[发明专利]KCNH2基因SCD相关SNP检测试剂盒及检测方法有效

专利信息
申请号: 201811651391.8 申请日: 2018-12-31
公开(公告)号: CN109457019B 公开(公告)日: 2021-10-15
发明(设计)人: 张更谦;陈德青;严江伟 申请(专利权)人: 山西医科大学
主分类号: C12Q1/6858 分类号: C12Q1/6858;C12Q1/6883
代理公司: 太原华弈知识产权代理事务所 14108 代理人: 李毅
地址: 030001 山*** 国省代码: 山西;14
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摘要:
搜索关键词: kcnh2 基因 scd 相关 snp 检测 试剂盒 方法
【权利要求书】:

1.一种KCNH2基因SCD相关SNP的检测试剂盒,包括SEQ ID NO. 1~32所示的16对特异性多重PCR引物对,以及SEQ ID NO. 33~82所示的50个SNaPshot单碱基延伸引物,用于检测以下50个SNP分子标记中的任意两个或两个以上:

rs199472936、rs143167166、rs199473547、rs199473032、rs151031345、rs36210421、rs141117135、rs199473016、rs121912506、rs773724817、rs794728395、rs794728393、rs199472970、rs41307295、rs199473039、rs199472944、rs199473522、rs794728483、rs199472926、rs121912504、rs199472918、rs794728364、rs730880118、rs794728431、rs199472934、rs1016101226、rs199472941、rs199473428、rs12720441、rs199472851、rs189014161、rs199472912、rs199472942、rs794728382、rs199472894、rs1338579153、rs199472842、rs878853771、rs367570298、rs199472899、rs794728434、rs794728366、rs143518632、rs142590566、rs199472947、rs199473416、rs199472838、rs199472952、rs199472835、rs794728475。

2.根据权利要求1所述的检测试剂盒,其特征是所述SEQ ID NO. 1~32所示的16对特异性多重PCR引物对通过扩增同时得到包含有不同SNP的扩增子,每段扩增子至少含有1个SNP,最多含有7个SNP。

3.根据权利要求1或2所述的检测试剂盒,其特征是所述16对特异性多重PCR引物对分别用于对应扩增以下所述的SNP分子标记:

rs36210421的PCR引物对为序列SEQ ID NO. 1所示的上游引物和SEQ ID NO. 2所示的下游引物;

rs142590566的PCR引物对为序列SEQ ID NO. 3所示的上游引物和SEQ ID NO. 4所示的下游引物;

rs141117135、rs199473016的PCR引物对为序列SEQ ID NO. 5所示的上游引物和SEQID NO. 6所示的下游引物;

rs199472970、rs41307295、rs199473039、rs199472944、rs199473522、rs199472934、rs199472936的PCR引物对为序列SEQ ID NO. 7所示的上游引物和SEQ ID NO. 8所示的下游引物;

rs1016101226的PCR引物对为序列SEQ ID NO. 9所示的上游引物和SEQ ID NO. 10所示的下游引物;

rs794728364、rs730880118、rs794728431的PCR引物对为序列SEQ ID NO. 11所示的上游引物和SEQ ID NO. 12所示的下游引物;

rs773724817、rs794728395、rs121912506、rs794728393的PCR引物对为序列SEQ IDNO. 13所示的上游引物和SEQ ID NO. 14所示的下游引物;

rs151031345的PCR引物对为序列SEQ ID NO. 15所示的上游引物和SEQ ID NO. 16所示的下游引物;

rs367570298、rs199472899、rs199472894、rs794728434、rs794728366的PCR引物对为序列SEQ ID NO. 17所示的上游引物和SEQ ID NO. 18所示的下游引物;

rs794728483、rs199472926、rs121912504、rs199472918的PCR引物对为序列SEQ IDNO. 19所示的上游引物和SEQ ID NO. 20所示的下游引物;

rs199472912、rs878853771的PCR引物对为序列SEQ ID NO. 21所示的上游引物和SEQID NO. 22所示的下游引物;

rs12720441、rs189014161的PCR引物对为序列SEQ ID NO. 23所示的上游引物和SEQID NO. 24所示的下游引物;

rs199472941、rs199473428、rs199472942、rs143518632、rs199472947、rs199472952的PCR引物对为序列SEQ ID NO. 25所示的上游引物和SEQ ID NO. 26所示的下游引物;

rs794728382、rs1338579153的PCR引物对为序列SEQ ID NO. 27所示的上游引物和SEQID NO. 28所示的下游引物;

rs143167166、rs199473547、rs199473032的PCR引物对为序列SEQ ID NO. 29所示的上游引物和SEQ ID NO. 30所示的下游引物;

rs199472851、rs199472842、rs199473416、rs199472838、rs199472835、rs794728475的PCR引物对为序列SEQ ID NO. 31所示的上游引物和SEQ ID NO. 32所示的下游引物。

4.根据权利要求1所述的检测试剂盒,其特征是所述SEQ ID NO. 33~82所示的SNaPshot单碱基延伸引物分别对应以下各自的SNP分子标记:

rs199472936的延伸引物序列为SEQ ID NO. 33;rs143167166的延伸引物序列为SEQID NO. 34;rs199473547的延伸引物序列为SEQ ID NO. 35;rs199473032的延伸引物序列为SEQ ID NO. 36;rs151031345的延伸引物序列为SEQ ID NO. 37;rs36210421的延伸引物序列为SEQ ID NO. 38;rs141117135的延伸引物序列为SEQ ID NO. 39;rs199473016的延伸引物序列为SEQ ID NO. 40;rs121912506的延伸引物序列为SEQ ID NO. 41;rs773724817的延伸引物序列为SEQ ID NO. 42;rs794728395的延伸引物序列为SEQ IDNO. 43;rs794728393的延伸引物序列为SEQ ID NO. 44;rs199472970的延伸引物序列为SEQ ID NO. 45;rs41307295的延伸引物序列为SEQ ID NO. 46;rs199473039的延伸引物序列为SEQ ID NO. 47;rs199472944的延伸引物序列为SEQ ID NO. 48;rs199473522的延伸引物序列为SEQ ID NO. 49;rs794728483的延伸引物序列为SEQ ID NO. 50;rs199472926的延伸引物序列为SEQ ID NO. 51;rs121912504的延伸引物序列为SEQ ID NO. 52;rs199472918的延伸引物序列为SEQ ID NO. 53;rs794728364的延伸引物序列为SEQ IDNO. 54;rs730880118的延伸引物序列为SEQ ID NO. 55;rs794728431的延伸引物序列为SEQ ID NO. 56;rs199472934的延伸引物序列为SEQ ID NO. 57;rs1016101226的延伸引物序列为SEQ ID NO. 58;rs199472941的延伸引物序列为SEQ ID NO. 59;rs199473428的延伸引物序列为SEQ ID NO. 60;rs12720441的延伸引物序列为SEQ ID NO. 61;rs199472851的延伸引物序列为SEQ ID NO. 62;rs189014161的延伸引物序列为SEQ ID NO. 63;rs199472912的延伸引物序列为SEQ ID NO. 64;rs199472942的延伸引物序列为SEQ IDNO. 65;rs794728382的延伸引物序列为SEQ ID NO. 66;rs199472894的延伸引物序列为SEQ ID NO. 67;rs1338579153的延伸引物序列为SEQ ID NO. 68;rs199472842的延伸引物序列为SEQ ID NO. 69;rs878853771的延伸引物序列为SEQ ID NO. 70;rs367570298的延伸引物序列为SEQ ID NO. 71;rs199472899的延伸引物序列为SEQ ID NO. 72;rs794728434的延伸引物序列为SEQ ID NO. 73;rs794728366的延伸引物序列为SEQ IDNO. 74;rs143518632的延伸引物序列为SEQ ID NO. 75;rs142590566的延伸引物序列为SEQ ID NO. 76;rs199472947的延伸引物序列为SEQ ID NO. 77;rs199473416的延伸引物序列为SEQ ID NO. 78;rs199472838的延伸引物序列为SEQ ID NO. 79;rs199472952的延伸引物序列为SEQ ID NO. 80;rs199472835的延伸引物序列为SEQ ID NO. 81;rs794728475的延伸引物序列为SEQ ID NO. 82。

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