[发明专利]移相校正

权利要求书

1.一种通过核酸测序仪在碱基识别循环期间从所采集的图像数据确定校正颜色值的方法，所述核酸测序仪包括图像采集系统、一个或多个处理器、和存储器，所述方法包括：

(a)获得包含多个读取核酸碱基的位点的基板的图像，其中所述位点显示代表核酸碱基类型的颜色；

(b)从所述基板的图像测量多个位点的颜色值；

(c)将所述颜色值存储在所述测序仪的一个或多个处理器的处理器缓冲区中；

(d)检索所述多个位点的经部分相位校正的颜色值，其中所述经部分相位校正的颜色值在紧邻的前一个碱基识别循环期间存储在所述测序仪的存储器中；

(e)根据以下确定预移相校正：

在紧邻的前一个碱基识别循环期间存储的所述经部分相位校正的颜色值，和

存储在所述处理器缓冲区中的颜色值；和

(f)根据以下确定校正的颜色值：

所述处理器缓冲区中的颜色值，

在紧邻的前一个循环期间存储的部分相位校正值，和

所述预移相校正。

2.如权利要求1所述的方法，所述方法还包括使用校正的颜色值来对所述多个位点进行碱基识别。

3.如权利要求1或2所述的方法，其中，所述预移相校正包括权重，并且其中确定所述校正的颜色值包括将所述权重乘以从所述基板的图像测量的所述多个位点的颜色值。

4.如权利要求1或2所述的方法，所述方法还包括确定紧邻的后一个碱基识别循环的移相校正。

5.如权利要求4所述的方法，其中，确定紧邻的后一个碱基识别循环的移相校正包括分析：

存储在所述测序仪的存储器中的经部分相位校正的颜色值，和

存储在所述处理器缓冲区中的颜色值。

6.如权利要求4所述的方法，所述方法还包括：

通过对存储在所述测序仪的存储器中的多个位点的颜色值应用所述移相校正，从而产生紧邻的后一个碱基识别循环的经部分相位校正的颜色值；和

将紧邻的后一个碱基识别循环的所述经部分相位校正的颜色值存储在所述测序仪存储器中。

7.如权利要求6所述的方法，其中，产生紧邻的后一个碱基识别循环的部分相位校正的颜色值还包括对以下求和：

所述多个位点的移相校正的颜色值，和

来自在(b)中测量的基板的图像的多个位点的颜色值。

8.如权利要求6所述的方法，其中，存储紧邻的后一个碱基识别循环的经部分相位校正的颜色值，是将所述经部分相位校正的颜色值存储在所述测序仪的存储器的片区缓冲区中。

9.如权利要求1或2所述的方法，其中，所述方法在通过所述核酸测序仪采集序列读数期间实时进行。

10.如权利要求1或2所述的方法，其中，所述核酸测序仪在所述多个位点处合成核酸。

11.如权利要求1或2所述的方法，其中，仅从所述测序仪的两个通道确定所述颜色值。

12.如权利要求1或2所述的方法，其中，所述颜色值是从所述测序仪的四个通道获得的。

13.如权利要求1或2所述的方法，其中，所述基板包括流动池，其中所述流动池在逻辑上被分成片区，并且其中每个片区代表所述流动池的包括位点子集的一个区域，所述子集由所述图像采集系统捕获在单个图像中。

14.如权利要求13所述的方法，其中，在操作(d)中，将所述经部分相位校正的颜色值存储在所述测序仪存储器的片区缓冲区中，并且其中所述片区缓冲区被指定用于存储表示所述基板上的各个片区的图像的数据。

15.如权利要求14所述的方法，其中，所述存储器具有约512千兆字节以下的存储容量。