原、所述线性丙烯酰胺、所述酵母tRNA、所述大马哈鱼精子DNA和所述鲱鱼精子DNA的质量比例为1:1:1:1:1:1:1。
2.一种提取外周血中游离循环肿瘤DNA的试剂盒,其特征在于,包括如权利要求1所述的用于游离循环肿瘤DNA提取的增强剂。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括磁珠悬浮液、SDS溶液、裂解结合液、蛋白酶K、蛋白酶溶解缓冲液、第一洗涤液、第二洗涤液和洗脱液。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述裂解结合液包含45mmol/L Tris-HCl、120mmol/LNaCl、30mmol/L乙二胺四乙酸二钠、10~30mol/L异硫氰酸胍、2~4mol/L醋酸钾和5wt~10%吐温20,pH值为7.6。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述SDS溶液浓度为10%。
6.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述蛋白酶溶解缓冲液包含45~75mmol/L Tris-HCl和100~120mmol/LNaCl。
7.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,所述第一洗涤液包含45~75mmol/LTris-HCl、100~120mmol/LNaCl、30~60mmol/L乙二胺四乙酸二钠和1.5wt%曲拉通,pH值为8.0。
8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述第二洗涤液包含80%的乙醇。
9.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述洗脱液为无核酸酶水。
10.一种提取外周血中游离循环肿瘤DNA的方法,其特征在于,采用如权利要求2至9中任一项所述的试剂盒进行提取外周血中游离循环肿瘤DNA。
11.根据权利要求10所述的方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)预先将1mg蛋白酶K预先溶于500~1000μL蛋白酶溶解缓冲液中形成蛋白酶K溶液,向离心管中加入15μL所述蛋白酶K溶液和50μLSDS溶液;
2)转移1mL血清或血浆样品至含15μL所述蛋白酶K溶液和50μL所述SDS溶液所述离心管中;
3)置于水浴锅里60℃孵育10min,每隔5min涡旋混匀1次;冰上放置5min;
4)加入15μL磁珠悬浮液、1250μL裂解结合液至所述离心管中,涡旋混匀30秒,再加入2μL增强剂,室温颠倒混匀15分钟;
5)转移至磁力架上,静置3分钟吸附磁珠,吸弃溶液;
6)加入500μL第一洗涤液,涡旋混匀30秒;
7)转移至磁力架上,静置3分钟吸附磁珠,吸弃溶液;
8)加入500μL第二洗涤液,涡旋混匀30秒;
9)转移至磁力架上,静置3分钟吸附磁珠,吸弃溶液;
10)重复步骤8)和9)一次;
11)离心,收集管所述离心管壁上的液滴,转移至磁力架上,吸弃溶液;
12)空气干燥3~5分钟;
13)加52μL的洗脱液,涡旋打散磁珠,室温放置5~10分钟,期间震荡2~3次加速DNA溶解;
13)转移至磁力架上,静置3分钟,转移溶解的DNA至新的离心管中保存,所述溶解的DNA即为游离循环肿瘤DNA。
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