[实用新型]一种工业化DNA合成柱板有效

专利信息
申请号: 201820931538.8 申请日: 2018-06-15
公开(公告)号: CN209352873U 公开(公告)日: 2019-09-06
发明(设计)人: 车雷;车力 申请(专利权)人: 深圳市百迈生命科学有限公司
主分类号: C12M1/00 分类号: C12M1/00
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 518000 广东省深圳市罗湖区*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 装配位 圆柱体空腔 方体 空板 空柱 柱板 合成 本实用新型 工业化合成 圆锥体空腔 等距分布 梯度减小 圆柱空腔 出液口 高效率 圆锥 底端 管内 突变 自动化 体内
【说明书】:

实用新型涉及DNA合成领域,具体涉及一种工业化DNA合成柱板,包括CPG载体、空柱管和96孔空板,CPG载体的直径≥4mm,CPG载体的厚度≥4mm;空柱管内设置有装配位,装配位的内径≥4mm,装配位的高度≥4mm,装配位为方体或圆柱体,装配位以外的内径梯度减小;96孔空板,板体内均匀等距分布着96个孔,每个孔均设有装配位,每个孔为方体或圆柱空腔设计,再通过圆锥体空腔过渡到圆柱体空腔装配位,装配位以为圆锥或圆柱体空腔设计,直至底端出液口部分。本实用新型的工业化DNA合成柱板,适合于DNA的大量、工业化合成,DNA合成量可升至50umol,达到毫克级别,且合成链长达120‑200bp,合成速度快,高效率,突变率可低至0.5‰以下,使用工艺简便,工业化、自动化程度高。

技术领域

本实用新型涉及DNA合成领域,具体涉及一种工业化DNA合成柱板。

背景技术

随着合成生物学、人造生命、功能基因组学、蛋白组学、靶药合成、核苷酸干扰药物、DNA编码化合物库、临床诊断学研究的快速发展,需要海量DNA的工业化合成,而且靶向药物、核苷酸干扰药物、 DNA编码化合物库的快速、工业化合成逐渐成为新药研发与筛选的热门。必将对DNA合成的CPG载体的合成柱板提出更高的功能需求。目前,公知的一种DNA合成板是由96根DNA合成柱管排列而成,将CPG 载体填装于96根合成柱空柱管内合适的装配位中,放入配套的DNA 合成仪上进行DNA的合成。合成产品质量的好坏,很大程度上取决于96孔空板的设计与注塑和CPG载体的研发与生产。现行的DNA合成柱或板,仍然存在一些不足,具体表现在如下几个方面:

第一,目前的DNA合成柱板主要为常规用量DNA合成设计,比如≤200nmol。主要用于常规PCR Primer合成。不适合于≥200nmol, 甚至umol乃至mg级别的DNA工业化合成。

第二,目前的设计,没有最优化的试剂使用量,使得产品使用成本高,造成浪费,且对环境造成污染。就CPG载体系列产品而言,所使用的试剂,目前主要成本在于辅助试剂,如TCA、ACN、碘液、四氢呋喃等,使用量大导致成本居高不下,而且,这些合成试剂都是具有化学腐蚀性的,对人体以及环境都会带来很大的损害。如何最大限度的降低合成试剂的使用量是对合成生物学发展的推动,也是行业发展的迫切需求。

第三,目前CPG载体的结构设计也有很多缺点:其一,CPG载体的直径和厚度过小,由于受到现有条件的限制,市售的CPG载体最大直径仍然在4mm以下,高度基本也小于4mm,总体体积≤50.24ul,在这么小的体积内增加载体的规模非常受限制的,所以其含量规模也就只能做到200nmol左右。无法满足工业化DNA合成对量的需求;其二,CPG含量无法增加,用于靶向药物、核苷酸干扰药物、DNA编码化合物库合成的DNA合成柱板,其CPG含量在1umol-10umol之间,甚至更大才能能够满足药物开发和筛选的要求,然而目前市售的CPG 载体含量大都在200nmol以下,合成出来的DNA产品远远满足不了工业化客户的需求,用200nmol的市售合成柱造成了严重的资源浪费,增加了科研和生产成本,不利于建设节约型社会。

第四,自动化程度不高,无论装填还是产品使用,基本为人工操作,操作极为不便,增加了成本,不利于自动化、规模化生产。

第五,空柱管或96孔板的结构设计也有很多缺点,主要表现在没有考虑设备兼容性、装配精度、96孔板与设备的密封性、96孔板的防溅液和防污染性。目前主流的DNA合成仪有Biolytic公司的Dr.Oligo192系列、Bioaotumation公司的MM192系列、TAG CopenhagenA/S公司Oligomaker192系列,Thermo Fisher公司的 192系列,现在市售的几款DNA合成柱或板,对于以上几家公司的合成仪都无法做到完全兼容或通用。由于96孔板设计问题,其与设备的密封圈密封性不是太好,容易漏气,导致DNA合成失败。并且,孔的设计不够完美,孔与孔之间的设计也不够完善,导致加入孔内的试剂容易飞溅出来,累积起来的液珠,由于96孔板上表面孔与孔之间平整无遮挡,而容易滚到相邻孔里,导致合成突变率过高,DNA合成失败。

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