[发明专利]单光源双光通道测序在审
申请号: | 201880009537.0 | 申请日: | 2018-03-06 |
公开(公告)号: | CN110234771A | 公开(公告)日: | 2019-09-13 |
发明(设计)人: | 罗伯特·兰洛伊斯;约翰·维切利;刘小海 | 申请(专利权)人: | ILLUMINA公司;伊鲁米纳剑桥有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6874 | 分类号: | C12Q1/6874;B01J19/00;G01N21/64 |
代理公司: | 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司 11204 | 代理人: | 王达佐;洪欣 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 波长 荧光发射 核苷酸鉴定 检测器检测 检测器 核苷酸序列 多核苷酸 预定波长 激光器 单光源 检测 处理器 测序 双光 光源 配置 | ||
1.用于测定多核苷酸的核苷酸序列的系统,其包括:
单光源,其配置成刺激荧光的发射;
至少一个检测器,其配置成检测连接至核苷酸的荧光团的荧光发射,所述至少一个检测器配置成检测在第一波长和第二波长处的荧光发射;
处理器,其配置成执行进行方法的指令,所述方法包括:
从所述光源生成光至核苷酸上;
当所述至少一个检测器没有检测到荧光发射时,鉴定所述核苷酸为第一类型;
当所述至少一个检测器检测到光在第一波长处的荧光发射时,鉴定所述核苷酸为第二类型;
当所述至少一个检测器检测到光在第二波长处的荧光发射时,鉴定所述核苷酸为第三类型;和
当所述至少一个检测器检测到光在第一波长和第二波长处的荧光发射时,鉴定所述核苷酸为第四类型。
2.如权利要求1所述的系统,其中所述处理器还配置成确定所述荧光发射中的一种或多种的强度。
3.如权利要求2所述的系统,其中所述处理器还配置成通过颜色校正所述强度来确定所述荧光发射中的一种或多种的强度。
4.如权利要求3所述的系统,其中颜色校正所述强度包括估计颜色矩阵。
5.如权利要求4所述的系统,其中估计所述颜色矩阵包括:
从在两个通道中观察到的强度的散点图生成半径加权的角度直方图;和
估计半径加权的角度直方图中的两个外局部最大值θ1和θ2的角度
其中所述颜色矩阵是
6.如权利要求1所述的系统,其中所述系统包括用于具有至少一个流体通道的流动池的安装台。
7.如权利要求1所述的系统,其中所述光源是激光器,并且其中由所述激光器生成的光的预定波长为400nm至800nm。
8.如权利要求1所述的系统,其中所述光源是发光二极管,并且其中由所述发光二极管生成的光的预定波长为400nm至800nm。
9.如权利要求1所述的系统,其中所述至少一个检测器配置成检测来自相同荧光标签的光的至少两种波长。
10.如权利要求1所述的系统,其中所述第一波长和所述第二波长彼此间隔至少10nm。
11.如权利要求1所述的系统,其中所述第一波长和所述第二波长彼此间隔至多100nm。
12.如权利要求1所述的系统,其中所述处理器还配置成鉴定所述荧光发射中的所述第一波长和所述第二波长之间的串扰。
13.用于测定多核苷酸的核苷酸序列的计算机实施的方法,其包括:
使用光源生成荧光发射至连接至核苷酸的荧光团上;
使用至少一个检测器检测连接至所述核苷酸的荧光团在第一波长和第二波长处的荧光光发射;和
鉴定所述核苷酸,其包括:
当所述至少一个检测器没有检测到荧光发射时,鉴定所述核苷酸为第一类型;
当所述至少一个检测器检测到光在第一波长处的荧光发射时,鉴定所述核苷酸为第二类型;
当所述至少一个检测器检测到光在第二波长处的荧光发射时,鉴定所述核苷酸为第三类型;和
当所述至少一个检测器检测到光在第一波长和第二波长处的荧光发射时,鉴定所述核苷酸为第四类型。
14.如权利要求13所述的方法,其中检测荧光发射包括颜色校正荧光发射。
15.如权利要求13所述的方法,其中所述光源是激光器,并且其中由所述激光器生成的光的预定波长为450nm至490nm。
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