[发明专利]用于确定对象中的感染水平的组合物和方法

说明书

本文提供了构造用于快速检测来自患者样品的疾病特异性肽的纳米颗粒，所述患者样品包括基于血液的样品。还提供了通过分离和定量来自患者样品的疾病特异性肽来测量感染水平的方法。该纳米颗粒用作用于基质辅助激光解吸/电离质谱的共基质。

相关申请的交叉引用

本申请要求2017年2月17日提交的发明名称为“COMPOSITION AND METHODS OFDETERMINING A LEVEL OF ACTIVE MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS INFECTION IN ASUCBJECT”的美国临时专利申请第62/460,280号的权益；所述申请的全部内容通过引用并入本文。

政府支持

本发明是在美国国立卫生研究院(National Institute of Health)批准的基金号R01-AI113725-01A1和R01-AI-122932-01A1的政府支持下完成的。

政府对本发明拥有部分权益。

引用序列表、表格、或计算机程序

与本说明书同时经由EFS-Web以ASCII格式文本文件提交了序列表的官方复印件，文件名称为“PCT1Sequence Listing_ST25.txt”，建立日期2018年1月29日，大小为2kb。经由EFS-Web提交的序列表是本说明书的一部分，并且通过引用以其全文并入本文。

技术领域

本发明一般涉及用于确定对象中的疾病水平的组合物和方法；更具体而言涉及用于选择性识别和靶向代表对象样品中的感染物的一个或多个生物标志物的组合物和方法；还更具体地涉及用于选择性靶向和富集样品内经识别的生物标志物的组合物和方法，其中在样品测试期间所述生物标志物促进标靶生物分子的信号增强。

背景技术

传染病由传染物引起并可传染。传染病占世界总死亡人数的四分之一还多。主要病原体导致肺炎、HIV/AIDS、腹泻、肺结核和疟疾。而且，由于洲际旅行的容易性和体量以及人类活动的扩张，随着人群分隔的屏障持续缩小，流行病的速度和风险日益增加。最近的例子包括2014年广泛传播的埃博拉爆发和2015-2016期间南非和中非的寨卡爆发。

导致肺结核(TB)的微生物结核分枝杆菌(Mtb)是分枝杆菌属内的一个物种。活动性Mtb传染是一种严重的全球性健康威胁。遗憾的是，检测活性TB病例和监测其对治疗的响应充满挑战。最为广泛使用的TB诊断方法依赖于痰液样品。

将微生物技术应用于痰液样品的方法如耐酸杆菌(AFB)涂片镜检法和Mtb培养存在灵敏度、特异性不高和/或周转时间长的问题。微生物技术的一个替代方案是基于PCR的Xpert MTB/RIF痰液测定。相比微生物技术，Xpert MTB/RIF更为快速、特异性更强，但是存在在低细菌负荷的情况下灵敏度差和不能区分活Mtb分量和非活性Mtb分量的问题。在症状改善之后，痰液样品也难以获得，并且经常在诊断方面不能用于肺外TB(EPTB)病例。在同时患有HIV和TB的患者中，诊断问题还可能被进一步放大。除了这些缺点之外，这些技术均未提供能够被用于监测治疗效果的定量结果。

存在不依赖于痰液的诊断方法，但是其并未克服上述问题中的多种问题。例如，在添加Mtb毒力抗原之后测量患者血液样品中的体外免疫应答的基于非痰液的干扰素-γ释放测试(IGRAs)在区分活性TB和潜伏性TB感染(LTBI)方面无效，并且在诊断患有EPTB或HIV/TB并发感染的患者方面表现较差。用于直接检测血液中循环的Mtb毒力抗原的方法存在灵敏度和特异性低的问题，其原因可能是宿主蛋白的表位掩蔽效应和具有几种非结核分枝杆菌(NTM)的相关抗原的同源性。